; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0029388 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0029388
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionLRAT domain-containing protein
Genome locationchr8:38484025..38484717
RNA-Seq ExpressionLag0029388
SyntenyLag0029388
Gene Ontology termsGO:0016746 - transferase activity, transferring acyl groups (molecular function)
InterPro domainsIPR007053 - LRAT domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_004148910.1 uncharacterized protein LOC101207610 [Cucumis sativus]5.8e-9481.11Show/hide
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XP_008463130.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501354 [Cucumis melo]3.4e-9482.03Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMS7 LRAT domain-containing protein2.8e-9481.11Show/hide
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A0A1S3CII0 uncharacterized protein LOC1035013541.6e-9482.03Show/hide
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A0A5A7VDH9 LRAT domain-containing protein1.6e-9482.03Show/hide
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A0A5D3CE73 NC domain-containing family protein2.4e-9383.02Show/hide
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A0A6J1CIS2 uncharacterized protein LOC1110119792.6e-9280.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q93V51 Protein LEAD-SENSITIVE 18.5e-5652.83Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G01225.1 NC domain-containing protein-related6.2e-5451.14Show/hide
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        PE V++RA++LLQNGFG+YN FKNNCEDFAIYCKTGLLV  T  VGRSGQAAS+ AA S ++SSP+ ++   F GLA+ G GMYC SRL  DIG+R DV 
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AT5G06370.1 NC domain-containing protein-related6.0e-5752.83Show/hide
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AT5G16330.1 NC domain-containing protein-related3.8e-5153.77Show/hide
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        Y   GI+IGD KVIHFT GGGLE G+ T LD+ V+S  P H  DNPC  C +QL   GVI SCLDCFLA G +Y+FEY V+PA F+AK R GTCT+A SD
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          + V+ RA Y LL+NGFG Y+  +NNCEDFAIYCKT LLV     +GR GQA+SV AA      SP       F   A+         +L  DIG+R D
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         +K+PVE LV R
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AT5G16360.1 NC domain-containing protein-related1.9e-5047.72Show/hide
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        Y   G+++GD KVIHFTRGGGLE G+ TVLD+ +  S P+    D  C  C DQ    GVI SCLDCFLA G L++FEY  +P+ FLAK RGGTCT+A+S
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Query:  DSPELVLHRASY-LLQNGFGMYNFFKNNCEDFAIYCKTGLLVFTTLS-VGRSGQAASVFAATSAI-----------------------------VSSPIP
        D  + V+ RA + LLQNGFG Y+   NNCEDFAIYCKTGL V +  +  G SGQA SV AA   +                             +SS + 
Subjt:  DSPELVLHRASY-LLQNGFGMYNFFKNNCEDFAIYCKTGLLVFTTLS-VGRSGQAASVFAATSAI-----------------------------VSSPIP

Query:  YLTTSFSGLALVGVGMYCVSRLCLDIGLRCDVVKIPVEQLV
        Y+     GLAL   G YC+ RL  DIG+R D  K+ VE+LV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCCTAAATAATGAATATTATCATTTTGACCTGGCTACTTATCTTACTCAAGGGATTTTTATTGGTGATGGAAAGGTGATCCACTTCACTCGAGGAGGAGGCTTGGA
GATTGGCTCAAGAACTGTATTGGATCGATTCGTTCTTAGTTCATCTCCTCATTCTCCAGACAATCCATGCCATGTATGCAGCGATCAGCTGAGAAGTGGTGTAATTTGTT
CGTGCTTGGATTGTTTTCTTGCGGCTGGTGAGCTCTACGTCTTTGAATATGGCGTCACGCCTGCATTTTTTCTCGCAAAAGCCCGTGGCGGGACTTGCACTCTTGCTGCT
TCTGATTCGCCTGAACTTGTCCTTCATCGCGCTTCTTATCTCCTCCAAAATGGCTTTGGTATGTACAACTTCTTCAAGAACAACTGTGAAGACTTTGCCATCTATTGTAA
AACAGGATTGCTTGTTTTCACCACCCTCAGCGTCGGTAGGAGCGGGCAGGCTGCATCGGTTTTTGCTGCCACAAGTGCAATCGTTTCTTCCCCAATTCCATATTTAACCA
CCAGTTTTAGTGGTCTGGCGCTTGTGGGTGTGGGTATGTATTGTGTTAGTCGATTATGTTTGGACATCGGATTGCGTTGTGATGTCGTTAAAATCCCGGTCGAGCAGCTT
GTGGATAGAGTCCGCAATAGCAATGCTCCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCCTAAATAATGAATATTATCATTTTGACCTGGCTACTTATCTTACTCAAGGGATTTTTATTGGTGATGGAAAGGTGATCCACTTCACTCGAGGAGGAGGCTTGGA
GATTGGCTCAAGAACTGTATTGGATCGATTCGTTCTTAGTTCATCTCCTCATTCTCCAGACAATCCATGCCATGTATGCAGCGATCAGCTGAGAAGTGGTGTAATTTGTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MILNNEYYHFDLATYLTQGIFIGDGKVIHFTRGGGLEIGSRTVLDRFVLSSSPHSPDNPCHVCSDQLRSGVICSCLDCFLAAGELYVFEYGVTPAFFLAKARGGTCTLAA
SDSPELVLHRASYLLQNGFGMYNFFKNNCEDFAIYCKTGLLVFTTLSVGRSGQAASVFAATSAIVSSPIPYLTTSFSGLALVGVGMYCVSRLCLDIGLRCDVVKIPVEQL
VDRVRNSNAP