; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0030744 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0030744
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionsirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic
Genome locationchr11:994874..999409
RNA-Seq ExpressionLag0030744
SyntenyLag0030744
Gene Ontology termsGO:0006979 - response to oxidative stress (biological process)
GO:0019354 - siroheme biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051266 - sirohydrochlorin ferrochelatase activity (molecular function)
GO:0051536 - iron-sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002762 - Sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037556.1 sirohydrochlorin ferrochelatase [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-9188.21Show/hide
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KAG7033101.1 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-9283.08Show/hide
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XP_008458790.1 PREDICTED: sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic [Cucumis melo]1.8e-9188.21Show/hide
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XP_023551685.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-9187.82Show/hide
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XP_038890885.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]1.4e-9491.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C8S9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic8.9e-9288.21Show/hide
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A0A5D3BY55 Sirohydrochlorin ferrochelatase8.9e-9288.21Show/hide
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A0A6J1BYW9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic5.8e-9186.46Show/hide
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A0A6J1FHT5 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like5.8e-9187.31Show/hide
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A0A6J1K384 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like2.0e-9187.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6UWT5 Sirohydrochlorin cobaltochelatase2.5e-1128.99Show/hide
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                       G+  I   P+G  +++VD+V DR
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P61817 Sirohydrochlorin ferrochelatase3.4e-1635.34Show/hide
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         G+ E++VD++ +RIN
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P61819 Sirohydrochlorin cobaltochelatase2.1e-1329.08Show/hide
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                        G+  +   P+G  ++++D+V DR N
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Q58380 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.3e-1232.61Show/hide
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                        +  I   P+G  +++VD++ DR
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Q84JH7 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic6.4e-6376.03Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50170.1 sirohydrochlorin ferrochelatase B4.5e-6476.03Show/hide
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        SY+ITAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G ADEC VCAGT KC+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTTGGTCAATGAAACCTACAGTGCACATGTATTATCCCTTAGGAATCAGCCATCGGCCAAACCGTTCTCCTCCATCTCCGACTGTCTTCTCCGGCAACAACAAAAC
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GTCCCTCAGCAGGCGAAACTAGGACATTCACAATCAGCGCATCTCAGAAATCTCCGATCCTGATCGGACGACCGTCGAGATTCAGGAATTTCACTTTGCGGTTCTGCATG
AGTGTCGATAATGGAAGCCCTAATCGGAGCCGAGATCAGATTGGTGCCGGAGATGCCGTCATCATCGTCGACCATGGCTCTCGCCGTCGGGAATCTAATCTGATGTTGAA
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TCATATATAATAACTGCTCCTCTTGGTCTTCATGAACAACTAGTGGATGTTGTGAATGATAGAATAAATCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGATGAATGTGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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