CuGenDBv2

Gene ID	Lag0029624
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Exocyst complex component Sec6
Genome location	chr8:40659726..40665825
RNA-Seq Expression	Lag0029624
Synteny	Lag0029624
Gene Ontology terms	GO:0006887 - exocytosis (biological process) GO:0051601 - exocyst localization (biological process) GO:0000145 - exocyst (cellular component) GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
InterPro domains	IPR010326 - Exocyst complex component EXOC3/Sec6

Homology

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KAA0031669.1 exocyst complex component SEC6 [Cucumis melo var. makuwa]

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        E         RVVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKK+TTATASSRNLTQQKLKAQGK YKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTE VFEDLK
Subjt:  E---------RVVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKKSTTATASSRNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTEHVFEDLK

Query:  AALEEART
        AALEEART
Subjt:  AALEEART

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q54BP6 Exocyst complex component 3

2.9e-14

29.67

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Query:  DAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKTINQLRENFIAIEKLCQECQTLIENHDQIKLLSNARNNLLTTLKDVEGMMSISVEAAEARDSLSDAKELINTY
        +AQ+   V  ++E+++ GLE+L  S   IN++ E+F    +LC E   LI ++  IK ++  R NL+  LK+V+ +++I  +AAE    LSD   L+  +
Subjt:  DAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKTINQLRENFIAIEKLCQECQTLIENHDQIKLLSNARNNLLTTLKDVEGMMSISVEAAEARDSLSDAKELINTY

Query:  ERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHVSNFYKLSKER---VVEMQEILDQQLAEEAAEAE
         +L  L+   + AL    S+ EE+  ++E F  V      FE  +W  VSN   +++ +   +V++ +I++++   E  + E
Subjt:  ERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHVSNFYKLSKER---VVEMQEILDQQLAEEAAEAE

Q94AI6 Exocyst complex component SEC6

2.4e-117

64.37

Show/hide

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        MMVEDLG+EAKEAAVREVAKLLPLPELLQSISSIKADYI RQQ                                                         
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Query:  ANFLPRKFSIPHLETYAYCISEFRALALKIYFDLSFLGTCVANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKTINQLRENFIAIEKLCQECQTLIENHDQIK
                                                 ANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLS SEKTI +LR+NFI+I+KLCQECQTLI+NHDQIK
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Query:  LLSNARNNLLTTLKDVEGMMSISVEAAEARDSLSDAKELINTYERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHVSNFYKLSK
        LLSNARNNL  TLKDVEGMMSISVEAA ARDSLSD KE++NTYERLTALDGKRRFALAAA    EEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLW HVSN+YKLSK
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Query:  E---------RVVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKKSTTATASSRNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTEHVFEDLK
        E         RVVEMQEILDQQLAEEAAEAEG GAMA+VANPRR  KKSTT +ASS+ L QQKLK QGK YKDKCYEQIRK VE RF++LLT  VFEDLK
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Query:  AALEEAR
        AALEEAR
Subjt:  AALEEAR

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G71820.1 SEC6

1.7e-118

64.37

Show/hide

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        MMVEDLG+EAKEAAVREVAKLLPLPELLQSISSIKADYI RQQ                                                         
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Query:  ANFLPRKFSIPHLETYAYCISEFRALALKIYFDLSFLGTCVANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKTINQLRENFIAIEKLCQECQTLIENHDQIK
                                                 ANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLS SEKTI +LR+NFI+I+KLCQECQTLI+NHDQIK
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        LLSNARNNL  TLKDVEGMMSISVEAA ARDSLSD KE++NTYERLTALDGKRRFALAAA    EEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLW HVSN+YKLSK
Subjt:  LLSNARNNLLTTLKDVEGMMSISVEAAEARDSLSDAKELINTYERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHVSNFYKLSK

Query:  E---------RVVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKKSTTATASSRNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTEHVFEDLK
        E         RVVEMQEILDQQLAEEAAEAEG GAMA+VANPRR  KKSTT +ASS+ L QQKLK QGK YKDKCYEQIRK VE RF++LLT  VFEDLK
Subjt:  E---------RVVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKKSTTATASSRNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTEHVFEDLK

Query:  AALEEAR
        AALEEAR
Subjt:  AALEEAR

AT1G71820.2 SEC6

2.1e-113

58.09

Show/hide

Query:  MMVEDLGIEAKEAAVREVAKLLPLPELLQSISSIKADYITRQQVLVFDEFLSHSSTLLILRHVPEFSLAEFLFPVFVLELWILVKKCQNVASLLIWTVIL
        MMVEDLG+EAKEAAVREVAKLLPLPELLQSISSIKADYI RQQ                                                         
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Query:  ANFLPRKFSIPHLETYAYCISEFRALALKIYFDLSFLGTCVANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKTINQLRENFIAIEKLCQECQTLIENHDQIK
                                                 ANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLS SEKTI +LR+NFI+I+KLCQECQTLI+NHDQIK
Subjt:  ANFLPRKFSIPHLETYAYCISEFRALALKIYFDLSFLGTCVANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKTINQLRENFIAIEKLCQECQTLIENHDQIK

Query:  LLSNARNNLLTTLKDVEGMMSISVEAAEARDSLSDAKELINTYERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHVSNFYKLSK
        LLSNARNNL  TLKDVEGMMSISVEAA ARDSLSD KE++NTYERLTALDGKRRFALAAA    EEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLW HVSN+YKLSK
Subjt:  LLSNARNNLLTTLKDVEGMMSISVEAAEARDSLSDAKELINTYERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHVSNFYKLSK

Query:  ER-----------------------------------------------------VVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKKSTTATASS
        ER                                                     VVEMQEILDQQLAEEAAEAEG GAMA+VANPRR  KKSTT +ASS
Subjt:  ER-----------------------------------------------------VVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATVANPRRTTKKSTTATASS

Query:  RNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTEHVFEDLKAALEEAR
        + L QQKLK QGK YKDKCYEQIRK VE RF++LLT  VFEDLKAALEEAR
Subjt:  RNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTEHVFEDLKAALEEAR

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGATGGTCGAAGATCTCGGTATCGAAGCAAAGGAAGCAGCCGTACGCGAAGTTGCCAAGCTTCTACCGCTTCCGGAGCTTCTACAGTCAATTAGTTCGATCAAGGCTGA
TTACATTACTCGTCAGCAGGTACTTGTTTTCGACGAATTTCTGTCACATTCTTCAACTCTCTTGATCCTGCGACATGTGCCTGAATTTTCTCTTGCCGAATTTTTGTTTC
CAGTTTTTGTGCTGGAGCTTTGGATCTTAGTCAAGAAATGCCAGAATGTTGCATCATTACTCATCTGGACAGTGATCCTAGCTAATTTTCTGCCGCGAAAGTTCTCAATT
CCTCACCTAGAGACTTATGCCTACTGCATTTCAGAGTTTAGAGCACTTGCACTTAAAATCTACTTCGACCTTTCATTCCTAGGAACATGTGTGGCAAATGATGCACAACT
CAGTACAATGGTTGCGGAGCAGGTTGAACAAGCACAAGCTGGACTGGAGTCGCTTTCTTTATCTGAAAAGACCATAAACCAGCTTCGAGAAAACTTTATTGCAATCGAGA
AGTTATGTCAAGAATGCCAAACATTAATAGAGAACCATGATCAGATAAAGCTCCTTAGTAATGCAAGGAATAACCTGTTAACAACTTTGAAGGATGTTGAGGGTATGATG
TCCATATCTGTTGAAGCAGCTGAGGCCCGTGATTCTTTGAGTGATGCTAAAGAGCTTATAAACACTTATGAGAGGCTAACTGCACTCGATGGAAAACGAAGGTTTGCTTT
AGCAGCTGCAGCATCTCACAAAGAAGAGGTTGGAAGACTAAGAGAATATTTTGAAGATGTAGATCGAACGTGGGAAACATTTGAGAAGACGTTATGGGAACATGTATCCA
ACTTTTATAAACTTTCTAAAGAGAGAGTTGTTGAAATGCAAGAAATTCTGGATCAACAACTTGCTGAGGAAGCAGCTGAGGCTGAGGGAGGTGGTGCAATGGCAACTGTA
GCAAACCCTCGCAGAACCACAAAAAAATCCACCACAGCAACAGCTTCTTCTAGAAACCTAACACAACAAAAATTGAAGGCTCAGGGGAAAGCATACAAAGATAAATGCTA
CGAGCAAATAAGGAAGACTGTTGAAGGAAGGTTTAGTAAACTTTTGACGGAGCATGTTTTTGAGGACCTGAAGGCAGCTTTAGAGGAAGCTCGAACGGAAGTGATTCAGA
ATGACTGGAAAGAAATATCTGAGTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MMVEDLGIEAKEAAVREVAKLLPLPELLQSISSIKADYITRQQVLVFDEFLSHSSTLLILRHVPEFSLAEFLFPVFVLELWILVKKCQNVASLLIWTVILANFLPRKFSI
PHLETYAYCISEFRALALKIYFDLSFLGTCVANDAQLSTMVAEQVEQAQAGLESLSLSEKTINQLRENFIAIEKLCQECQTLIENHDQIKLLSNARNNLLTTLKDVEGMM
SISVEAAEARDSLSDAKELINTYERLTALDGKRRFALAAAASHKEEVGRLREYFEDVDRTWETFEKTLWEHVSNFYKLSKERVVEMQEILDQQLAEEAAEAEGGGAMATV
ANPRRTTKKSTTATASSRNLTQQKLKAQGKAYKDKCYEQIRKTVEGRFSKLLTEHVFEDLKAALEEARTEVIQNDWKEISE

Lag0029624 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome