; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0035018 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0035018
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionserine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A
Genome locationchr3:13667834..13673033
RNA-Seq ExpressionLag0035018
SyntenyLag0035018
Gene Ontology termsGO:0000398 - mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016607 - nuclear speck (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004139072.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis sativus]4.9e-12889.66Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY  GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
        C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSPP   RSPR+SRSP  R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR DS
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS

Query:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        RERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSPSPVRGRSL  SRSRSKSVG    RS+SPRRSPRHEEEYRSEPN GDRSPSQ
Subjt:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

XP_008450303.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Cucumis melo]2.2e-12889.58Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY  GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
        C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSP RYSRSPR+SRSP  R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR DS
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS

Query:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        RERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRS SP RG  RSPSPVRGRSLSRSRS+S      RS+SP+ SPRHEEEYRSEPN GDRSP Q
Subjt:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

XP_022153263.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Momordica charantia]1.1e-13291Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
        GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG    SGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR

Query:  DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        DR+DSRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG    RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt:  DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

XP_022153264.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Momordica charantia]2.0e-13492.28Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD
        GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPRDR+D
Subjt:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD

Query:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        SRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG    RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

XP_038879568.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Benincasa hispida]2.9e-12890.28Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY  GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
        C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR HDRRRSPPRYSRSPR+SRSP  RHARYSRSP PRHAR+RSRSYDYASPPPKQ+AYSRSVSPRDR DS
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS

Query:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        RERS+PRQ SRGR  SRSPRLDGSRSRSQSPAR GSRSPSPVRGRSLSRSRS+S      RS+SPR SPRH EEYRSEPN GDRSPSQ
Subjt:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZX6 RRM domain-containing protein1.5e-13588.67Show/hide
Query:  LSSSARFLDSGPPSLVTVQMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFG
        L+S ARFLDSGP SLV V MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY  GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFG
Subjt:  LSSSARFLDSGPPSLVTVQMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFG

Query:  FVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
        FVQYVDPADAADAKH MDGC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSPP   RSPR+SRSP  R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS 
Subjt:  FVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP

Query:  PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEP
        PPKQRAYSRS+SPRDR DSRERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSPSPVRGRSL  SRSRSKSVG    RS+SPRRSPRHEEEYRSEP
Subjt:  PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEP

Query:  NGGDRSPSQ
        N GDRSPSQ
Subjt:  NGGDRSPSQ

A0A1S3BPL2 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X21.1e-12889.58Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY  GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
        C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSP RYSRSPR+SRSP  R  RYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR DS
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS

Query:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        RERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRS SP RG  RSPSPVRGRSLSRSRS+S      RS+SP+ SPRHEEEYRSEPN GDRSP Q
Subjt:  RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

A0A6J1DH06 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X15.4e-13391Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
        GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG    SGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR

Query:  DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        DR+DSRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG    RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt:  DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

A0A6J1DIJ4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X29.9e-13592.28Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD

Query:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD
        GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPRDR+D
Subjt:  GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD

Query:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        SRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG    RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

A0A6J1KZE4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A2.0e-12787.2Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKD+YLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSV--SPRDRQ
        C+L GRE+TVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRY      SRSPP RHAR S SPAPRHARSRSRSYDYASPPP+QRAYSRS+  SPR R+
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSV--SPRDRQ

Query:  DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPA-RGGSRSPSPVRGRSLSRS--RSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
        DSRERSYPRQPSRG SYS+SP+LDG+RSRSQSPA RGGSRSPSPVRGR LSRS  RS+S+ +S+SPR SPRHEEEYRSE NGG RSPS+
Subjt:  DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPA-RGGSRSPSPVRGRSLSRS--RSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 104.0e-2439.33Show/hide
Query:  TSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDR
        TSL VRN+  D R EDLRR FG++G I D+Y+P D+YT  PRGF +VQ+ D  DA DA H +D   + GR++ + FA+ +RK P+ M+A+E   GR    
Subjt:  TSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDR

Query:  RRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY---------ASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRS-PRLD----
          S  RY    R+ R         SRS +    RSRSRS+DY          S P  +   SRS S  DR   R RS+ R  S  RS S+S P+ +    
Subjt:  RRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY---------ASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRS-PRLD----

Query:  -GSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSR----------SRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGG
          SRS S +  RG S++ S    +S SR           RSKS  RSQS  RS      + S  + G
Subjt:  -GSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSR----------SRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGG

Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL284.7e-3341.3Show/hide
Query:  LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY
        +   + R RSY+P     SPPR   GY   R    PS R     G     P+ LL+RNL  D RP DLR  F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y
Subjt:  LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY

Query:  VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
            DAA+A  +M+  ++ GRE+ +VFAEENRK P +MR     SGR  D +    RSP R  RS   SRSPP R +R+          S+ R  D  SP
Subjt:  VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP

Query:  PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR
          + R+ SRS  PR+ ++ + R+            RSPR +              R  +P+R R LSRSRS+S+ R
Subjt:  PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR

Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL301.6e-2840.36Show/hide
Query:  RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP--------RGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
        R Y+P   SPP RGYG RGRSP P         G  GGGR      SLLVRN+  DCRPE+LR PF +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD  DA
Subjt:  RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP--------RGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA

Query:  ADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRS
         +A+  M+     GRE+TVV A E+RK+P +MR + R   R     R      RS   SRS     +R  R P+   +R RSRSY   SP P++    R 
Subjt:  ADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRS

Query:  VSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPR
          PR  +D         P    + + +P  D +         G         GR++SRS S S  RS+S   SPR
Subjt:  VSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPR

Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A7.9e-8164.36Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+GG R  DLPTSLLVRNLRHDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKHQMDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ
         LLLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG  S RF DRRRSPPRY      SRSPPPR  R          RSRSRS  Y SPP K R  SRSVSP+DR+
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ

Query:  DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ
          +E          RSYSRSP  +GSR RS SP R  S S SP R  S  ++RS +  +++S    PR        P G   GDRSPSQ
Subjt:  DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ

Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL332.0e-8463.69Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
         LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+PPRY     +SR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR +R D
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD

Query:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE
         R           RSYSRSP  DGSR RS +P RG                   SRSPSP R RS+S  RS S+S  RS+SPRRS     P         
Subjt:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE

Query:  PNGG----DRSPSQ
        P+GG    DRSPSQ
Subjt:  PNGG----DRSPSQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 331.4e-8563.69Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
         LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+PPRY     +SR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR +R D
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD

Query:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE
         R           RSYSRSP  DGSR RS +P RG                   SRSPSP R RS+S  RS S+S  RS+SPRRS     P         
Subjt:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE

Query:  PNGG----DRSPSQ
        P+GG    DRSPSQ
Subjt:  PNGG----DRSPSQ

AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 331.1e-8271.31Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
         LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+PPRY     +SR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR +R D
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD

Query:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVR
         R           RSYSRSP  DGSR RS +P RG SRS SP +
Subjt:  SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVR

AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 331.6e-8161.16Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDP
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG            +PRGFGFVQ++DP
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDP

Query:  ADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRA
        ADAADAKH MDG LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG G RF DRRR+PPRY     +SR         SRSP PR  RSRSRS DY SPPP+ R 
Subjt:  ADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRA

Query:  YSRSVSPR-DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS--
        + RS+SPR +R D R           RSYSRSP  DGSR RS +P RG                   SRSPSP R RS+S  RS S+S  RS+SPRRS  
Subjt:  YSRSVSPR-DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS--

Query:  ---PRHEEEYRSEPNGG----DRSPSQ
           P         P+GG    DRSPSQ
Subjt:  ---PRHEEEYRSEPNGG----DRSPSQ

AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A5.6e-8264.36Show/hide
Query:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
        MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+GG R  DLPTSLLVRNLRHDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKHQMDG
Subjt:  MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG

Query:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ
         LLLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG  S RF DRRRSPPRY      SRSPPPR  R          RSRSRS  Y SPP K R  SRSVSP+DR+
Subjt:  CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ

Query:  DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ
          +E          RSYSRSP  +GSR RS SP R  S S SP R  S  ++RS +  +++S    PR        P G   GDRSPSQ
Subjt:  DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ

AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 283.3e-3441.3Show/hide
Query:  LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY
        +   + R RSY+P     SPPR   GY   R    PS R     G     P+ LL+RNL  D RP DLR  F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y
Subjt:  LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY

Query:  VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
            DAA+A  +M+  ++ GRE+ +VFAEENRK P +MR     SGR  D +    RSP R  RS   SRSPP R +R+          S+ R  D  SP
Subjt:  VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP

Query:  PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR
          + R+ SRS  PR+ ++ + R+            RSPR +              R  +P+R R LSRSRS+S+ R
Subjt:  PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCATATGGGGTTCATCAAGTTAAGCTTTCTTCTTCAGCGAGATTCTTGGACAGCGGGCCCCCGTCATTGGTTACTGTGCAAATGAGGGGTAGGAGTTATACTCCATC
TCCGCCAAGGGGTTATGGCAGGAGGGGACGGAGCCCTAGCCCTAGGGGGCGCTATGGTGGTGGACGTGGGAGAGACCTACCCACTAGCCTTCTAGTTCGTAATCTTCGCC
ATGACTGCAGGCCTGAGGATCTTCGTAGACCATTTGGACAGTTTGGTGCTATTAAGGACATATACCTACCAAAGGACTATTATACTGGAGAACCACGTGGTTTTGGTTTT
GTTCAATATGTAGATCCTGCTGATGCTGCAGATGCTAAACATCAGATGGATGGCTGTCTTCTTCTCGGTCGGGAGTTGACTGTGGTATTTGCTGAGGAAAACAGGAAGAA
GCCCTCGGATATGAGGGCAAGGGAGAGAGGAAGTGGACGATTTCATGATCGAAGAAGATCTCCTCCACGGTATTCTCGTTCACCCCGACATTCTCGTTCCCCGCCTCCAC
GCCATGCAAGGTATTCCCGTTCACCAGCTCCACGCCATGCACGGTCTAGGTCTCGTAGTTATGATTATGCATCCCCACCACCAAAGCAAAGGGCGTACTCTAGATCGGTG
TCCCCTCGTGACAGGCAGGATAGTCGAGAGAGGTCATACCCACGACAGCCGAGCCGTGGTAGGTCCTACTCTCGATCTCCACGACTTGATGGTTCGAGAAGTAGAAGTCA
AAGTCCAGCACGTGGTGGAAGTCGAAGTCCGAGCCCTGTGAGAGGCCGAAGCTTGAGTAGGAGCAGGAGCAAAAGCGTTGGCCGGAGCCAGAGTCCACGACGAAGTCCAA
GACATGAAGAAGAGTATAGAAGTGAACCAAATGGAGGAGATAGGAGCCCTAGTCAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCATATGGGGTTCATCAAGTTAAGCTTTCTTCTTCAGCGAGATTCTTGGACAGCGGGCCCCCGTCATTGGTTACTGTGCAAATGAGGGGTAGGAGTTATACTCCATC
TCCGCCAAGGGGTTATGGCAGGAGGGGACGGAGCCCTAGCCCTAGGGGGCGCTATGGTGGTGGACGTGGGAGAGACCTACCCACTAGCCTTCTAGTTCGTAATCTTCGCC
ATGACTGCAGGCCTGAGGATCTTCGTAGACCATTTGGACAGTTTGGTGCTATTAAGGACATATACCTACCAAAGGACTATTATACTGGAGAACCACGTGGTTTTGGTTTT
GTTCAATATGTAGATCCTGCTGATGCTGCAGATGCTAAACATCAGATGGATGGCTGTCTTCTTCTCGGTCGGGAGTTGACTGTGGTATTTGCTGAGGAAAACAGGAAGAA
GCCCTCGGATATGAGGGCAAGGGAGAGAGGAAGTGGACGATTTCATGATCGAAGAAGATCTCCTCCACGGTATTCTCGTTCACCCCGACATTCTCGTTCCCCGCCTCCAC
GCCATGCAAGGTATTCCCGTTCACCAGCTCCACGCCATGCACGGTCTAGGTCTCGTAGTTATGATTATGCATCCCCACCACCAAAGCAAAGGGCGTACTCTAGATCGGTG
TCCCCTCGTGACAGGCAGGATAGTCGAGAGAGGTCATACCCACGACAGCCGAGCCGTGGTAGGTCCTACTCTCGATCTCCACGACTTGATGGTTCGAGAAGTAGAAGTCA
AAGTCCAGCACGTGGTGGAAGTCGAAGTCCGAGCCCTGTGAGAGGCCGAAGCTTGAGTAGGAGCAGGAGCAAAAGCGTTGGCCGGAGCCAGAGTCCACGACGAAGTCCAA
GACATGAAGAAGAGTATAGAAGTGAACCAAATGGAGGAGATAGGAGCCCTAGTCAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPYGVHQVKLSSSARFLDSGPPSLVTVQMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGF
VQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSV
SPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ