; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0035389 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0035389
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionSAP domain-containing protein
Genome locationchr3:20748292..20754450
RNA-Seq ExpressionLag0035389
SyntenyLag0035389
Gene Ontology termsGO:0006807 - nitrogen compound metabolic process (biological process)
GO:0006979 - response to oxidative stress (biological process)
GO:0044238 - primary metabolic process (biological process)
GO:0044260 - cellular macromolecule metabolic process (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0004601 - peroxidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443746.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487261 isoform X1 [Cucumis melo]4.3e-16491.33Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSK L SH H LTLP+ H SFSLN+G +PIRSVLSAP+KRGRKKRQSR QQQL  KDDDST+LE  LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS++L+GDTEGAMQSLRRELS+GLRPLHETFVALVRLFGSKGLA+RGLEILAAME+LNYDIRQAWLIL EELVRNKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
         GLRATDKIYDL+IEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

XP_008443747.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487261 isoform X2 [Cucumis melo]4.3e-16491.33Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSK L SH H LTLP+ H SFSLN+G +PIRSVLSAP+KRGRKKRQSR QQQL  KDDDST+LE  LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS++L+GDTEGAMQSLRRELS+GLRPLHETFVALVRLFGSKGLA+RGLEILAAME+LNYDIRQAWLIL EELVRNKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
         GLRATDKIYDL+IEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

XP_011660243.1 uncharacterized protein LOC101209618 isoform X1 [Cucumis sativus]2.8e-16391.33Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSKFL SH H LTLP  H SFSLN+G +PIRSVLSAP+KRGRKKRQSR QQQL  KD+DST+LE  LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS++L+GDTEGAMQSLRRELSAGL PLHETFVALVRLFGSKGLA+RGLEILAAMEKLNYDIRQAWLIL EELVR+KYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
         GLRATDKIYDL+IEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

XP_022930357.1 uncharacterized protein LOC111436825 isoform X1 [Cucurbita moschata]9.7e-16491.95Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNG-FVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSKFL SH++ LTLPH HHSFSL+NG F PIRSVLS  EKRGRKKRQSRQQQL QKDDDST  EK LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNG-FVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS+ L+ D EGAMQSLR+ELS GLRPLHETFVALVRLFG+KGLA+RGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELV+NKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
        GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

XP_038879291.1 uncharacterized protein LOC120071230 [Benincasa hispida]4.2e-16793.5Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSKFL SH H LTLP+ HHSFSLN+G VPIRSVLSAP+KRGRKKRQ+R QQQLH KD DSTALEK LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS+ L+GDTEGAMQSLRRELSAGL PLHETFVALVRLFGSKGLA+RGLEILAAMEKLNYDIRQAWLIL EELVRNKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
        GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B8T6 uncharacterized protein LOC103487261 isoform X12.1e-16491.33Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSK L SH H LTLP+ H SFSLN+G +PIRSVLSAP+KRGRKKRQSR QQQL  KDDDST+LE  LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS++L+GDTEGAMQSLRRELS+GLRPLHETFVALVRLFGSKGLA+RGLEILAAME+LNYDIRQAWLIL EELVRNKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
         GLRATDKIYDL+IEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

A0A1S3B9H7 uncharacterized protein LOC103487261 isoform X22.1e-16491.33Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSK L SH H LTLP+ H SFSLN+G +PIRSVLSAP+KRGRKKRQSR QQQL  KDDDST+LE  LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSR-QQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS++L+GDTEGAMQSLRRELS+GLRPLHETFVALVRLFGSKGLA+RGLEILAAME+LNYDIRQAWLIL EELVRNKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
         GLRATDKIYDL+IEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

A0A6J1DBV3 uncharacterized protein LOC1110195955.5e-15789.85Show/hide
Query:  MSKFLF-SHTHFLTLPHIHHSFSL--NNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAG
        MSK L  SHTH LTLPH   S  L  +NG +PIRSVLSAPEKRGRKKRQ R    H KDD STALEKGLRFTFMEELMDRAR+ D +GVSDVIYDMVAAG
Subjt:  MSKFLF-SHTHFLTLPHIHHSFSL--NNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAG

Query:  LSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKG
        LSPGPRSFHGLVVS+SL+GDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEIL+AMEKLNYDIRQAWLILI+ELVRNKYLEDAN+ FLKG
Subjt:  LSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKG

Query:  AKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRV
        AKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGED MKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRV
Subjt:  AKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRV

Query:  QDVAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        QDVAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  QDVAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

A0A6J1EQ88 uncharacterized protein LOC111436825 isoform X14.7e-16491.95Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNG-FVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSKFL SH++ LTLPH HHSFSL+NG F PIRSVLS  EKRGRKKRQSRQQQL QKDDDST  EK LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNG-FVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS+ L+ D EGAMQSLR+ELS GLRPLHETFVALVRLFG+KGLA+RGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELV+NKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
        GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

A0A6J1L2D9 uncharacterized protein LOC111499221 isoform X19.8e-16291.33Show/hide
Query:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFV-PIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
        MSKFL SH+  LTLPH HHSFSL+N  + PIRSVLS  EKRGRKKRQSRQQQL QKD DST LEK LRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS
Subjt:  MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFV-PIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLS

Query:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK
        PGPRSFHGLVVS+ L+ D EGAMQSLR+ELS GLRPLHETFVALVRLFG+KGLA+RGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELV+NKYLEDAN+VFLKGAK
Subjt:  PGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAK

Query:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
        GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD
Subjt:  GGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQD

Query:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA
        VAELLGMMVEDHKRLQPN+RTYA
Subjt:  VAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04504 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g098204.6e-0722.66Show/hide
Query:  VIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQ-AWLILIEELVRNKYL
        V+ +MV   +SP   +F+ L+  +  D +  G+M+  +  L   ++P   ++ +L+    + G  S  + +   M           +  LI    +N  L
Subjt:  VIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQ-AWLILIEELVRNKYL

Query:  EDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQA
        ++A  +F      G   T ++Y++LI+  CK G   +   +  EME  G +     +NCL++     G  E A   F+ +        PD  T++ +++ 
Subjt:  EDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQA

Query:  YTR
        Y R
Subjt:  YTR

Q0WPZ6 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g171401.3e-0623.24Show/hide
Query:  VSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRN
        VS +  DMV  G++P   +F+ L+ +       + A +        G +P   TF  LVR +   GL  +GLE+L AME       +  +  ++    R 
Subjt:  VSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRN

Query:  KYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMA----TTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTET
           +D+ ++  K  + GL      ++  I   CK G   +A  I  +ME    +      +  +N +L      G+ E A + FE++   +D      ++
Subjt:  KYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMA----TTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTET

Query:  YNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKRLQPNIRTY
        YN  +Q   R   +   + V + +       K + P+I +Y
Subjt:  YNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKRLQPNIRTY

Q9LMH5 Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g138008.6e-0621.66Show/hide
Query:  VIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDI-RQAWLILIEELVRNKYL
        V+ DM   G+ P    +  ++  +  + +   A+    + L    R       ++++ +   G  S   ++     + N  + R  + +  + L +   +
Subjt:  VIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDI-RQAWLILIEELVRNKYL

Query:  EDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQA
        E+A ++F +    G+      Y  LI   C  G  S+A ++  EM+  G+      +N L    AT G+ + AF T + ME     +KP   T+N VI+ 
Subjt:  EDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQA

Query:  YTRAESYDRVQDVAELL
           A   D+ +   E L
Subjt:  YTRAESYDRVQDVAELL

Q9LN22 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g20300, mitochondrial1.5e-0525.61Show/hide
Query:  ETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAG
        ETF  L+R +   GLAS  +     ME       + A+ I+I  L R +   +A Q F    K        +Y  L+   C+AG+ S A ++  EM+ AG
Subjt:  ETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAG

Query:  RMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV
             + ++ ++     CG    A   F +M   +    P+  T+N +++ + +A   ++V  V
Subjt:  RMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV

Q9LYZ9 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g028601.4e-0825Show/hide
Query:  KRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMD-RARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVA
        KR S  Q+  Q  ++  A            L+D   ++H P     V+ +MV  G SP   +++ L+ +Y+ DG  + AM+   +    G +P   T+  
Subjt:  KRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMD-RARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVA

Query:  LVRLFGSKGLASRGLEILAAME----KLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRM
        L+  F   G     + I   M     K N     A++ +     R K+ E   ++F +    GL      ++ L+    + G  S    +  EM+ AG +
Subjt:  LVRLFGSKGLASRGLEILAAME----KLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRM

Query:  ATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV-AELLGMMVEDHKRLQPNIRTY
             FN L+S  + CG  E A + +  M   +  + PD  TYN V+ A  R   +++ + V AE+      +  R +PN  TY
Subjt:  ATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV-AELLGMMVEDHKRLQPNIRTY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09820.1 Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein3.2e-0822.66Show/hide
Query:  VIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQ-AWLILIEELVRNKYL
        V+ +MV   +SP   +F+ L+  +  D +  G+M+  +  L   ++P   ++ +L+    + G  S  + +   M           +  LI    +N  L
Subjt:  VIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQ-AWLILIEELVRNKYL

Query:  EDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQA
        ++A  +F      G   T ++Y++LI+  CK G   +   +  EME  G +     +NCL++     G  E A   F+ +        PD  T++ +++ 
Subjt:  EDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQA

Query:  YTR
        Y R
Subjt:  YTR

AT1G20300.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.0e-0625.61Show/hide
Query:  ETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAG
        ETF  L+R +   GLAS  +     ME       + A+ I+I  L R +   +A Q F    K        +Y  L+   C+AG+ S A ++  EM+ AG
Subjt:  ETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAG

Query:  RMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV
             + ++ ++     CG    A   F +M   +    P+  T+N +++ + +A   ++V  V
Subjt:  RMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV

AT2G17140.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein9.4e-0823.24Show/hide
Query:  VSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRN
        VS +  DMV  G++P   +F+ L+ +       + A +        G +P   TF  LVR +   GL  +GLE+L AME       +  +  ++    R 
Subjt:  VSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLN-YDIRQAWLILIEELVRN

Query:  KYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMA----TTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTET
           +D+ ++  K  + GL      ++  I   CK G   +A  I  +ME    +      +  +N +L      G+ E A + FE++   +D      ++
Subjt:  KYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRMA----TTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTET

Query:  YNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKRLQPNIRTY
        YN  +Q   R   +   + V + +       K + P+I +Y
Subjt:  YNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKRLQPNIRTY

AT3G04260.1 plastid transcriptionally active 37.5e-13074.43Show/hide
Query:  GFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDD--------STALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGD
        G   IR  +SAPEK+ R++R+ ++    + DD          +ALE+ LR TFM+ELM+RARN D  GVS+VIYDM+AAGLSPGPRSFHGLVV+++L+GD
Subjt:  GFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDD--------STALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGD

Query:  TEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDC
         +GAM SLR+EL AG RPL ET +ALVRL GSKG A+RGLEILAAMEKL YDIRQAWLIL+EEL+R  +LEDAN+VFLKGA+GG+RATD++YDL+IEEDC
Subjt:  TEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDC

Query:  KAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKRLQPN
        KAGDHSNAL+ISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPE+A++TFENMEYGE +MKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKR+QPN
Subjt:  KAGDHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKRLQPN

Query:  IRTYA
        ++TYA
Subjt:  IRTYA

AT5G02860.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.0e-0925Show/hide
Query:  KRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMD-RARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVA
        KR S  Q+  Q  ++  A            L+D   ++H P     V+ +MV  G SP   +++ L+ +Y+ DG  + AM+   +    G +P   T+  
Subjt:  KRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMD-RARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVVSYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVA

Query:  LVRLFGSKGLASRGLEILAAME----KLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRM
        L+  F   G     + I   M     K N     A++ +     R K+ E   ++F +    GL      ++ L+    + G  S    +  EM+ AG +
Subjt:  LVRLFGSKGLASRGLEILAAME----KLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAGDHSNALEISYEMEAAGRM

Query:  ATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV-AELLGMMVEDHKRLQPNIRTY
             FN L+S  + CG  E A + +  M   +  + PD  TYN V+ A  R   +++ + V AE+      +  R +PN  TY
Subjt:  ATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDV-AELLGMMVEDHKRLQPNIRTY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCAAATTCCTCTTCTCTCACACCCACTTTCTCACCCTTCCCCACATACACCATTCCTTCTCTCTCAACAATGGCTTCGTCCCCATCCGCTCAGTCCTCTCGGCTCC
AGAGAAGCGAGGCAGAAAGAAGCGCCAGTCGCGGCAGCAACAGTTACACCAAAAGGATGACGATTCCACTGCGCTCGAGAAGGGCCTTCGCTTCACTTTCATGGAGGAGC
TCATGGACCGCGCCAGAAACCACGACCCCCTCGGCGTTTCTGATGTCATTTACGATATGGTTGCCGCTGGATTGAGCCCTGGACCTCGCTCGTTCCATGGCTTGGTTGTT
TCTTATTCTCTCGATGGTGATACCGAGGGAGCGATGCAATCTCTGAGAAGGGAACTAAGTGCTGGACTTCGTCCTCTTCATGAAACTTTTGTTGCATTAGTTCGGTTGTT
TGGTTCCAAGGGTCTTGCTTCTAGAGGCTTAGAAATCCTTGCAGCCATGGAGAAATTGAATTATGACATTCGCCAAGCTTGGCTCATTCTTATTGAGGAACTCGTAAGGA
ACAAATATTTAGAAGATGCCAATCAAGTGTTCTTAAAGGGTGCTAAAGGGGGCCTCAGAGCCACGGACAAGATTTATGATCTTCTAATTGAGGAAGACTGTAAAGCCGGG
GATCATTCAAATGCCTTAGAGATCTCATATGAAATGGAGGCTGCTGGGCGGATGGCGACAACCTTTCATTTCAATTGCCTTCTTAGTGTCCAGGCTACTTGTGGAATACC
TGAAATTGCTTTCTCAACATTTGAGAACATGGAATATGGAGAAGATTACATGAAGCCCGATACTGAGACATATAATTGGGTAATCCAAGCATATACAAGAGCTGAATCTT
ATGATAGGGTGCAAGATGTTGCTGAGTTACTTGGCATGATGGTTGAAGACCACAAGCGCCTACAGCCTAACATCAGAACCTACGCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCAAATTCCTCTTCTCTCACACCCACTTTCTCACCCTTCCCCACATACACCATTCCTTCTCTCTCAACAATGGCTTCGTCCCCATCCGCTCAGTCCTCTCGGCTCC
AGAGAAGCGAGGCAGAAAGAAGCGCCAGTCGCGGCAGCAACAGTTACACCAAAAGGATGACGATTCCACTGCGCTCGAGAAGGGCCTTCGCTTCACTTTCATGGAGGAGC
TCATGGACCGCGCCAGAAACCACGACCCCCTCGGCGTTTCTGATGTCATTTACGATATGGTTGCCGCTGGATTGAGCCCTGGACCTCGCTCGTTCCATGGCTTGGTTGTT
TCTTATTCTCTCGATGGTGATACCGAGGGAGCGATGCAATCTCTGAGAAGGGAACTAAGTGCTGGACTTCGTCCTCTTCATGAAACTTTTGTTGCATTAGTTCGGTTGTT
TGGTTCCAAGGGTCTTGCTTCTAGAGGCTTAGAAATCCTTGCAGCCATGGAGAAATTGAATTATGACATTCGCCAAGCTTGGCTCATTCTTATTGAGGAACTCGTAAGGA
ACAAATATTTAGAAGATGCCAATCAAGTGTTCTTAAAGGGTGCTAAAGGGGGCCTCAGAGCCACGGACAAGATTTATGATCTTCTAATTGAGGAAGACTGTAAAGCCGGG
GATCATTCAAATGCCTTAGAGATCTCATATGAAATGGAGGCTGCTGGGCGGATGGCGACAACCTTTCATTTCAATTGCCTTCTTAGTGTCCAGGCTACTTGTGGAATACC
TGAAATTGCTTTCTCAACATTTGAGAACATGGAATATGGAGAAGATTACATGAAGCCCGATACTGAGACATATAATTGGGTAATCCAAGCATATACAAGAGCTGAATCTT
ATGATAGGGTGCAAGATGTTGCTGAGTTACTTGGCATGATGGTTGAAGACCACAAGCGCCTACAGCCTAACATCAGAACCTACGCGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSKFLFSHTHFLTLPHIHHSFSLNNGFVPIRSVLSAPEKRGRKKRQSRQQQLHQKDDDSTALEKGLRFTFMEELMDRARNHDPLGVSDVIYDMVAAGLSPGPRSFHGLVV
SYSLDGDTEGAMQSLRRELSAGLRPLHETFVALVRLFGSKGLASRGLEILAAMEKLNYDIRQAWLILIEELVRNKYLEDANQVFLKGAKGGLRATDKIYDLLIEEDCKAG
DHSNALEISYEMEAAGRMATTFHFNCLLSVQATCGIPEIAFSTFENMEYGEDYMKPDTETYNWVIQAYTRAESYDRVQDVAELLGMMVEDHKRLQPNIRTYA