; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0029712 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0029712
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationchr8:41391728..41392033
RNA-Seq ExpressionLag0029712
SyntenyLag0029712
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-4694.06Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-4694.06Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein6.4e-4387.13Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial9.9e-4488.12Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S149.9e-4488.12Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067332.7e-4999.01Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449965.6e-4795.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.9e-3673.47Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.3e-3773.47Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.9e-3170.21Show/hide
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        I DH RR L AK+ELKR  YKAIC D +LPN +R E  +KLSKLPRNSS TR+RNRCIFTGRPR+VY+LFR+SRIVFR+LASKG ++G+ KS W
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.3e-2056.52Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.4e-3470.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S142.0e-3670.71Show/hide
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S142.3e-0840Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAATGATGTGCGTGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAATAGTTCGTTCACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGTCGACCTAGGGCTGTCT
ACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATTGTTTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGTGTCAAGAAATCTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGGGGACAAGCGGAACATTCTTGACCACTATCGCCGACAGCTTGCTGCGAAGTTTGAGTTGAAGCGGAAGCTGTACAAAGCCATTTGCAATGATCCGAGTCTTCC
CAATGATGTGCGTGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAATAGTTCGTTCACTCGACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACCGGTCGACCTAGGGCTGTCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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