; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0035638 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0035638
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionReverse transcriptase domain-containing protein
Genome locationchr3:26023318..26023788
RNA-Seq ExpressionLag0035638
SyntenyLag0035638
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_021621434.1 uncharacterized protein LOC110621459 [Manihot esculenta]2.6e-2949.26Show/hide
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        GLS +L +AE+  R+ G K + RCP ISHLFFADDSL FF A+  E  S++ IL +Y  ASGQ +NF+KS I F+P  V SV+ +I  IL V    SH+ 
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        YLGLPS + +N+ +   F+KER+WK+I  W  +  S
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XP_023901742.1 uncharacterized protein LOC112013579 [Quercus suber]1.7e-2848.2Show/hide
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        GLS+++ EA    +I+G+ + R CP+I+HLFFADDSL F +AK+ E  ++  IL  YE ASGQ IN DKS + FSP T   ++E I  IL     + H++
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        YLGLPS + K++      VK+RV K++ GWKGKL S+GG
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XP_023924111.1 uncharacterized protein LOC112035525 [Quercus suber]2.2e-2847.48Show/hide
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        G S+++ EA    +I+G+ + R CP+I+HLFFADDSL F +AK  E  ++  IL  YE  SGQ IN DKS + FSP T   ++E I  IL     + HN+
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        YLGLPS + K++T     +K+RV K++ GWKGKL S+GG
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XP_030939975.1 uncharacterized protein LOC115964883 [Quercus lobata]9.8e-2947.48Show/hide
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        GL S++ +AE +  I G+ L    P +SHLFFADDSL F RA   E  S+ EIL  YE ASGQ IN +K+ + FSP T P VQE+I  +L V  T ++ +
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        YLGLPSF+ + +  +  +++ER+W ++QGWK +L S GG
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XP_030946812.1 uncharacterized protein LOC115971195 [Quercus lobata]5.8e-2947.48Show/hide
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        GL S++ + E +  I G+ L    P +SHLFFADDSL F RA   E  S+ EIL  YE ASGQ IN +K+ + FSP T P VQE+I  +L V  T ++ +
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        YLGLPSF+ + +  +  +++ERVW+++QGWK +L S GG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5B7C6K9 zf-RVT domain-containing protein3.1e-2847.45Show/hide
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        S++LL+AEA NRI G+ +AR  P ISHLFFADDSL F  A + +   +  I+  Y  ASGQ INFDKS +SFS     S +++I  IL V + + HN+YL
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        GLPS + +++      ++ERVW+++QGWK +L S  G
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A0A6J5TIF9 Reverse transcriptase domain-containing protein4.0e-2842.86Show/hide
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        S++L +AE  +R+ G+ +A   P I+HLFFADDSL F  A  +E   ++ I G YE ASGQ +N  KS + FSP T   +Q+DI Q+L V I   H +YL
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        GLP+ + K++    + VK+RVW ++ GW+GKL S  G +  +  +C+
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A0A6J5UN51 Reverse transcriptase domain-containing protein4.0e-2842.18Show/hide
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        S++L +AE  +R+ G+ +A   P I+HLFFADDSL F  A  +E   ++ I G YE ASGQ +N  KS + FSP T   +Q+DI Q+L V +   H +YL
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        GLP+ + K++    + VK+RVW ++ GW+GKL S  G +  +  +C+
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A0A803PVI9 Uncharacterized protein4.0e-2843.62Show/hide
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        GLS +L   E    + GLK+AR  P +SHLFFADDSL   RA      +++  L  Y RASGQ +N DKSV+SFSP T+ SVQ  + QIL + I   H +
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        YLGLPS+  +++      +KE++WK +  W+ +LFS+GG +  L  + +
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A0A803QHU6 Uncharacterized protein4.0e-2844.6Show/hide
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        GLS +L   E    ++GL+L R  P +SHL FADDSL F ++ +   RS++  L +Y +ASGQ +N DKSV+SFSP T  + Q    Q LQ+ IT  H +
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        YLGLPS+  ++++     +KER+WK +  W  K+FS+GG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGCTGTCCAGTATGCTTTTGGAGGCTGAAGCTACCAATAGGATTTCAGGTCTAAAGCTGGCTAGACGATGCCCGATAATATCTCACTTATTTTTTGCAGATGATAG
TTTGTTTTTCTTCAGGGCTAAGAAGAGCGAGACCCGGAGTGTGCAGGAGATACTGGGAAGTTATGAGCGGGCGTCTGGGCAGACCATCAATTTTGACAAATCTGTCATCT
CTTTTAGCCCATGTACGGTGCCCAGTGTGCAGGAAGACATAGGCCAGATTCTTCAGGTCCAGATTACAGCATCCCATAACCAATACTTGGGGCTCCCTTCGTTCATGCCC
AAGAACAGAACAAGCACTTTGAAGTTTGTCAAGGAACGGGTGTGGAAGCAGATTCAGGGGTGGAAGGGGAAACTATTCTCTGTAGGAGGCGTGAAATCCTGCTTAAATCC
ATTGTGTAGGCTATCCCATGCTACTCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGCTGTCCAGTATGCTTTTGGAGGCTGAAGCTACCAATAGGATTTCAGGTCTAAAGCTGGCTAGACGATGCCCGATAATATCTCACTTATTTTTTGCAGATGATAG
TTTGTTTTTCTTCAGGGCTAAGAAGAGCGAGACCCGGAGTGTGCAGGAGATACTGGGAAGTTATGAGCGGGCGTCTGGGCAGACCATCAATTTTGACAAATCTGTCATCT
CTTTTAGCCCATGTACGGTGCCCAGTGTGCAGGAAGACATAGGCCAGATTCTTCAGGTCCAGATTACAGCATCCCATAACCAATACTTGGGGCTCCCTTCGTTCATGCCC
AAGAACAGAACAAGCACTTTGAAGTTTGTCAAGGAACGGGTGTGGAAGCAGATTCAGGGGTGGAAGGGGAAACTATTCTCTGTAGGAGGCGTGAAATCCTGCTTAAATCC
ATTGTGTAGGCTATCCCATGCTACTCCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGLSSMLLEAEATNRISGLKLARRCPIISHLFFADDSLFFFRAKKSETRSVQEILGSYERASGQTINFDKSVISFSPCTVPSVQEDIGQILQVQITASHNQYLGLPSFMP
KNRTSTLKFVKERVWKQIQGWKGKLFSVGGVKSCLNPLCRLSHATP