; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0029657 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0029657
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationchr8:40924666..40930447
RNA-Seq ExpressionLag0029657
SyntenyLag0029657
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022134271.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Momordica charantia]3.5e-17294.35Show/hide
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XP_023550435.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-16791.39Show/hide
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A0A0A0KE83 Uncharacterized protein4.9e-16489.22Show/hide
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A0A1S3C3P2 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X16.4e-16489.79Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.7e-17294.35Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.6e-16791.69Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic3.1e-16691.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D2WKD9 Farnesol dehydrogenase1.1e-1932.99Show/hide
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic2.0e-5346.36Show/hide
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          SPGMV TDLL+SG++ +  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      I +LT
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic2.5e-12578.32Show/hide
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Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic3.7e-13282.56Show/hide
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        KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+
Subjt:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR

Query:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPINGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS
        MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFS
Subjt:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPINGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS

Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic3.0e-4943.6Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPING
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPING

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10310.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.4e-1531.19Show/hide
Query:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP
        +V    VLITG +KG+G ALA +  K G  V+ C+RS E++ +    L       H+  T  DV+    V+ +   + +     DI +NNAG+   + K 
Subjt:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP

Query:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL
        + E S ED   V+ TN  G+    R  I +ML + +G  +    G G  G      A Y A+K ++  L++++  E+    V+ + V  L+PG++ T+LL
Subjt:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL

Query:  MS
         S
Subjt:  MS

AT1G24360.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein9.3e-1429.25Show/hide
Query:  EVFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSVERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNA
        EV Q+ E  V    V+ITG+++GIG A+A    KAG  V++  +RS +  E   + + E  G+   +G   DV +  DV  ++         ID+ +NNA
Subjt:  EVFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSVERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNA

Query:  GSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVV
        G    +   L+        EV+  N  G+ +C + A+K+M+ + R G I NI       G+ G+     A Y A K  V+  +K+   E      +N+ V
Subjt:  GSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVV

Query:  HNLSPGMVTTDL
        + + PG + +D+
Subjt:  HNLSPGMVTTDL

AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein2.1e-5043.6Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPING
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPING

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein9.8e-4842.8Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITG  +G+G ALA++FL +GD V++ SRS E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPING
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPING

AT5G04900.1 NYC1-like2.6e-13382.56Show/hide
Query:  RNGGVNSNSASIKAEVFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ
        +N  V  +SA+++A +  +REPM PPYN+LITGSTKGIGYALA++FLKAGDNVVICSRS ERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LV + Q
Subjt:  RNGGVNSNSASIKAEVFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSVERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ

Query:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR
        KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+
Subjt:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR

Query:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPINGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS
        MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFS
Subjt:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPINGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCATCTTCTTCTTCTTCCCTCCTTTTTCCTTCCCCGTTCTTCTCCCGTAACCATGGCTTCTTCTCCTCTCCTCCTTCCGGACTACGCTTTTCAATCTGCAAATC
GGAGAGTTACAGTCTTTCTATAGGCCGTTCGCGCGAGGCATCCAACATTCCGAGGAATGGCGGTGTGAATTCGAATTCTGCATCCATAAAGGCCGAAGTATTTCAGCAGA
GGGAGCCCATGGTTCCTCCTTATAACGTTTTGATCACCGGCTCTACAAAAGGAATAGGATATGCGTTGGCCAAACAGTTTCTGAAAGCAGGTGACAATGTTGTAATCTGT
TCACGATCAGTTGAGAGAGTAGAGTCTTCTGTTCAAAGCCTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGTGCGAGAAGGAGAGGATGTAAA
GAATTTAGTCACATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATACATTGACATTTGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTCGAGGCTTCAGATGAAG
ATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTCAACATTGAC
GGGGCTGGTTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCCGCATATGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTTCATTTAACGAAGTCATTACAGGCTGAATTACGGATGCAGGA
TGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACGAAGCAGGCGAAATTTTTTATCAACGTTTTGGCGG
AACCACCTGAAGTGGTCGCAGAATACCTTGTCCCAAACATAAGATCTATCCCAATCAATGGTTCAACAAGGCCCACGTACATCCGTTTCCTCACTGGACTAAAAGCTTAT
TCTCAGATATTCTCAGTTGAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCATCTTCTTCTTCTTCCCTCCTTTTTCCTTCCCCGTTCTTCTCCCGTAACCATGGCTTCTTCTCCTCTCCTCCTTCCGGACTACGCTTTTCAATCTGCAAATC
GGAGAGTTACAGTCTTTCTATAGGCCGTTCGCGCGAGGCATCCAACATTCCGAGGAATGGCGGTGTGAATTCGAATTCTGCATCCATAAAGGCCGAAGTATTTCAGCAGA
GGGAGCCCATGGTTCCTCCTTATAACGTTTTGATCACCGGCTCTACAAAAGGAATAGGATATGCGTTGGCCAAACAGTTTCTGAAAGCAGGTGACAATGTTGTAATCTGT
TCACGATCAGTTGAGAGAGTAGAGTCTTCTGTTCAAAGCCTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGTGCGAGAAGGAGAGGATGTAAA
GAATTTAGTCACATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATACATTGACATTTGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTTTGGTCGAGGCTTCAGATGAAG
ATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTCAACATTGAC
GGGGCTGGTTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCCGCATATGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTTCATTTAACGAAGTCATTACAGGCTGAATTACGGATGCAGGA
TGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACGAAGCAGGCGAAATTTTTTATCAACGTTTTGGCGG
AACCACCTGAAGTGGTCGCAGAATACCTTGTCCCAAACATAAGATCTATCCCAATCAATGGTTCAACAAGGCCCACGTACATCCGTTTCCTCACTGGACTAAAAGCTTAT
TCTCAGATATTCTCAGTTGAGAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSSSSSLLFPSPFFSRNHGFFSSPPSGLRFSICKSESYSLSIGRSREASNIPRNGGVNSNSASIKAEVFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVIC
SRSVERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNID
GAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPINGSTRPTYIRFLTGLKAY
SQIFSVEK