CuGenDBv2

Gene ID	Lag0033078
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	protein SAMBA isoform X1
Genome location	chr11:40570225..40571506
RNA-Seq Expression	Lag0033078
Synteny	Lag0033078
Gene Ontology terms	GO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domains	IPR037547 - Protein SAMBA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0038559.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold92G00870 [Cucumis melo var. makuwa]

2.0e-38

85.29

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRINLMSRQGQLF  LT  F I+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII

Query:  IL
        IL
Subjt:  IL

XP_022131247.1 protein SAMBA isoform X1 [Momordica charantia]

1.7e-37

86.14

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQG   N    P+ ++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII

Query:  I
        +
Subjt:  I

XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]

2.2e-37

95.56

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF

XP_022149249.1 protein SAMBA-like isoform X1 [Momordica charantia]

8.4e-37

90.62

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFP
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQG L   + FP
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFP

XP_022149251.1 protein SAMBA-like isoform X2 [Momordica charantia]

1.1e-36

94.44

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQG  F
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A5A7TB46 Uncharacterized protein

9.7e-39

85.29

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRSRINLMSRQGQLF  LT  F I+
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII

Query:  IL
        IL
Subjt:  IL

A0A6J1BQF8 protein SAMBA isoform X1

8.2e-38

86.14

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQG   N    P+ ++
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCII

Query:  I
        +
Subjt:  I

A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X2

1.1e-37

95.56

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+W+FEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF

A0A6J1D582 protein SAMBA-like isoform X1

4.1e-37

90.62

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFP
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQG L   + FP
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFP

A0A6J1D7T9 protein SAMBA-like isoform X2

5.3e-37

94.44

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNW+FEGPRS INLMSRQG  F
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9C613 Protein SAMBA

3.0e-21

60.23

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+W+FEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQG

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G32310.1 unknown protein

2.1e-22

60.23

Show/hide

Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+W+FEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATAGCTCGTCACCGGCTAATTCTTCGATTTCTACCACAGCGGTTGCTGGAAGATGTAGCACCAATGCCGCAATGTCAGTTGACGATTTTCGCTTCCCCGCCAATTT
AATATCTATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAACTGGATTTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTCAATTATTCAATCTTCTGACTTTCCCATTCTGCATTATCATTCTTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWIFEGPRSRINLMSRQGQLFNLLTFPFCIIIL

Lag0033078 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome