CuGenDBv2

Gene ID	Lag0031259
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	30S ribosomal protein S15, chloroplastic
Genome location	chr11:6368750..6371536
RNA-Seq Expression	Lag0031259
Synteny	Lag0031259
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domains	IPR000589 - Ribosomal protein S15 IPR005290 - Ribosomal protein S15, bacterial-type IPR009068 - S15/NS1, RNA-binding

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6606822.1 Thymidylate kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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A0A1S3BXJ5 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

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A0A5A7TSB7 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

1.3e-183

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A0A6J1DD15 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

4.3e-187

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A0A6J1G9E3 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

1.4e-209

84.75

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A0A6J1K776 30S ribosomal protein S15, chloroplastic

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Query:  LEKIRENLAEFRPRSSVPPPSELGSTPSSSAPSSWPRGISFQELSQRNAMRKGEDGNAPADSTKGGRSGTLAFDAIRDSLRKMNSSGAMQNERKGGDPMS
        LE+IR+NL+EFR RSSVPPPSELG TP SSA SSW RGISFQEL +RNAMRKG+DG+AP    + GRSG L+FD+IR+SLR+++SS AMQNERK GD MS
Subjt:  LEKIRENLAEFRPRSSVPPPSELGSTPSSSAPSSWPRGISFQELSQRNAMRKGEDGNAPADSTKGGRSGTLAFDAIRDSLRKMNSSGAMQNERKGGDPMS

Query:  LSEFKTSLKLKPSDPSSTPVVGGTDRLPASVFGKEMRDRKDGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDKGKGKNWFSLTELNERLMKLREMEEKETES
        LS FK SLKLKP DP+ST V GGT+RLPASVFGKEM DRK GENEGMKTEFVKMYSHGELG+KLRALRP+K KGKNWFSLTELNERLMKLR MEEKETES
Subjt:  LSEFKTSLKLKPSDPSSTPVVGGTDRLPASVFGKEMRDRKDGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDKGKGKNWFSLTELNERLMKLREMEEKETES

Query:  RIGGILYQDLRASLITIQMSGDEKAKKTTIQRLDILGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTT
        +IGGI +QDLR SL+ ++MS DEKAKKTTIQRLDILGQLGRTPN+MLQPP+EHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVR+EFKMSESDCGSARVQVAQLTT
Subjt:  RIGGILYQDLRASLITIQMSGDEKAKKTTIQRLDILGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTT

Query:  KINHLTGVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLRDNPDYKN
        KINHLT VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYC+VLNKLG RDNPDYKN
Subjt:  KINHLTGVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLRDNPDYKN

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A1JIX2 30S ribosomal protein S15

4.7e-13

52.5

Show/hide

Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTGVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR
        AK+  +F    +D GS+ VQVA LT +INHL G    HKKD HS++GLL MV  R+KLL YL+R D  SY  ++ +LGLR
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTGVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR

A6TEI4 30S ribosomal protein S15

1.2e-13

53.75

Show/hide

Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTG--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR
        AK+  EF   E+D GS  VQVA LT +INHL G    HKKD HS++GLL MV  R+KLL YL+R D   Y  ++ +LGLR
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTG--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR

A8F724 30S ribosomal protein S15

4.7e-13

51.22

Show/hide

Query:  ELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTGVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR
        E  K+ ++F+++E D GSA VQVA LT +I HLT  L  H KD HS++GL+ MV  R+KLL+YLR+++ ESY  ++ KL LR
Subjt:  ELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTGVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR

B0THS1 30S ribosomal protein S15

4.7e-13

Show/hide

Query:  EFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTGVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR
        +FK  E D GS  VQ+A LT +IN+LTG L  HKKD HS++GLL MV  R+ LL YL+RTD E Y  ++ +LGLR
Subjt:  EFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTGVL--HKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR

B5XSX7 30S ribosomal protein S15

9.4e-14

53.75

Show/hide

Query:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTG--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR
        AK+  EF   E+D GS  VQVA LT +INHL G    HKKD HS++GLL MV  R+KLL YL+R D   Y  ++ +LGLR
Subjt:  AKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTG--VLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLR

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G15810.1 S15/NS1, RNA-binding protein

2.2e-79

44.9

Show/hide

Query:  MALQLSLRPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDPADTSSSASTGSAQSPM-SSYFSDVKARLKQQQQSPSPPTARKPSYPFTSIPNRSSSPALTSA
        MAL L+ R  + +  +N SLI  F SNSS+ S P    A     + + S+ SP  SS   D+K  LK + Q+      RK   PF     +S +   TS 
Subjt:  MALQLSLRPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDPADTSSSASTGSAQSPM-SSYFSDVKARLKQQQQSPSPPTARKPSYPFTSIPNRSSSPALTSA

Query:  SLEKIRENLAEFRPRSSVPPPSELGSTPSSSAPSSWPRGISFQELSQRNAMRKGEDGNAPADSTKGGRSGTLAFDAIRDSLRKMNSSGAMQNERKGGDPM
        S + + +NLA+F+ RS+VPPP + G           P  IS   L +++A     D   P +S   G +     + +++   ++N+S  M   ++GG   
Subjt:  SLEKIRENLAEFRPRSSVPPPSELGSTPSSSAPSSWPRGISFQELSQRNAMRKGEDGNAPADSTKGGRSGTLAFDAIRDSLRKMNSSGAMQNERKGGDPM

Query:  SLSEFKTSLKLKPSDPSSTPVVGGTDRLPASVFGKEMRDRK--DGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDKGKGKNWFSLTELNERLMKLREMEEKE
         L  FK+++                + LP  +F  +M + K  +GE E   TEF+  Y+  ELG KLR LRP+  K + WFSL ELN+RL+KLR++EEKE
Subjt:  SLSEFKTSLKLKPSDPSSTPVVGGTDRLPASVFGKEMRDRK--DGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDKGKGKNWFSLTELNERLMKLREMEEKE

Query:  TESRIGGILYQDLRASLITIQMSGDEKAKKTTIQRLDILGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQ
         + R     +  LR  + + +   +E ++ ++ Q + I+G LG  P Y L PPKE LV+ YFHPDNMSSAEK+KIEL+KVR+EFKMSESDCGSARVQVAQ
Subjt:  TESRIGGILYQDLRASLITIQMSGDEKAKKTTIQRLDILGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQ

Query:  LTTKINHLTGVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLRDNPDYK
        LTTKI HL+  LHKKDKHS+KGLL MVQ RKKLLKYLRRTDW+SYCLVL+KL LRDNPDYK
Subjt:  LTTKINHLTGVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLRDNPDYK

AT1G80620.1 S15/NS1, RNA-binding protein

5.5e-86

45.77

Show/hide

Query:  MALQLSLRPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDPADTSSSASTGSAQSPMSSYFSDVKARLKQQQQSPSPPTARKPSYPFTSIPNRSSSPALTSAS
        MAL L+ RPK  +  +NPSLIHLFS++SS+ S    D  +++   S  S+   +SSYFS +++ LKQ Q        ++    F + P  S S       
Subjt:  MALQLSLRPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDPADTSSSASTGSAQSPMSSYFSDVKARLKQQQQSPSPPTARKPSYPFTSIPNRSSSPALTSAS

Query:  LEKIRENLAEFRPRSSVPPPSELGSTPSSSAPSSWPRGISFQELSQRNAMRKGEDGNAPADSTKGG--RSGTLAFDAIRDSLRKMNSSGAMQNERKGGDP
         + IR NL EFR R++ PPP ++                  Q+L ++N + K            GG  R   +    I+ +LR+M    A    +     
Subjt:  LEKIRENLAEFRPRSSVPPPSELGSTPSSSAPSSWPRGISFQELSQRNAMRKGEDGNAPADSTKGG--RSGTLAFDAIRDSLRKMNSSGAMQNERKGGDP

Query:  MSLSEFKTSLKLKPSDPSSTPVVGG-TDRLPASVFGKEMRDRKDGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDKGKGKNWFSLTELNERLMKLREMEEKE
         +LS  +  +K   +D   + V+GG  + LP SV GKE+ + +D   E MK+EF+K Y   ELG KLR  RP+  K + WFSL ELN+RL+KLR MEE++
Subjt:  MSLSEFKTSLKLKPSDPSSTPVVGG-TDRLPASVFGKEMRDRKDGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDKGKGKNWFSLTELNERLMKLREMEEKE

Query:  TESRIGGILYQDLRASLITIQMSGDEKAKKTTIQRLDILGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQ
         +     I++     +L +      +  K    Q  +I G L  TP YML+PPK+ LVE YFHPDNMSSAEK+KIELAKVR+EFKMSESDCGSARVQVAQ
Subjt:  TESRIGGILYQDLRASLITIQMSGDEKAKKTTIQRLDILGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQ

Query:  LTTKINHLTGVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLRDNPDYK
        LTTKI HL+ VLHKKDKHS+KGL+AMVQ RKKLLKY+RRTDW+SYCL L+KLGLRDNPDYK
Subjt:  LTTKINHLTGVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWESYCLVLNKLGLRDNPDYK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGCTTCAACTCAGCCTCAGACCCAAAAACCCTAAAACTCTCACCAATCCTTCTCTCATTCATCTCTTCTCCTCCAATTCCTCCGCCCCGTCTGATCCAAATGACGA
CCCCGCCGATACTTCCTCCTCCGCCTCCACTGGCTCAGCTCAATCTCCCATGTCCTCCTACTTCAGCGACGTCAAAGCTCGCCTCAAACAGCAGCAGCAATCTCCTTCTC
CACCGACTGCCAGAAAGCCTTCGTACCCATTCACGTCTATTCCGAATCGATCCAGTTCTCCGGCTTTGACATCCGCTTCACTGGAAAAAATCAGAGAGAATCTCGCTGAA
TTTCGCCCTCGGTCGTCTGTGCCTCCTCCCTCCGAGCTTGGCTCTACACCTTCCTCTTCTGCTCCTTCGTCTTGGCCGCGCGGTATCTCGTTTCAAGAGCTTTCCCAGAG
AAATGCGATGAGGAAGGGCGAGGATGGTAATGCACCTGCAGATTCGACCAAAGGTGGGCGTAGCGGCACACTAGCGTTTGATGCCATTCGGGATAGCTTGCGGAAGATGA
ATTCATCGGGGGCGATGCAGAATGAGCGAAAGGGTGGGGATCCGATGTCCTTATCGGAGTTTAAGACCAGCTTGAAATTGAAACCGTCGGACCCGTCGTCGACGCCGGTG
GTGGGTGGGACAGATAGGTTACCGGCGTCGGTTTTCGGGAAGGAGATGAGGGACAGAAAAGATGGGGAGAATGAGGGAATGAAGACGGAATTTGTGAAGATGTATAGCCA
TGGAGAATTGGGGAGCAAGTTGAGAGCTCTGAGGCCAGATAAAGGAAAAGGGAAGAATTGGTTTTCATTGACGGAGTTGAATGAGAGGCTGATGAAGCTAAGGGAAATGG
AGGAGAAGGAGACTGAGTCGAGAATTGGGGGGATTTTATACCAGGATCTGAGAGCGAGCTTGATTACGATCCAGATGTCTGGTGATGAAAAGGCAAAGAAAACGACAATC
CAGCGGCTCGATATCTTGGGTCAGCTAGGTCGAACACCAAACTATATGCTACAACCTCCAAAGGAACATCTTGTTGAAAAGTATTTCCATCCGGATAACATGTCGTCTGC
CGAAAAGCTGAAAATCGAGTTGGCAAAAGTCAGAGATGAATTTAAAATGTCAGAGTCAGACTGTGGATCTGCTCGAGTTCAAGTTGCACAACTTACCACTAAAATCAATC
ATCTAACTGGCGTCTTGCATAAGAAGGACAAGCATTCTAAGAAAGGTCTTCTTGCAATGGTGCAACTGAGGAAAAAGCTACTGAAGTATCTTCGACGAACCGACTGGGAA
TCCTACTGTCTGGTTCTTAACAAACTTGGTCTTCGAGACAACCCGGATTACAAGAACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MALQLSLRPKNPKTLTNPSLIHLFSSNSSAPSDPNDDPADTSSSASTGSAQSPMSSYFSDVKARLKQQQQSPSPPTARKPSYPFTSIPNRSSSPALTSASLEKIRENLAE
FRPRSSVPPPSELGSTPSSSAPSSWPRGISFQELSQRNAMRKGEDGNAPADSTKGGRSGTLAFDAIRDSLRKMNSSGAMQNERKGGDPMSLSEFKTSLKLKPSDPSSTPV
VGGTDRLPASVFGKEMRDRKDGENEGMKTEFVKMYSHGELGSKLRALRPDKGKGKNWFSLTELNERLMKLREMEEKETESRIGGILYQDLRASLITIQMSGDEKAKKTTI
QRLDILGQLGRTPNYMLQPPKEHLVEKYFHPDNMSSAEKLKIELAKVRDEFKMSESDCGSARVQVAQLTTKINHLTGVLHKKDKHSKKGLLAMVQLRKKLLKYLRRTDWE
SYCLVLNKLGLRDNPDYKN

Lag0031259 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome