CuGenDBv2

Gene ID	Lag0033845
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr3:2271855..2272676
RNA-Seq Expression	Lag0033845
Synteny	Lag0033845
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6589708.1 hypothetical protein SDJN03_15131, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7023388.1 hypothetical protein SDJN02_14413 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022921809.1 uncharacterized protein LOC111429953 [Cucurbita moschata]

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XP_023516073.1 uncharacterized protein LOC111780044 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A1S3BW36 uncharacterized protein LOC103494265

4.2e-113

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A0A5A7UVS6 Uncharacterized protein

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A0A5D3CL04 Uncharacterized protein

2.3e-111

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A0A6J1E1L2 uncharacterized protein LOC111429953

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A0A6J1JAL3 uncharacterized protein LOC111485063

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G30230.1 unknown protein

1.3e-29

38.28

Show/hide

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        HH ++E E++LS  DLPL K K+   T     K P        +LFEF T+   + +++PAE++IF G+L+PLN  +   S             SR+   
Subjt:  HHDQDEAEESLSFSDLPLDKEKSDEHTLESFRKNPRRSSSEPLDLFEFFTTGFITSEISPAEDLIFCGRLLPLNDHSPLTSRTTSEKNFWKLEESRKQTG

Query:  FRKRSESLSGLQS-SVSRSNSAKINLKRN------SRSLDYRRLYRQANSIFSPTAEIDRNCSIKSGLKPDPLNKKA--SSKPRWYLLMFGMVKFPAEMD
         R RSESLS +Q   ++R  S  +  + N      SRSLDYR+L R   ++ SP    + + S K+  KP+  +  +  S +PRWY++MFGMVKFP E++
Subjt:  FRKRSESLSGLQS-SVSRSNSAKINLKRN------SRSLDYRRLYRQANSIFSPTAEIDRNCSIKSGLKPDPLNKKA--SSKPRWYLLMFGMVKFPAEMD

Query:  LSDIKSRQVRRS-SSALFPANENKGKFQCNRNSGEAAWRILRALSCKNHASVDVTA
        L DIKSRQ+RR+    +FP+  N+        S   +WR L ALSCK   SV  TA
Subjt:  LSDIKSRQVRRS-SSALFPANENKGKFQCNRNSGEAAWRILRALSCKNHASVDVTA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTCATGGACGACGGCGCCACCGAATCCAATCCTCTAACCTCACAGCACACACAAAATCAACACCACCACCATGACCAAGACGAAGCAGAGGAGTCCCTCTCCTTCTC
CGATCTTCCACTCGACAAGGAAAAATCCGACGAACACACCTTGGAAAGCTTCCGCAAGAATCCACGGCGATCCTCTTCCGAGCCTCTCGATCTCTTTGAATTCTTCACCA
CTGGATTCATCACCTCCGAAATATCTCCGGCGGAGGATTTGATCTTCTGCGGCAGGTTGCTTCCTCTCAACGATCACTCTCCGCTTACTTCGCGTACTACTTCTGAGAAG
AATTTCTGGAAGCTGGAAGAGAGCCGAAAACAGACTGGATTTCGAAAACGCTCCGAGTCATTGTCCGGATTGCAGAGCTCTGTTTCTCGATCGAACAGCGCGAAGATCAA
TCTCAAGCGGAATAGCCGATCGCTCGATTACCGCAGACTCTATCGCCAAGCGAATTCGATTTTCTCGCCGACGGCTGAAATCGATCGTAATTGTTCGATCAAGAGCGGAT
TGAAGCCTGATCCGCTGAACAAAAAGGCGTCGTCGAAGCCGCGGTGGTACTTGCTGATGTTCGGAATGGTGAAGTTTCCGGCGGAGATGGATCTAAGCGACATTAAGAGC
AGACAAGTCCGCCGCAGTTCGTCGGCACTTTTTCCGGCGAATGAGAACAAAGGAAAATTTCAGTGCAACCGGAACTCCGGCGAGGCGGCCTGGAGGATCCTCCGGGCGCT
CAGCTGCAAGAATCACGCTAGTGTAGATGTAACGGCGTCGTTAACCGCCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFMDDGATESNPLTSQHTQNQHHHHDQDEAEESLSFSDLPLDKEKSDEHTLESFRKNPRRSSSEPLDLFEFFTTGFITSEISPAEDLIFCGRLLPLNDHSPLTSRTTSEK
NFWKLEESRKQTGFRKRSESLSGLQSSVSRSNSAKINLKRNSRSLDYRRLYRQANSIFSPTAEIDRNCSIKSGLKPDPLNKKASSKPRWYLLMFGMVKFPAEMDLSDIKS
RQVRRSSSALFPANENKGKFQCNRNSGEAAWRILRALSCKNHASVDVTASLTA

Lag0033845 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome