; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0030236 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0030236
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr8:45676853..45677530
RNA-Seq ExpressionLag0030236
SyntenyLag0030236
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]7.4e-8683.33Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]1.9e-8683.04Show/hide
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]7.4e-8683.55Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]1.5e-7877.73Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]3.0e-8783.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein9.4e-8783.04Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein3.6e-8683.55Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein3.6e-8683.55Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein7.2e-7977.73Show/hide
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A0A6J1HHB7 uncharacterized protein LOC1114629251.2e-7372.57Show/hide
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        IFPR T                     L+S+S+S SSSCSSPSPFVRPKFFKR RR SLDS SLP EYN +DNDG+EA GSSNSPTSTL +GG S R S 
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein1.1e-0534.48Show/hide
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        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ S+ + P   PLTPPPSY+ +S S++K              ++P+K+ T  S   S   S  SS A
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Query:  SWSSSRSSSCSSPSPFVRPKFFKRCRRSLDSPSLPFEYNFDDNDGDEAAGSSNSPTSTLCFGGSSSRASLFRGC
          SSS SSS S PS  +R       RRS+   S           G      SNS  S+ C+  +S    L R C
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AT2G40475.1 unknown protein5.4e-1841.47Show/hide
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        K +     +G+ +  +  + +S  NSS R+YY G A ++PF WE+RPGTPKH  FSE+  +PPLTPPPSYYSSS S+    SK  T+  + F +    + 
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Query:  RTSSSFSFSSGSSSSSSLASWSSSRSSSCSSPSPFV-RPKFFKRCRRSLDSPSLPFEYNFDDNDGDEAAGSSNSPTSTLCF--GGSSSRASLFRGCYQLV
         +  SFS+SS SSSSSS  S+SSS     S PS    RP+    C RS         Y  +D   DE    S+SPTSTLC+  G SSS  S+        
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Query:  SVKNALLSIVGHGSASR
          K AL S++ HGS+ +
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AT3G56260.2 unknown protein1.6e-0942.35Show/hide
Query:  YYGGAAGAIPFRWESRPGTPK-HTFSETSIP-PLTPPPSYYSSS-HSTSKSSSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSSSFSFSSGSSSSSSLASWSSSRSSSCS
        YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  S++S+P PLTPPPSYYSS   ST ++ SK     S F   +       S+      +SSS    SWSS+ SSS  
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Query:  SPSPFVRPKFFKRCRRSLDSPSLPFEYNFDDNDGDEAAGSSNSPTSTLC------FGGSSSRASLFRGCY
        S SP   P   K+ R S D  S     N+++++        +SPTSTLC       G SSS  S+ R  +
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AT5G01790.1 unknown protein5.8e-1261.29Show/hide
Query:  SAANSSFRV-YYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSE-TSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKSSSK
        SAA  SFR+ YY GAAGA+PF WES PGTPKH  SE  ++PPLTPPPS++S S    +  SK
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCCTCGTCCTTCTCCTTCTCCTCTGGCTCCTCCTCCTCTTCGTCCTTGGCGTCGTGGTCGTCCTCTCGCTCGTCGTCGTGTTCGTCGCCATCGCCTTTCGTGAGACCGAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SRGTV