| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004139072.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Cucumis sativus] | 4.9e-128 | 89.66 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSPP RSPR+SRSP R RYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS PPKQRAYSRS+SPRDR DS
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
Query: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
RERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSPSPVRGRSL SRSRSKSVG RS+SPRRSPRHEEEYRSEPN GDRSPSQ
Subjt: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| XP_008450303.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Cucumis melo] | 2.2e-128 | 89.58 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSP RYSRSPR+SRSP R RYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR DS
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
Query: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
RERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRS SP RG RSPSPVRGRSLSRSRS+S RS+SP+ SPRHEEEYRSEPN GDRSP Q
Subjt: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| XP_022153263.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 [Momordica charantia] | 1.1e-132 | 91 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Query: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
Query: DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
DR+DSRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt: DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| XP_022153264.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Momordica charantia] | 2.0e-134 | 92.28 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Query: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD
GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPRDR+D
Subjt: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD
Query: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
SRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| XP_038879568.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 [Benincasa hispida] | 2.9e-128 | 90.28 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR HDRRRSPPRYSRSPR+SRSP RHARYSRSP PRHAR+RSRSYDYASPPPKQ+AYSRSVSPRDR DS
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
Query: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
RERS+PRQ SRGR SRSPRLDGSRSRSQSPAR GSRSPSPVRGRSLSRSRS+S RS+SPR SPRH EEYRSEPN GDRSPSQ
Subjt: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LZX6 RRM domain-containing protein | 1.5e-135 | 88.67 | Show/hide |
Query: LSSSARFLDSGPPSLVTVQMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFG
L+S ARFLDSGP SLV V MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFG
Subjt: LSSSARFLDSGPPSLVTVQMRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFG
Query: FVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
FVQYVDPADAADAKH MDGC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGR+HDRRRSPP RSPR+SRSP R RYSRSPAPRHARSRSRSYDYAS
Subjt: FVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
Query: PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEP
PPKQRAYSRS+SPRDR DSRERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSP + GSRSPSPVRGRSL SRSRSKSVG RS+SPRRSPRHEEEYRSEP
Subjt: PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSL--SRSRSKSVG----RSQSPRRSPRHEEEYRSEP
Query: NGGDRSPSQ
N GDRSPSQ
Subjt: NGGDRSPSQ
|
|
| A0A1S3BPL2 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 1.1e-128 | 89.58 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GRGRDLPTSLLVRNL HDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
C+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSP RYSRSPR+SRSP R RYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDR DS
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDS
Query: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
RERS+PRQ SRGRSYSRSPRLDGSRSRS SP RG RSPSPVRGRSLSRSRS+S RS+SP+ SPRHEEEYRSEPN GDRSP Q
Subjt: RERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSV----GRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| A0A6J1DH06 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X1 | 5.4e-133 | 91 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Query: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG SGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPR
Subjt: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG----SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR
Query: DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
DR+DSRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt: DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| A0A6J1DIJ4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A isoform X2 | 9.9e-135 | 92.28 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG GR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGG-GRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMD
Query: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD
GC+LLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPR+SRSP PRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY SPPPKQRA SRSVSPRDR+D
Subjt: GCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQD
Query: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
SRERSYPRQPSRGRSYS+SPRL+GSRSRSQSPARGGSRS SP RG RSRS+SV RS+SPRRSPRHEEEYRS+PN GDRSPSQ
Subjt: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| A0A6J1KZE4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 2.0e-127 | 87.2 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRR FGQFGAIKD+YLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSV--SPRDRQ
C+L GRE+TVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRY SRSPP RHAR S SPAPRHARSRSRSYDYASPPP+QRAYSRS+ SPR R+
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSV--SPRDRQ
Query: DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPA-RGGSRSPSPVRGRSLSRS--RSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
DSRERSYPRQPSRG SYS+SP+LDG+RSRSQSPA RGGSRSPSPVRGR LSRS RS+S+ +S+SPR SPRHEEEYRSE NGG RSPS+
Subjt: DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPA-RGGSRSPSPVRGRSLSRS--RSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGGDRSPSQ
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 4.0e-24 | 39.33 | Show/hide |
Query: TSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDR
TSL VRN+ D R EDLRR FG++G I D+Y+P D+YT PRGF +VQ+ D DA DA H +D + GR++ + FA+ +RK P+ M+A+E GR
Subjt: TSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDR
Query: RRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY---------ASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRS-PRLD----
S RY R+ R SRS + RSRSRS+DY S P + SRS S DR R RS+ R S RS S+S P+ +
Subjt: RRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDY---------ASPPPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRS-PRLD----
Query: -GSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSR----------SRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGG
SRS S + RG S++ S +S SR RSKS RSQS RS + S + G
Subjt: -GSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSR----------SRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNGG
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.7e-33 | 41.3 | Show/hide |
Query: LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY
+ + R RSY+P SPPR GY R PS R G P+ LL+RNL D RP DLR F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y
Subjt: LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY
Query: VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
DAA+A +M+ ++ GRE+ +VFAEENRK P +MR SGR D + RSP R RS SRSPP R +R+ S+ R D SP
Subjt: VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
Query: PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR
+ R+ SRS PR+ ++ + R+ RSPR + R +P+R R LSRSRS+S+ R
Subjt: PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 1.6e-28 | 40.36 | Show/hide |
Query: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP--------RGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
R Y+P SPP RGYG RGRSP P G GGGR SLLVRN+ DCRPE+LR PF +FG ++D+Y+P+DYY+G+PRGF FV++VD DA
Subjt: RSYTP---SPP-RGYGRRGRSPSP--------RGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADA
Query: ADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRS
+A+ M+ GRE+TVV A E+RK+P +MR + R R R RS SRS +R R P+ +R RSRSY SP P++ R
Subjt: ADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRS
Query: VSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPR
PR +D P + + +P D + G GR++SRS S S RS+S SPR
Subjt: VSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 7.9e-81 | 64.36 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+GG R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKHQMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ
LLLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG S RF DRRRSPPRY SRSPPPR R RSRSRS Y SPP K R SRSVSP+DR+
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ
Query: DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ
+E RSYSRSP +GSR RS SP R S S SP R S ++RS + +++S PR P G GDRSPSQ
Subjt: DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 2.0e-84 | 63.69 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+PPRY +SR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR +R D
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
Query: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE
R RSYSRSP DGSR RS +P RG SRSPSP R RS+S RS S+S RS+SPRRS P
Subjt: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE
Query: PNGG----DRSPSQ
P+GG DRSPSQ
Subjt: PNGG----DRSPSQ
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.4e-85 | 63.69 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+PPRY +SR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR +R D
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
Query: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE
R RSYSRSP DGSR RS +P RG SRSPSP R RS+S RS S+S RS+SPRRS P
Subjt: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS-----PRHEEEYRSE
Query: PNGG----DRSPSQ
P+GG DRSPSQ
Subjt: PNGG----DRSPSQ
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 1.1e-82 | 71.31 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGFVQ++DPADAADAKH MDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG GRF DRRR+PPRY +SR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+ R + RS+SPR +R D
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPR-DRQD
Query: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVR
R RSYSRSP DGSR RS +P RG SRS SP +
Subjt: SRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVR
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.6e-81 | 61.16 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDP
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRY GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR+ F QFG +KDIYLP+DYYTG +PRGFGFVQ++DP
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTG------------EPRGFGFVQYVDP
Query: ADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRA
ADAADAKH MDG LLLGRELTVVFAEENRKKP++MRARERG G RF DRRR+PPRY +SR SRSP PR RSRSRS DY SPPP+ R
Subjt: ADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSG-RFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRA
Query: YSRSVSPR-DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS--
+ RS+SPR +R D R RSYSRSP DGSR RS +P RG SRSPSP R RS+S RS S+S RS+SPRRS
Subjt: YSRSVSPR-DRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARG------------------GSRSPSPVRGRSLS--RSRSKSVGRSQSPRRS--
Query: ---PRHEEEYRSEPNGG----DRSPSQ
P P+GG DRSPSQ
Subjt: ---PRHEEEYRSEPNGG----DRSPSQ
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 5.6e-82 | 64.36 | Show/hide |
Query: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGR+GG R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLRRPF QFG +KDIYLP+DYYTG+PRGFGF+Q++DPADAA+AKHQMDG
Subjt: MRGRSYTPSPPRGYGRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQYVDPADAADAKHQMDG
Query: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ
LLLGRELTVVFAEENRKKP++MR R+RG S RF DRRRSPPRY SRSPPPR R RSRSRS Y SPP K R SRSVSP+DR+
Subjt: CLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERG--SGRFHDRRRSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASPPPKQRAYSRSVSPRDRQ
Query: DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ
+E RSYSRSP +GSR RS SP R S S SP R S ++RS + +++S PR P G GDRSPSQ
Subjt: DSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGRSQSPRRSPRHEEEYRSEPNG---GDRSPSQ
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 3.3e-34 | 41.3 | Show/hide |
Query: LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY
+ + R RSY+P SPPR GY R PS R G P+ LL+RNL D RP DLR F +FG +KDIYLP++YYTGEPRGFGFV+Y
Subjt: LVTVQMRGRSYTP-----SPPR---GY--GRRGRSPSPRGRYGGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRRPFGQFGAIKDIYLPKDYYTGEPRGFGFVQY
Query: VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
DAA+A +M+ ++ GRE+ +VFAEENRK P +MR SGR D + RSP R RS SRSPP R +R+ S+ R D SP
Subjt: VDPADAADAKHQMDGCLLLGRELTVVFAEENRKKPSDMRARERGSGRFHDRR----RSPPRYSRSPRHSRSPPPRHARYSRSPAPRHARSRSRSYDYASP
Query: PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR
+ R+ SRS PR+ ++ + R+ RSPR + R +P+R R LSRSRS+S+ R
Subjt: PPKQRAYSRSVSPRDRQDSRERSYPRQPSRGRSYSRSPRLDGSRSRSQSPARGGSRSPSPVRGRSLSRSRSKSVGR
|
|