; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0031473 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0031473
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationchr11:8923459..8923833
RNA-Seq ExpressionLag0031473
SyntenyLag0031473
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6575064.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-5082.81Show/hide
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XP_023006467.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]2.8e-5083.59Show/hide
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XP_038875155.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]5.9e-5389.84Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C9N4 protein RALF-like 339.6e-4984.13Show/hide
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A0A6J1EV64 protein RALF-like 332.6e-4679.69Show/hide
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A0A6J1H3W7 protein RALF-like 337.8e-5182.81Show/hide
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A0A6J1KG89 protein RALF-like 336.9e-4780.47Show/hide
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A0A6J1KVY0 protein RALF-like 331.3e-5083.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.2e-3471.17Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor5.3e-2857.02Show/hide
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 233.2e-3357.97Show/hide
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        G+SR    +++ A + ILA H + +  S+   +F+GD    F P ++ECRG+IAEC            F      G EFEMDSEINRRILAT RYISYGA
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Q9MA62 Protein RALF-like 228.4e-2654.76Show/hide
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        ++   ++ A +AILA   ++IS+       GD +L FV A S      C GSIAEC   +     E E DS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRG
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.7e-2674.07Show/hide
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        S C GSIAEC  A+     E EMDSEINRRILATT+YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCS I RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.2e-2774.07Show/hide
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        S C GSIAEC  A+     E EMDSEINRRILATT+YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNC+ GAQANPY+RGCS I RCRS
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AT2G33775.1 ralf-like 198.6e-1868.85Show/hide
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AT3G05490.1 ralf-like 226.0e-2754.76Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 232.3e-3457.97Show/hide
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        G+SR    +++ A + ILA H + +  S+   +F+GD    F P ++ECRG+IAEC            F      G EFEMDSEINRRILAT RYISYGA
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AT4G15800.1 ralf-like 331.6e-3571.17Show/hide
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Query:  TRGCSAITRCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAATCTCACGCGTTTCTTCTCTCCTTGCTGCCGTCGCCATTCTCGCCTCTCACTTTCTTCTCATCTCATCGGCGATGCCCGTCGATTTCTCCGGCGACCACAACCT
CCTCTTCGTTCCGGCAAAATCCGAGTGCCGAGGCTCAATCGCCGAGTGCTTCCTCGCCGATTCCGCTTTCGGAACGGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATCAATCGCCGAA
TTTTAGCGACTACTCGCTACATCAGCTATGGCGCTCTGAGAAGGAACAACGTTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCTTACTACAACTGCCGGCCAGGCGCTCAGGCGAAT
CCTTACACCCGCGGTTGCAGCGCCATCACTCGCTGCCGGAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAATCTCACGCGTTTCTTCTCTCCTTGCTGCCGTCGCCATTCTCGCCTCTCACTTTCTTCTCATCTCATCGGCGATGCCCGTCGATTTCTCCGGCGACCACAACCT
CCTCTTCGTTCCGGCAAAATCCGAGTGCCGAGGCTCAATCGCCGAGTGCTTCCTCGCCGATTCCGCTTTCGGAACGGAGTTCGAGATGGACTCTGAGATCAATCGCCGAA
TTTTAGCGACTACTCGCTACATCAGCTATGGCGCTCTGAGAAGGAACAACGTTCCTTGCTCTCGCCGCGGTGCTTCTTACTACAACTGCCGGCCAGGCGCTCAGGCGAAT
CCTTACACCCGCGGTTGCAGCGCCATCACTCGCTGCCGGAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGISRVSSLLAAVAILASHFLLISSAMPVDFSGDHNLLFVPAKSECRGSIAECFLADSAFGTEFEMDSEINRRILATTRYISYGALRRNNVPCSRRGASYYNCRPGAQAN
PYTRGCSAITRCRS