; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0035180 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0035180
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionPre-mRNA splicing factor, putative
Genome locationchr3:16233455..16234380
RNA-Seq ExpressionLag0035180
SyntenyLag0035180
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
PAA71337.1 hypothetical protein BOX15_Mlig005876g1 [Macrostomum lignano]1.5e-1032.09Show/hide
Query:  KKINKSAGRSSKRINKLTSR------FDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKIN---------KLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSS-----NR
        +K+N+  GR S+++N+  SR        R S +   +  ++   K   R S K+N         K   R S+K+N+  GR S+K+NR   R S     +R
Subjt:  KKINKSAGRSSKRINKLTSR------FDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKIN---------KLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSS-----NR

Query:  SSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKIN-----KSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSS-----NRSSEKINKSADRSSKKI
         S K+N+   R S+K+N+   R S+K+N     KS+ +  +R S K+N+   R S+K+N+   R S+K+N+   R S     +R S K+N+   R S+K+
Subjt:  SSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKIN-----KSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSS-----NRSSEKINKSADRSSKKI

Query:  NKPTGRSSKKINKSQ
        N+  GR S+K+N+ +
Subjt:  NKPTGRSSKKINKSQ

PAA71360.1 hypothetical protein BOX15_Mlig020368g1 [Macrostomum lignano]5.2e-0833.16Show/hide
Query:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN
        +K+N+  GR S+++N+   +  R SS        +K+N+   R S K+N+   R S+K+ +  GR S+K+NR   R S+   RS +   K   R S+K+N
Subjt:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN

Query:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ
        +  GR S   K+  KS   +R   R S K+N+   R S+K+ +   R S+K+N+   R S+   RS +   K   R S+K+N+  GR S+K+N+ +
Subjt:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ

QAX24809.1 adhesion protein 1 [Macrostomum lignano]5.2e-0833.16Show/hide
Query:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN
        +K+N+  GR S+++N+   +  R SS        +K+N+   R S K+N+   R S+K+ +  GR S+K+NR   R S+   RS +   K   R S+K+N
Subjt:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN

Query:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ
        +  GR S   K+  KS   +R   R S K+N+   R S+K+ +   R S+K+N+   R S+   RS +   K   R S+K+N+  GR S+K+N+ +
Subjt:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ

SOV75876.1 pre-mRNA splicing factor, putative [Plasmodium reichenowi]1.2e-0437.39Show/hide
Query:  RSETLENSEDPRFRIQPTQDSECQQANRPIIKKINKSAGRSSKRINKLTSRF-DRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEK-INKLADRSSKKINKPTGRSS
        +S++  NS D   +++    ++         K ++KS+  S   IN+ + R  DRSS +S+D+   +  ++S+ RSS++  +K +DRSS K +  +  S 
Subjt:  RSETLENSEDPRFRIQPTQDSECQQANRPIIKKINKSAGRSSKRINKLTSRF-DRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEK-INKLADRSSKKINKPTGRSS

Query:  KKINRSADRSSNRSSEK-INKSADRSS-KKINKPTGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSNR--SSEKINKSA
        + INRS+DRS NRSS++ IN+S+DRSS + IN+ + RS   IN+S+DRSS+RSS+   +S+DRSS   ++ +DRSS + N  +D  +N+  SSEKI +  
Subjt:  KKINRSADRSSNRSSEK-INKSADRSS-KKINKPTGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSNR--SSEKINKSA

Query:  DRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ
        D+  K IN    + +  I  S+
Subjt:  DRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ

XP_013148768.1 PREDICTED: round spermatid basic protein 1-like [Papilio polytes]6.4e-0637.7Show/hide
Query:  KINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKI----NRSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKIN
        K +K+  + +++ +K     ++S  + +++ D +  +KS  R+S+K +K   RSS+K +K   RSS K     ++SAD+S ++SS+K  KS  RS  K +
Subjt:  KINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKI----NRSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKIN

Query:  KPTGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKK
        K   RSS K    +D++ +RSS+K +KS  RSS K +K   RSS K    +D+S +RSS+K +KS  +SS K +KP  R+S K
Subjt:  KPTGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A267FC56 Uncharacterized protein2.5e-0833.16Show/hide
Query:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN
        +K+N+  GR S+++N+   +  R SS        +K+N+   R S K+N+   R S+K+ +  GR S+K+NR   R S+   RS +   K   R S+K+N
Subjt:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN

Query:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ
        +  GR S   K+  KS   +R   R S K+N+   R S+K+ +   R S+K+N+   R S+   RS +   K   R S+K+N+  GR S+K+N+ +
Subjt:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ

A0A267FDU5 Uncharacterized protein7.1e-1132.09Show/hide
Query:  KKINKSAGRSSKRINKLTSR------FDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKIN---------KLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSS-----NR
        +K+N+  GR S+++N+  SR        R S +   +  ++   K   R S K+N         K   R S+K+N+  GR S+K+NR   R S     +R
Subjt:  KKINKSAGRSSKRINKLTSR------FDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKIN---------KLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSS-----NR

Query:  SSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKIN-----KSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSS-----NRSSEKINKSADRSSKKI
         S K+N+   R S+K+N+   R S+K+N     KS+ +  +R S K+N+   R S+K+N+   R S+K+N+   R S     +R S K+N+   R S+K+
Subjt:  SSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKIN-----KSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSS-----NRSSEKINKSADRSSKKI

Query:  NKPTGRSSKKINKSQ
        N+  GR S+K+N+ +
Subjt:  NKPTGRSSKKINKSQ

A0A2P9D4A8 Pre-mRNA splicing factor, putative5.8e-0537.39Show/hide
Query:  RSETLENSEDPRFRIQPTQDSECQQANRPIIKKINKSAGRSSKRINKLTSRF-DRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEK-INKLADRSSKKINKPTGRSS
        +S++  NS D   +++    ++         K ++KS+  S   IN+ + R  DRSS +S+D+   +  ++S+ RSS++  +K +DRSS K +  +  S 
Subjt:  RSETLENSEDPRFRIQPTQDSECQQANRPIIKKINKSAGRSSKRINKLTSRF-DRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEK-INKLADRSSKKINKPTGRSS

Query:  KKINRSADRSSNRSSEK-INKSADRSS-KKINKPTGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSNR--SSEKINKSA
        + INRS+DRS NRSS++ IN+S+DRSS + IN+ + RS   IN+S+DRSS+RSS+   +S+DRSS   ++ +DRSS + N  +D  +N+  SSEKI +  
Subjt:  KKINRSADRSSNRSSEK-INKSADRSS-KKINKPTGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSNR--SSEKINKSA

Query:  DRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ
        D+  K IN    + +  I  S+
Subjt:  DRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ

A0A411ACX2 Adhesion protein 12.5e-0833.16Show/hide
Query:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN
        +K+N+  GR S+++N+   +  R SS        +K+N+   R S K+N+   R S+K+ +  GR S+K+NR   R S+   RS +   K   R S+K+N
Subjt:  KKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADRSSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKIN

Query:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ
        +  GR S   K+  KS   +R   R S K+N+   R S+K+ +   R S+K+N+   R S+   RS +   K   R S+K+N+  GR S+K+N+ +
Subjt:  KPTGRSS---KKINKS--ADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSN---RSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSQ

A0A6G0J559 Uncharacterized protein9.9e-0536.5Show/hide
Query:  QQANRPIIKKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKI-NKSADRSSEKINKLAD-RSSKKINKPTGRSS-----KKINRSADRSSNRSSEKI
        +++N+ + KK NK + + S +  KLT + ++ S++ ++++  +K  NKS  +S++K NK ++ +S+KK NK + + S     KK N+ +++ SN+ S K 
Subjt:  QQANRPIIKKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKI-NKSADRSSEKINKLAD-RSSKKINKPTGRSS-----KKINRSADRSSNRSSEKI

Query:  NKSADRSSKKINKP-TGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKIN-KPTDRSSKKINKLADRSSNRS-SEKIN-KSADRSSKKINKPTGRSSKKI
         KS  +S+KK NK    +S+KK NK +++ SN+ S K  KS  + +KK N K T +S+KK+NK +++ SN+  ++K N KS  +S+KK+NK + + S KI
Subjt:  NKSADRSSKKINKP-TGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKIN-KPTDRSSKKINKLADRSSNRS-SEKIN-KSADRSSKKINKPTGRSSKKI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGATTCAGATTCAGAGATTCAGATCAGAGAACTCAGAGTCCAGAGAATTCTGCCAGAGTCCAGAGTCATCAGAAGTGAGACTCTAGAGAATTCAGAAGATCCAAG
ATTCAGAATTCAACCAACTCAAGACTCAGAATGTCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCAAGAAGATCAACAAGTCAGCAGGCCGATCATCCAAGAGGATCAACAAGCTAA
CAAGCCGATTCGACAGATCATCAAGCCAATCGACCGATCAAGAAGATCAACAAAAGATCAACAAGTCAGCAGACCGATCATCCGAGAAGATCAACAAGTTAGCAGACCGA
TCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAGATCAGCAGACCGATCATCAAACCGATCATCCGAGAAGATCAATAAGTCAGCAGACCG
ATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAATCAGCAGACCGATCATCAAACCGATCATCCGAGAAGATCAATAAGTCAGCAGACC
GATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGACCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGTTAGCAGACCGATCATCGAACCGATCATCCGAGAAGATCAACAAGTCAGCAGAC
CGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGTCACAACAGGCCGATCCAAGAGATCATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGGATTCAGATTCAGAGATTCAGATCAGAGAACTCAGAGTCCAGAGAATTCTGCCAGAGTCCAGAGTCATCAGAAGTGAGACTCTAGAGAATTCAGAAGATCCAAG
ATTCAGAATTCAACCAACTCAAGACTCAGAATGTCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCAAGAAGATCAACAAGTCAGCAGGCCGATCATCCAAGAGGATCAACAAGCTAA
CAAGCCGATTCGACAGATCATCAAGCCAATCGACCGATCAAGAAGATCAACAAAAGATCAACAAGTCAGCAGACCGATCATCCGAGAAGATCAACAAGTTAGCAGACCGA
TCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAGATCAGCAGACCGATCATCAAACCGATCATCCGAGAAGATCAATAAGTCAGCAGACCG
ATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAATCAGCAGACCGATCATCAAACCGATCATCCGAGAAGATCAATAAGTCAGCAGACC
GATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGACCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGTTAGCAGACCGATCATCGAACCGATCATCCGAGAAGATCAACAAGTCAGCAGAC
CGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGTCACAACAGGCCGATCCAAGAGATCATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGDSDSEIQIRELRVQRILPESRVIRSETLENSEDPRFRIQPTQDSECQQANRPIIKKINKSAGRSSKRINKLTSRFDRSSSQSTDQEDQQKINKSADRSSEKINKLADR
SSKKINKPTGRSSKKINRSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTGRSSKKINKSADRSSNRSSEKINKSADRSSKKINKPTDRSSKKINKLADRSSNRSSEKINKSAD
RSSKKINKPTGRSSKKINKSQQADPRDH