; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0033596 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0033596
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptiongamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial
Genome locationchr3:469106..473371
RNA-Seq ExpressionLag0033596
SyntenyLag0033596
Gene Ontology termsGO:0016746 - transferase activity, transferring acyl groups (molecular function)
InterPro domainsIPR011004 - Trimeric LpxA-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587404.1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-12695.42Show/hide
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KAG7021390.1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-12695.83Show/hide
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XP_023531879.1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-12695.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BZX1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial3.0e-12595Show/hide
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A0A6J1E3V9 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial9.2e-12795.83Show/hide
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A0A6J1EZA5 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial1.6e-12695.83Show/hide
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A0A6J1JI10 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial9.2e-12795.83Show/hide
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A0A6J1L3J3 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial6.0e-12695.42Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q94AU7 Gamma carbonic anhydrase 3, mitochondrial4.8e-3239.34Show/hide
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Q9C6B3 Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial4.1e-3139.39Show/hide
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Q9FMV1 Gamma carbonic anhydrase-like 1, mitochondrial3.0e-10677.51Show/hide
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Q9FWR5 Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial1.4e-3139.89Show/hide
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        +G +VE H ++ AG++V    RIPSGE+W GNPARF+R LT EE   I + A   ++L++ H +E    +   L V +F+K L
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Q9SMN1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial8.4e-10977.51Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19580.1 gamma carbonic anhydrase 11.0e-3239.89Show/hide
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AT3G48680.1 gamma carbonic anhydrase-like 25.9e-11077.51Show/hide
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AT5G63510.1 gamma carbonic anhydrase like 12.1e-10777.51Show/hide
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        GDLNKITVGFCSN+QERCV+HA+WSSPTGLPA T I+R+VT+GAYSLLR+CTIEPECIIGQ SILMEGSLVET SILEAGSVVPPGRRIPSGELW GNPA
Subjt:  GDLNKITVGFCSNLQERCVLHASWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRACTIEPECIIGQRSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPA

Query:  RFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL
        RF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL
Subjt:  RFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL

AT5G63510.2 gamma carbonic anhydrase like 14.6e-10269.57Show/hide
Query:  AVARFSRKAIASAVATNQLRRAFSTEVAKA-----------ITPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLR
        ++AR SR+ + S    N +RR F+ E A A           ++PS DRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
Subjt:  AVARFSRKAIASAVATNQLRRAFSTEVAKA-----------ITPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLR

Query:  GDLNKITVGFCSNLQERCVLHASWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRACTIEPECIIGQRSILMEGSLVET
        GDLNKITVGFCSN+QERCV+HA+WSSPT                            LPA T I+R+VT+GAYSLLR+CTIEPECIIGQ SILMEGSLVET
Subjt:  GDLNKITVGFCSNLQERCVLHASWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRACTIEPECIIGQRSILMEGSLVET

Query:  HSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL
         SILEAGSVVPPGRRIPSGELW GNPARF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL
Subjt:  HSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL

AT5G66510.1 gamma carbonic anhydrase 33.4e-3339.34Show/hide
Query:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLRGDLNKITVGFCSNLQERCVLHASWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRACTIEPECIIGQRSILM
        P +   A+VAPN  L+G V+V  G+S+W G VLRGD N I+VG  +N+Q+  ++H + ++ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + ++
Subjt:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLRGDLNKITVGFCSNLQERCVLHASWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRACTIEPECIIGQRSILM

Query:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL
        +G+ VE H+++ +G++V    RIPSGE+W GNPA+F+R +T EE +     AV  ++L++ H +E    +   L+  +FKK L
Subjt:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTVYLEVEKFKKSL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTGTAGCTCGCTTTTCCAGGAAGGCAATAGCCTCAGCGGTTGCGACTAATCAACTCCGCCGTGCTTTCTCCACGGAAGTGGCGAAGGCGATCACGCCCTCACC
GGATCGAGTCAAGTGGGACTATAGAGGTCAAAGACAGATAATCCCGCTCGGCCAGTGGCTCCCCAAAATTGCCGTCGACGCCTATGTTGCGCCTAATGTTGTCCTTGCCG
GACAGGTCAACGTCTGCGACGGTGCCTCCGTTTGGGCGGGTTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAATAAGATTACTGTCGGGTTTTGCTCTAATTTGCAAGAACGGTGCGTC
CTCCACGCTTCTTGGTCCTCCCCAACAGGACTGCCGGCAGAGACATCCATAGAGAGATTCGTCACCATTGGTGCATATAGTCTGTTGCGGGCTTGCACAATTGAGCCGGA
GTGCATTATTGGGCAGCGTTCCATCCTCATGGAAGGTTCCCTGGTTGAGACCCACTCTATTCTTGAAGCTGGGTCTGTGGTTCCCCCGGGAAGGAGAATTCCAAGTGGTG
AACTATGGGCAGGAAACCCAGCAAGGTTTGTCAGAACGTTGACCCACGAGGAGACCTTGGAAATTCCTAAACTTGCTGTTGCAATTAATGACCTGAGCAAGGAACATTTC
TCAGAGTTTCTTCCTTACTCCACAGTATATTTGGAGGTTGAGAAATTCAAGAAGTCCTTGGTGACGCATCTGGGTTTTACATTTGCCATTTCCCAGCTCAAGTCCTTTTC
TGCAAGAAATGAAAGTGGAAACACTCAGCATGCCGATGAGCCGGCCACCTTATGGACTCGTGACAAAGTCATCAACCTCAACCACCTACAGTCGTGGAAGACCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGCTGTAGCTCGCTTTTCCAGGAAGGCAATAGCCTCAGCGGTTGCGACTAATCAACTCCGCCGTGCTTTCTCCACGGAAGTGGCGAAGGCGATCACGCCCTCACC
GGATCGAGTCAAGTGGGACTATAGAGGTCAAAGACAGATAATCCCGCTCGGCCAGTGGCTCCCCAAAATTGCCGTCGACGCCTATGTTGCGCCTAATGTTGTCCTTGCCG
GACAGGTCAACGTCTGCGACGGTGCCTCCGTTTGGGCGGGTTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAATAAGATTACTGTCGGGTTTTGCTCTAATTTGCAAGAACGGTGCGTC
CTCCACGCTTCTTGGTCCTCCCCAACAGGACTGCCGGCAGAGACATCCATAGAGAGATTCGTCACCATTGGTGCATATAGTCTGTTGCGGGCTTGCACAATTGAGCCGGA
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AACTATGGGCAGGAAACCCAGCAAGGTTTGTCAGAACGTTGACCCACGAGGAGACCTTGGAAATTCCTAAACTTGCTGTTGCAATTAATGACCTGAGCAAGGAACATTTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAVARFSRKAIASAVATNQLRRAFSTEVAKAITPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLRGDLNKITVGFCSNLQERCV
LHASWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRACTIEPECIIGQRSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHF
SEFLPYSTVYLEVEKFKKSLVTHLGFTFAISQLKSFSARNESGNTQHADEPATLWTRDKVINLNHLQSWKT