CuGenDBv2

Gene ID	Lag0029847
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Chlorophyll A-B binding protein
Genome location	chr8:42586989..42587543
RNA-Seq Expression	Lag0029847
Synteny	Lag0029847
Gene Ontology terms	GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]

1.9e-79

87.57

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES+ +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQ+YFVAAVAA+Y+KYEKEKVSVWP DE+K+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

XP_008463533.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501667 [Cucumis melo]

5.5e-79

87.03

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES+ +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQ+YFVAAV A+Y+KYEKEKVSVWP DE+K+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]

2.0e-81

88.71

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL   SNSK HK KPLTFVTRAADPE+ AADPEPG DGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIA+LGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ+YFVAAVAA+YVK+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

9.4e-79

88.04

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLA  SNSK HKPK LTFVTRAADPES AAD EP  DGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGSTAAASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ+YFVAA AALY+KYEKEKVSVWP DE+K+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]

2.9e-80

90.22

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSL L       KPK LTFVTRAADPES AAD E G DGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAA SSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ+YFVAAVAALY+KYEKEKVSVWPPDE+KN
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KS45 Uncharacterized protein

3.8e-78

87.03

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSK  KPK LTF+TRAADPES A D E PG DGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST AASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQ+YFVAAVAA+Y+KYEKEKVSVWP DE+K+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC103501667

2.7e-79

87.03

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES+ +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQ+YFVAAV A+Y+KYEKEKVSVWP DE+K+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein

9.1e-80

87.57

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES+ +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQ+YFVAAVAA+Y+KYEKEKVSVWP DE+K+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC111006119

9.7e-82

88.71

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL   SNSK HK KPLTFVTRAADPE+ AADPEPG DGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIA+LGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ+YFVAAVAA+YVK+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC111489022

8.5e-78

87.5

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLAL SNSK HKPK LTFV RAADPES AAD EP  DGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGSTAAASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIA+LG+ ALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ YFVAA AALY+KYEKEKVSVWP DE+K+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G12345.1 unknown protein

1.4e-48

64.19

Show/hide

Query:  TRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISAL
        T    P+      E G D D FE RL+ +RLRYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKEAVSGGLKVE GFSP+SERING IA LG++AL
Subjt:  TRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAMLGISAL

Query:  VLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPD
        +LVELATGK V+NYHTP+++ +Q+YFVAAV+A++VK EKEKVSVWP D
Subjt:  VLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCTCTGCAATTCCCTAATTCTCTCGCACTCATTTCCAATTCAAAGTCTCACAAGCCGAAGCCACTCACCTTCGTAACCAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCCTCTGCTGCCGATCCAGAGCCTGGACCGGACGGCGACGACTTCGAGGACCGACTGGCTAAGGTCCGACTCCGATACCGAAGCGGAACCGGAAAAAAGGCAG
AAATACGAAAGGCACGGAAGTCCAAGAAAGGATCCACCGCCGCCGCCTCCTCGGTGTACCTCCCGCCGGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTCTCCGGCGGCCTGAAGGTGGAA
TTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGATGGATTGCGATGCTCGGAATATCGGCTCTGGTTCTGGTGGAATTGGCCACCGGAAAAGGCGTCATCAATTACCA
CACGCCGGCGATTATACTGATTCAGATGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTGTATGTCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCCGGATGAACTTAAGA
ATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESSAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVE
FGFSPYSERINGWIAMLGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQMYFVAAVAALYVKYEKEKVSVWPPDELKN

Lag0029847 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome