; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0030323 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0030323
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationchr8:46376506..46379856
RNA-Seq ExpressionLag0030323
SyntenyLag0030323
Gene Ontology termsGO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602651.1 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-10191.74Show/hide
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XP_022991097.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita maxima]2.0e-10292.2Show/hide
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XP_023552471.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-10292.2Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X14.0e-10191.74Show/hide
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A0A6J1GU31 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X11.4e-10191.28Show/hide
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A0A6J1GWM1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X24.7e-10291.74Show/hide
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A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X29.5e-10392.2Show/hide
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A0A6J1JPS6 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X12.8e-10291.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr323.6e-1443.65Show/hide
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        L G+DFSGK+L    F  + L  +NF  A L GA F  + L GADL  ADL      L +   A+L+NA L  A+    T F  + I GADF+   L   
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        + + LC  ADGVNP TG +TRE+L C
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O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic8.6e-7771.56Show/hide
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        L N SL  C +IS+ P          H P+  S  +    +V+  PL   R++V S+GE  SK S  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDL+
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        GKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR
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P73709 Uncharacterized protein slr18192.7e-0637.07Show/hide
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        G DL G D SG TL         ++Q+ K        +IL +A+ +GA + G     ADL+ A+L +A+LR  D     + KA+LS ANL+GAL T + +
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Query:  FRGSTINGADFTDVPL
          G+ +NGAD  +  L
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Q8H1Q1 Thylakoid lumenal protein TL20.3, chloroplastic8.5e-0829.41Show/hide
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        S ++ L M  L+ S   SS+SR P      L   +  SS + +  +    +R    S  ES +    L+   A+  +A     PA+A    F+    G +
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        G G        DL+    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+ I 
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        GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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Q9SE95 FH protein interacting protein FIP24.2e-0737.84Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A  
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Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.1 Pentapeptide repeat-containing protein6.1e-0929.41Show/hide
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        S ++ L M  L+ S   SS+SR P      L   +  SS + +  +    +R    S  ES +    L+   A+  +A     PA+A    F+    G +
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        G G        DL+    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+ I 
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        GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein2.1e-0931.71Show/hide
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        AS +   A+   + F AD    F  G     G     DL+    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + 
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Query:  KANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGADFTDVPLREDQREYLCKVADGVNPTTGNATRETLLC
        +ANL+NA L  ++ T  +   G+ I GADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein6.0e-5768.09Show/hide
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        L N SL  C +IS+ P          H P+  S  +    +V+  PL   R++V S+GE  SK S  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDL+
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Query:  GKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGSTINGA
        GKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA
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AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein6.1e-7871.56Show/hide
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        L N SL  C +IS+ P          H P+  S  +    +V+  PL   R++V S+GE  SK S  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDL+
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        GKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GADFTDVPLR+DQR
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         YLCKVADGVN TTGNATR+TLLCN
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AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein3.0e-0837.84Show/hide
Query:  RGQDLTGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTINGADF
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A  
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Query:  TDVPLREDQRE
          V LRE   E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTTCCCTATAATGGGGCGTTGTTCAAGCGCAGCGGCCACCACAGCCGGAGCTGAAGACCCTGTTCCGCCTGCTGTCTTCACGCGCCGCCCACGAATCCCACATAATTCTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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