; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0029527 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0029527
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionIleal sodium/bile acid cotransporter, putative
Genome locationchr8:39828372..39828866
RNA-Seq ExpressionLag0029527
SyntenyLag0029527
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050246.1 putative Ileal sodium/bile acid cotransporter [Cucumis melo var. makuwa]4.6e-4568.63Show/hide
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        MN L S I  IN+RN  IN        LPICI MQ+  P  ++ +  N+GKTILGLTFQAVLALFI+SP+SSPPLLTHLF AAVLISFAVSFAG+FLQN 
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        FPRIA  FEK+GAL AAIGVCI++S LL+HQNFAWI WLAS FSL+ F LSF+
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KAG6579132.1 hypothetical protein SDJN03_23580, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-3564.39Show/hide
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        F+TP DCLPI  R ++QR +P      N+GK I+GLT QA+LA+FISSPSSSPPLL  LFGA + ISF +SFAG+FL+N+FP+ AR FEK+GALFAAIGV
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         II+S LL+H+N+AWI  LA  FSL+VFGLS+
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KGN49803.1 hypothetical protein Csa_004681 [Cucumis sativus]1.0e-4465.24Show/hide
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        M S+S Q S+DMN L S+I  IN+RN  IN        LPICI MQ   P  ++ +  N+G TILGLTFQAVLALFI+S +SSPPLLTHLFGAAVLISFA
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        VSF G+FLQ+ FPRIA  FEK+GAL AAIGVCI++S LL+HQNFAWI WLA  FSL+ F LSF+
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KGN49808.1 hypothetical protein Csa_004650 [Cucumis sativus]5.1e-5269.7Show/hide
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        AVSFA LFL NSFPR A  FEKVGALF+A GVC I+S LLVHQNFAWICW+A  FS++VF LSFK
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XP_022146444.1 uncharacterized protein LOC111015658 [Momordica charantia]5.7e-3573.23Show/hide
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        VLISFAVSFAGLFLQ ++PR+A  FEK
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJN8 Uncharacterized protein5.0e-4565.24Show/hide
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        VSF G+FLQ+ FPRIA  FEK+GAL AAIGVCI++S LL+HQNFAWI WLA  FSL+ F LSF+
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A0A0A0KJP2 Uncharacterized protein2.5e-5269.7Show/hide
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        AVSFA LFL NSFPR A  FEKVGALF+A GVC I+S LLVHQNFAWICW+A  FS++VF LSFK
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A0A0A0KQ03 Uncharacterized protein5.0e-2952.07Show/hide
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        MA T  H+ S+DMN L S+I  +  RN GI+        SDCLPI I+M  QRP P  +SPQ  G T L LTFQA++ LF+S +PSSS PL + LF A +
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Query:  LISFAVSFAGLFLQNSFPRIARFFEKVGALFAAIGVCIISSLLLVHQNFAWICWLASAFSLVVFGLSFK
        L SF  S+ G+ LQ  FP+ A+  +  GALFAAIG CII SLLL + NF WICWLA+   L  F +SFK
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A0A5A7U7U1 Putative Ileal sodium/bile acid cotransporter2.2e-4568.63Show/hide
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        MN L S I  IN+RN  IN        LPICI MQ+  P  ++ +  N+GKTILGLTFQAVLALFI+SP+SSPPLLTHLF AAVLISFAVSFAG+FLQN 
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Query:  FPRIARFFEKVGALFAAIGVCIISSLLLVHQNFAWICWLASAFSLVVFGLSFK
        FPRIA  FEK+GAL AAIGVCI++S LL+HQNFAWI WLAS FSL+ F LSF+
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A0A6J1CY58 uncharacterized protein LOC1110156582.7e-3573.23Show/hide
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        MAST  QTSVDMNAL+S I  IN+RN GI+ F      +TPSDCLPICIRM  QRP PA SS Q+LGKTILGLTFQAVLALFIS PSS P L T LFGAA
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        VLISFAVSFAGLFLQ ++PR+A  FEK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCAACTTCACACCAAACCTCTGTTGATATGAATGCACTTGCTTCCATTATCAATAGAATCAATCAAAGAAACAATGGAATCAACATTTTTGCCACACCATCAGA
TTGCCTTCCAATCTGCATCAGAATGCAGCAGCAGAGGCCTCAACCAGCAGCCAGCAGCCCTCAGAATCTTGGCAAGACAATTCTTGGCCTTACTTTTCAGGCAGTTTTGG
CCTTGTTCATCAGCTCACCAAGTTCATCTCCTCCACTTTTGACACATCTTTTTGGTGCTGCTGTTTTGATTAGCTTTGCAGTTTCATTTGCTGGTCTTTTCCTTCAAAAT
TCGTTCCCGAGAATCGCACGTTTCTTCGAGAAGGTCGGCGCCCTTTTCGCTGCCATTGGTGTGTGCATCATATCAAGCCTTCTTCTTGTTCATCAGAACTTTGCTTGGAT
CTGTTGGTTGGCTTCTGCCTTCTCCTTGGTTGTCTTTGGTTTATCATTCAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCAACTTCACACCAAACCTCTGTTGATATGAATGCACTTGCTTCCATTATCAATAGAATCAATCAAAGAAACAATGGAATCAACATTTTTGCCACACCATCAGA
TTGCCTTCCAATCTGCATCAGAATGCAGCAGCAGAGGCCTCAACCAGCAGCCAGCAGCCCTCAGAATCTTGGCAAGACAATTCTTGGCCTTACTTTTCAGGCAGTTTTGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASTSHQTSVDMNALASIINRINQRNNGINIFATPSDCLPICIRMQQQRPQPAASSPQNLGKTILGLTFQAVLALFISSPSSSPPLLTHLFGAAVLISFAVSFAGLFLQN
SFPRIARFFEKVGALFAAIGVCIISSLLLVHQNFAWICWLASAFSLVVFGLSFK