; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0030957 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0030957
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionribonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationchr11:3241981..3242970
RNA-Seq ExpressionLag0030957
SyntenyLag0030957
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0004748 - ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000358 - Ribonucleotide reductase small subunit family
IPR009078 - Ferritin-like superfamily
IPR012348 - Ribonucleotide reductase-like
IPR030475 - Ribonucleotide reductase small subunit, acitve site
IPR033909 - Ribonucleotide reductase small subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581100.1 hypothetical protein SDJN03_21102, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-18496.96Show/hide
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XP_022984134.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucurbita maxima]3.6e-18296.05Show/hide
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A0A0A0L8R8 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain5.1e-18295.14Show/hide
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A0A1S3TQ45 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain7.9e-17590.58Show/hide
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A0A6J1F5K5 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain8.4e-18596.96Show/hide
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A0A6J1J9K8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.8e-18296.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B7.6e-15981.08Show/hide
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.8e-16986.93Show/hide
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P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A1.4e-14175Show/hide
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        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKAEASFWTAEEVDLS D++ WE+LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQIA+
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Query:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGDY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V +IV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRLL  LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVG+Y
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Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFRMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFRMDEDF

P79733 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M25.5e-13371.34Show/hide
Query:  AIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQ
        A+ +EPLL  NP RF +FPIQY  IW+MYKKAEASFWTAEEVDLS+DL+HW+SL  +E++FI+HVLAFFAASDGIV ENL  RF +EVQV EAR FYGFQ
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Query:  IAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWI-DSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD
        IA+ENIHSEMYSLL++TYIKDS E+  LF AIET+PCVKKKADWAL WI D    + ER++AFA VEGIFFSGSF SIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRD
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Query:  EGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKR
        EGLHCDFACL++  L  K SE+ VK+I+  AV+IE+EF+ DALPV L+GMN DLM QYIEFVADRLL  LG+ KVY V+NPFD+ME ISL+GKTNFFEKR
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Query:  VGDYQKASVMSNLNGNGGIHEFRMDEDF
        VG+YQ+  VMS    N     F +D DF
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Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C3.3e-16283.73Show/hide
Query:  MPAIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWE-SLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY
        MP++P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R WE SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+EARAFY
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Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E+  LFRAIET+PCV KKA WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
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Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE+RVK IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVY V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGDYQKASVMSNLNGNGGI--HEFRMDEDF
        KRVGDYQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A1.0e-14275Show/hide
Query:  DEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQIAI
        +EPLL     RF MFPI+Y  IWEMYKKAEASFWTAEEVDLS D++ WE+LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQIA+
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Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK RLF AIET+PC+ KKA W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
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Query:  CDFACLLYSLLRKKLSEDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGDY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V +IV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRLL  LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVG+Y
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Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFRMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFRMDEDF

AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein2.3e-16383.73Show/hide
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        MP++P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R WE SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+EARAFY
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Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E+  LFRAIET+PCV KKA WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
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Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSEDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLSE+RVK IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVY V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGDYQKASVMSNLNGNGGI--HEFRMDEDF
        KRVGDYQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTGCAATTCCCGACGAGCCTCTCCTCGCCCCCAACCCCGACCGCTTCTGCATGTTCCCAATTCAGTACCCCCAAATCTGGGAAATGTACAAGAAGGCCGAAGCCTC
CTTCTGGACCGCCGAGGAAGTCGATCTCTCTCAGGATCTCCGCCACTGGGAATCCCTAACTTCCGACGAGAAGCACTTCATCACTCACGTTCTCGCCTTCTTCGCCGCCT
CCGACGGCATCGTTTTGGAGAATCTCGCCGGACGGTTCATGAAGGAGGTCCAAGTCGCCGAGGCCAGAGCCTTCTATGGATTCCAGATCGCCATCGAGAATATCCACTCC
GAGATGTACAGTCTTCTCCTTGAAACCTACATCAAAGACTCGAACGAGAAGAGTCGTTTGTTTCGCGCCATTGAGACTGTCCCCTGCGTCAAGAAGAAGGCCGATTGGGC
GTTGAAATGGATCGACAGCACCGAGTCGTTTGCCGAGCGAATTCTGGCCTTCGCCTGCGTCGAGGGGATCTTCTTCTCAGGTAGCTTCTGCTCCATTTTCTGGTTGAAAA
AACGTGGATTAATGCCTGGACTCACCTTCTCGAACGAGTTGATTTCGCGAGACGAGGGGCTCCATTGTGATTTCGCTTGTTTGTTGTATTCGTTGTTGAGGAAGAAGTTG
AGCGAGGACCGAGTGAAGGAGATTGTTCGTGAGGCTGTAGATATAGAGAGAGAATTCGTTTGTGATGCTTTGCCGGTGGCTCTTGTCGGAATGAATGGTGATTTGATGAG
CCAGTATATTGAATTTGTGGCGGATAGATTGCTCGGAGCTTTAGGGTATGGGAAAGTCTACAATGTTCAAAATCCATTCGATTGGATGGAACTGATTTCCTTGCAGGGGA
AAACAAATTTCTTCGAGAAGAGAGTTGGGGATTATCAGAAGGCGTCTGTGATGTCAAATCTTAATGGAAATGGGGGAATCCATGAGTTTAGGATGGATGAAGATTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPAIPDEPLLAPNPDRFCMFPIQYPQIWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTSDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQIAIENIHS
EMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVKKKADWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLLRKKL
SEDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYGKVYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGDYQKASVMSNLNGNGGIHEFRMDEDF