; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0030418 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0030418
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionTrinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein
Genome locationchr8:47093648..47094280
RNA-Seq ExpressionLag0030418
SyntenyLag0030418
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007789 - Protein of unknown function DUF688


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAG7033401.1 hypothetical protein SDJN02_07457, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-8083.41Show/hide
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XP_023528120.1 uncharacterized protein LOC111791129 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.3e-8082.24Show/hide
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XP_038885392.1 uncharacterized protein LOC120075791 [Benincasa hispida]2.3e-8181.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B2H5 uncharacterized protein LOC1034854234.5e-7577.1Show/hide
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A0A5D3C8I6 Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein-like protein4.5e-7577.1Show/hide
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A0A6J1DE38 uncharacterized protein LOC1110202112.7e-7580.1Show/hide
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A0A6J1GNZ5 uncharacterized protein LOC1114561372.1e-8083.02Show/hide
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A0A6J1JTM6 uncharacterized protein LOC1114877391.0e-7982.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22680.1 unknown protein8.9e-1538.39Show/hide
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        +RR++S  FSS+   S+  S SSSS  S  F  +SP      ATP+      IPFSWE LPG PK+ S  R        L++LLPLPP+ +    + R  
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            +K+    + RDPF  A +ECSK               A  + E         GG + K + +S S   G LNLYSSC+R C VSESIVYLP++  +
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        S+D L+  T G
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AT1G71970.1 unknown protein1.2e-1941.75Show/hide
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        SSRR+ S SSS SS SS SSS  S  FP DSPL+  + ATP+R     +PFSWE LPG PK  S     R +      LLPLPP  N + P + K+   +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GGCCGCCGACCTCTGGAGCAGCGCCGGCGGCGGCAATGGCAAGGCGGTTTCGAGAAGCCTGAGCGACCGATTCGGATTCCTGAATCTGTACTCTTCTTGCAAACGAACCT
GCGGCGTTTCGGAATCCATAGTGTATCTTCCGAGAACGCAGAGGAGTTCGTTCGATCTGCTAAACCACCGCACCGGCGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTCAATCTTCTCGCCGGACTCATTCCTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCCCTTTCTTCTTCCTCCTCCTCTCGCGGTTCTTACTATTTTCCCGATGACTCTCCGCTCTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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