; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0029391 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0029391
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionLRAT domain-containing protein
Genome locationchr8:38494479..38496970
RNA-Seq ExpressionLag0029391
SyntenyLag0029391
Gene Ontology termsGO:0016746 - transferase activity, transferring acyl groups (molecular function)
InterPro domainsIPR007053 - LRAT domain


Homology Show/hide homology
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMS7 LRAT domain-containing protein2.9e-12283.39Show/hide
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A0A1S3CII0 uncharacterized protein LOC1035013547.5e-12384.5Show/hide
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A0A5A7VDH9 LRAT domain-containing protein5.8e-12384.5Show/hide
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A0A6J1K374 uncharacterized protein LOC1114896581.0e-11982.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q93V51 Protein LEAD-SENSITIVE 14.3e-7554.9Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G01225.1 NC domain-containing protein-related1.5e-6752.78Show/hide
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        A  +A++SSP + L  S  G+A V  GMYC+SR  +DIGVR DV+K+ VE L
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AT3G02700.1 NC domain-containing protein-related4.4e-9165.86Show/hide
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        MG LSNKISR+ +KPGDHIYSWRQAYIYAHHG              I++G+G+V HFTRG G E G+GT LD  I+SSS +  DNPCP CGD+S+  GVI
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         SCL+CFLAGG+LYVFEY V+PA FLAK RGG CT+A+SD P+ V++RA++LLQNGFG+YN+FKNNCEDFAIYCKTGLLV  T  VGRSGQAAS++AA S
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         ++SSPLR++   F GLA+ G GMYC SRL SDIG+R DV K+PVE+LV
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AT5G06370.1 NC domain-containing protein-related3.1e-7654.9Show/hide
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        I SCLDCFLAGG +Y+FEY V+PA F+AK R GTCT+A SD  D V+ RA Y LL+NGFG Y+  +NNCEDFAIYCKT LLV     +GR GQA+SV AA
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              SP       F   A+         +L +DIG+R+D +K+PVE LV R
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AT5G16360.1 NC domain-containing protein-related1.2e-6951.42Show/hide
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        MG+ S+KISR+ LKPGDHIYSWR AYIY+HHG              +++GD KVIHFTRGGGLE G+GTVLD+ I  S P+    D  C  CGDQS+  G
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Query:  VICSCLDCFLAGGELYVFEYGVTPAFFLAKARGGTCTLAASDSPDLVLHRASY-LLQNGFGMYNIFKNNCEDFAIYCKTGLLVYTTLS-VGRSGQAASVL
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Subjt:  AATSAI-----------------------------VSSPLRYLTTSFSGLALVGVGMYCVSRLCSDIGVRRDVVKIPVEQLV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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