; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0035125 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0035125
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionTranslation initiation factor
Genome locationchr3:15332029..15336341
RNA-Seq ExpressionLag0035125
SyntenyLag0035125
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR018790 - Protein of unknown function DUF2358


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588260.1 hypothetical protein SDJN03_16825, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.7e-13189.82Show/hide
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KAG7022179.1 hypothetical protein SDJN02_15909, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.4e-13195.28Show/hide
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        NPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSA+SQAFFWASRYLFASTEAGKDLADSVS+L G
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XP_008443648.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487195 [Cucumis melo]1.2e-13192.86Show/hide
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        YKRQLWATSAL+NPTTSVQEMVM+STS+LNIKWTI+GKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFAS EAG
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XP_023520646.1 uncharacterized protein LOC111784055 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-13192.83Show/hide
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        KRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSA+SQAFFWASRYLFASTEAGK
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XP_038879445.1 uncharacterized protein LOC120071318 [Benincasa hispida]2.2e-13393.7Show/hide
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        P   PP  RH  + R AANDSNSTDQLT ESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRS+GNFAVFVKYKDP+RKFT
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        GREKYKRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLV+AIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFAS
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Query:  TEAGKDLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
         EAGKDLADSVSSL GRVSTEKQNLEMFPDPSGDP+KFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LXP7 Uncharacterized protein3.6e-12683.86Show/hide
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        MGRR+EYLRFLSFSRRS+ S    +LPPQ+PPWR HTSR                        PAANDSNST+QLT ESAVERSEADKIVDGMDFGELCN
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Query:  EFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKDPVRKFTGREKYKRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGG
        EFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRS+GNFAVFVKYKDP+RKFTGREKYKRQLWATSAL+NPTTSVQEMVM+STSIL IKWTIKGKPKSLVAAIGG
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Query:  DLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGKDLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSK
        DLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEE WDVSSSSAISQAFFWASRYLFAS EAGKDL DSVSSL GRVSTEKQNLEMFPDPSGDP+K
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A0A1S3B999 uncharacterized protein LOC1034871955.7e-13292.86Show/hide
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Query:  YKRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAG
        YKRQLWATSAL+NPTTSVQEMVM+STS+LNIKWTI+GKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFAS EAG
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Query:  KDLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
        KDLADSVSSL GRVSTEKQNLEMFPDPSGDP+KFFQGEDNFQ+DAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
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A0A6J1DTK7 uncharacterized protein LOC1110238781.1e-13092.48Show/hide
Query:  PPWRRH--TSRPAANDSNSTDQLTVESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKDPVRKFTGREK
        PP  RH  T R AANDSNSTDQLT ES VERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRS+GNFAVFVKYKDPVRKFTGREK
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        YKRQ+W  SALENPTTSVQEMVMVST ILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVS SSA+SQAFFWASRYLFAS EAG
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Query:  KDLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
        KDLADSVSSL GR+STEKQNLEMFPDPSGDP+KFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFL ATL
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A0A6J1F169 uncharacterized protein LOC1114411888.3e-13192.08Show/hide
Query:  PWRRHT--SRPAANDSNSTDQLTVESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKDPVRKFTGREKY
        P  RH    R AANDSNSTDQLT ESAVERS+ADKIVDGMDFGELCNEFEC+SSPLVESTARQLA+DILQLRQGDRS+GNFAVFVKYKDP+RKFTGREKY
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Query:  KRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGK
        KRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSA+SQAFFWASRYLFASTEAGK
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Query:  DLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
        DLADSVS+L G+VSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFF+GE+NFQRDAYQFALLLAI+YFVVQFL+ATL
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A0A6J1I9U0 uncharacterized protein LOC1114724604.9e-13192.45Show/hide
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Query:  KRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGK
        KR+LWATSALENPTTSVQEMVMVSTS+LNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGK
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        DLADSVS+L G+VSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFF+GEDNFQRDAYQFALLLAI+YFVVQFL+ATL
Subjt:  DLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65230.1 Uncharacterized conserved protein (DUF2358)5.9e-8961.78Show/hide
Query:  HTSRPAANDSNSTDQLTVESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKDPVRKFTGREKYKRQLWA
        H      NDS  T     E ++++SE DK+VD +DFGELCN+FEC SSP VESTARQL RDIL++R+G+R+   +AV VKYKDPVR FTGREKYKR +W 
Subjt:  HTSRPAANDSNSTDQLTVESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDRSIGNFAVFVKYKDPVRKFTGREKYKRQLWA

Query:  TSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGKDLADSV
        TS LENPT +VQEMVM+STS+L IKWT+KGKPKS++AA+ GDLI+KV S+FTLNQISGQV EHEE WD+SSSS I+QA+FW SR LFA++E+ KD+AD  
Subjt:  TSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFFWASRYLFASTEAGKDLADSV

Query:  SSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL
          L   ++T K++ +++ DP+ DP+KFFQ +++F+RD YQ AL LAI+YFVVQFL+ T+
Subjt:  SSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTGGAATCACAATGGGACGGAGAGATGAGTACCTGCGTTTCCTCTCCTTCTCTCGCCGCTCCCTCTGCAGTAGCGGCCGCCGCAATCTTCCGCCGCAAGAGCCGCC
GTGGCGCCGCCACACCTCTCGCCCCGCCGCGAACGATTCGAACAGCACCGACCAATTGACGGTGGAATCCGCCGTCGAAAGATCGGAGGCCGATAAGATCGTGGACGGCA
TGGATTTCGGTGAGCTCTGCAACGAATTCGAGTGCATAAGCAGTCCCTTGGTTGAGTCCACAGCCAGGCAACTAGCTAGAGACATTCTCCAACTTCGCCAAGGCGATCGA
TCTATTGGAAATTTCGCCGTCTTCGTCAAGTATAAGGATCCGGTTAGGAAATTCACGGGGCGAGAGAAGTACAAAAGACAACTCTGGGCAACCAGTGCGCTCGAGAATCC
AACGACGAGTGTGCAAGAAATGGTGATGGTGTCAACAAGCATACTAAACATCAAGTGGACAATCAAAGGGAAACCTAAGTCCTTGGTTGCAGCCATAGGAGGAGATCTGA
TCATCAAAGTTGATTCACAGTTCACTCTCAACCAAATCAGTGGCCAAGTTATCGAACACGAAGAGCGTTGGGACGTGTCGAGTTCCTCTGCCATTTCCCAAGCTTTCTTT
TGGGCCTCGCGCTATCTCTTCGCCTCCACCGAGGCAGGGAAGGACTTGGCTGATTCTGTCAGCAGCCTCGCCGGCCGAGTCTCTACTGAGAAACAGAACTTGGAGATGTT
TCCTGACCCCTCTGGTGATCCTAGCAAGTTCTTTCAAGGTGAGGACAACTTCCAAAGAGATGCATACCAGTTTGCACTACTGCTGGCAATCCTCTATTTTGTTGTACAGT
TTTTGAGGGCCACACTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTTGGAATCACAATGGGACGGAGAGATGAGTACCTGCGTTTCCTCTCCTTCTCTCGCCGCTCCCTCTGCAGTAGCGGCCGCCGCAATCTTCCGCCGCAAGAGCCGCC
GTGGCGCCGCCACACCTCTCGCCCCGCCGCGAACGATTCGAACAGCACCGACCAATTGACGGTGGAATCCGCCGTCGAAAGATCGGAGGCCGATAAGATCGTGGACGGCA
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TTTTGAGGGCCACACTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVGITMGRRDEYLRFLSFSRRSLCSSGRRNLPPQEPPWRRHTSRPAANDSNSTDQLTVESAVERSEADKIVDGMDFGELCNEFECISSPLVESTARQLARDILQLRQGDR
SIGNFAVFVKYKDPVRKFTGREKYKRQLWATSALENPTTSVQEMVMVSTSILNIKWTIKGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAISQAFF
WASRYLFASTEAGKDLADSVSSLAGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPSKFFQGEDNFQRDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL