; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0034255 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0034255
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationchr3:5759835..5760443
RNA-Seq ExpressionLag0034255
SyntenyLag0034255
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7021750.1 hypothetical protein SDJN02_15477, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-9092.57Show/hide
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XP_022966156.1 uncharacterized protein LOC111465917 [Cucurbita maxima]3.8e-8992.08Show/hide
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XP_023530348.1 uncharacterized protein LOC111792947 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-8992.08Show/hide
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XP_038879100.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]9.9e-9092.16Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LW36 Uncharacterized protein9.0e-8991.13Show/hide
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A0A5A7U461 Putative serine-rich protein-like protein7.7e-8890.64Show/hide
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A0A6J1C124 uncharacterized protein DDB_G0271670-like7.7e-8889.81Show/hide
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A0A6J1F5M8 uncharacterized protein LOC1114410571.6e-9092.57Show/hide
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A0A6J1HNK6 uncharacterized protein LOC1114659171.8e-8992.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein3.6e-0550Show/hide
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        G++ + RQ++  +T C+CSPTTHPGSFRC +H+ +  Q
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related3.2e-4657.87Show/hide
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        S  KS+GPVLRS SPSGRF G YS +  SSSSSAFASSTS+  +   S+FF             RS SP+RVNL  ++ P + S R+SLD RSISP N+ 
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        ISV      NQ         R CMCSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q +  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL +LIRPSSH  +RR  
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        + PRPSRLSIM+KAD+
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related7.5e-1136.11Show/hide
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        SS S     SS+      +     +RS SP   NL         ++R       S  +P SV+T S  +Q        KR C+CSPTTHPGSFRCS H+ 
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        +  + S   +S      NR          LN R+ A+ NSL +IG VE +  +R+L A+L +PSS    RR +F PR SR
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related1.7e-4254.17Show/hide
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        +V +    N    +  + +R CMCSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q +  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL +LIRPSSH  +RR  +
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         PR SRL+ MSKA+D+
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related1.7e-4254.17Show/hide
Query:  SSRKSSGPVLRSLSPSGRFYGSYSS--PSSS-SSSAFASSTSTFSTKNPSSFF----------RRSVSPSRVNLQGSSSPSASSVRFSLD-RSISPNRPI
        ++R +    LRS SPSGRF G YS+  PSSS SSS FASSTS+  +   ++FF           RS SP+RVNL  +S+P   S R+S+D RSISPNR I
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        +V +    N    +  + +R CMCSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q +  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL +LIRPSSH  +RR  +
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Query:  CPRPSRLSIMSKADDV
         PR SRL+ MSKA+D+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGTTTCTTCTAGAAAATCGAGCGGGCCGGTTCTGAGGTCTCTCTCACCATCTGGTAGATTCTATGGCTCCTATTCTTCTCCTTCGTCTTCTTCCTCGTCGGCCTT
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TGCATGTGCTCTCCGACCACGCATCCTGGTTCGTTTCGGTGTAGTCTCCACAAGGGCGTTCCGTCGCAGCCTTCGACTCCTTACTCGTCTAATCGGCTTAATGCGCGGAG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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CMCSPTTHPGSFRCSLHKGVPSQPSTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALASLIRPSSHSQRRRVDFCPRPSRLSIMSKADDV