; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0035678 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0035678
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr3:26954073..26955380
RNA-Seq ExpressionLag0035678
SyntenyLag0035678
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8553197.1 hypothetical protein EYB25_004579 [Talaromyces marneffei]1.0e-0562.5Show/hide
Query:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSSKALLSTP
        PSPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++ST  SPSS A++STP
Subjt:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSSKALLSTP

QGA16673.1 hypothetical protein EYB26_004340 [Talaromyces marneffei]1.0e-0562.5Show/hide
Query:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSSKALLSTP
        PSPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++ST  SPSS A++STP
Subjt:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSSKALLSTP

XP_002147803.1 class III chitinase ChiA1 [Talaromyces marneffei ATCC 18224]1.0e-0562.5Show/hide
Query:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSSKALLSTP
        PSPSS A++ST PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++S  PSPSS A++ST PSPSS A++ST  SPSS A++STP
Subjt:  PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSSKALLSTP

XP_018635152.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Toxoplasma gondii ME49]6.6e-0552.38Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS
        L PSS   S  S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++P  S     S+  S
Subjt:  LPPSSKVPSRVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS

Query:  PSSKA
        PSS A
Subjt:  PSSKA

XP_031027822.1 uncharacterized protein SmJEL517_g00105 [Synchytrium microbalum]6.0e-0645.9Show/hide
Query:  PPSSKVPS------RVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALL
        P +S  PS      + S APSP +  L S APSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L S APSP +  L 
Subjt:  PPSSKVPS------RVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALL

Query:  STT-LSPSSKALLSTPPFEGSP
        S    SP+   +LS+     +P
Subjt:  STT-LSPSSKALLSTPPFEGSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0F7V8R5 RNA helicase, putative1.2e-0446.31Show/hide
Query:  PSSKVPSRVSLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS
        P+S   S  SL+P  SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS   S
Subjt:  PSSKVPSRVSLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS

Query:  PSSKALLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSTLLLFKCLAAVDSLVPLHLQML
        PSS   LS      S    S +      L LF+ +    S +PL   +L
Subjt:  PSSKALLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSTLLLFKCLAAVDSLVPLHLQML

A0A507CAM6 Uncharacterized protein2.9e-0645.9Show/hide
Query:  PPSSKVPS------RVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALL
        P +S  PS      + S APSP +  L S APSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L S APSP +  L 
Subjt:  PPSSKVPS------RVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALL

Query:  STT-LSPSSKALLSTPPFEGSP
        S    SP+   +LS+     +P
Subjt:  STT-LSPSSKALLSTPPFEGSP

S7UZX5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase3.6e-0446.43Show/hide
Query:  SSKVPSRVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSS
        ++ + SR+  +P P S       PS SS +  S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++ S SS
Subjt:  SSKVPSRVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLSPSS

Query:  KALLSTPPFEGS
         A  S+ PF+ S
Subjt:  KALLSTPPFEGS

S8G1F0 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase3.2e-0552.38Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS
        L PSS   S  S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++P  S     S+  S
Subjt:  LPPSSKVPSRVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS

Query:  PSSKA
        PSS A
Subjt:  PSSKA

V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)1.2e-0446.31Show/hide
Query:  PSSKVPSRVSLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS
        P+S   S  SL+P  SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS   S
Subjt:  PSSKVPSRVSLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTTLS

Query:  PSSKALLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSTLLLFKCLAAVDSLVPLHLQML
        PSS   LS      S    S +      L LF+ +    S +PL   +L
Subjt:  PSSKALLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSTLLLFKCLAAVDSLVPLHLQML

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGCTGCGATGCAGTTCCTTCTCTTCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGTTCCGCTACAGTTCCTTCTCTCCAA
GTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCACGTTGCTTCACTGCAGTTCCTTGCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTTGCTTCGTCGTAGTTCCTTCTCTCCAA
GTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCTCACGTTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGCGCTTTGCTGCAATTCCTTCTCTCCA
ACTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCACTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTCTGAAGGTTCTCACGTGCTT
CGGTGAAGTTCATTCCTCCCAAGTTCAAAGGTTCTTACGCGCTTCGCTACAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTTCGAAGGTTCTCA
CGCGCTGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGCTGCGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCATGCTCTTCGCTGCTACC
TTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCCCTCACGCGTTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCT
CTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCCAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCCAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCT
CCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCACTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
ACTACTCTTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACCCCTCCTTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCAACGTTGCTCCTTTTCAA
ATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCTTGTTCCACTCCATCTTCAAATGTTGGCAGTTGACGGCGTCCGATGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGCTGCGATGCAGTTCCTTCTCTTCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGTTCCGCTACAGTTCCTTCTCTCCAA
GTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCACGTTGCTTCACTGCAGTTCCTTGCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTTGCTTCGTCGTAGTTCCTTCTCTCCAA
GTACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCGAAGGTTCTCTCACGTTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGCGCTTTGCTGCAATTCCTTCTCTCCA
ACTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCACTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTCTGAAGGTTCTCACGTGCTT
CGGTGAAGTTCATTCCTCCCAAGTTCAAAGGTTCTTACGCGCTTCGCTACAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGTTCCTTCCTCCAAATTCGAAGGTTTCGAAGGTTCTCA
CGCGCTGCGCTTCGTTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGCTGCGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCATGCTCTTCGCTGCTACC
TTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCCCTCACGCGTTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCT
CTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCCAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCCAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCT
CCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCACTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
ACTACTCTTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACCCCTCCTTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCAACGTTGCTCCTTTTCAA
ATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCTTGTTCCACTCCATCTTCAAATGTTGGCAGTTGACGGCGTCCGATGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKVLLLQVRRLLHCCDAVPSLQVQRFSRVPLQFLLSKYEGSLLQVEGSHVASLQFLAPSSKVLTLLRRSSFSPSTKVLSSKSKVLSRCFAAVPSSKFEGFHALCCNSFSP
TSKVLTHFATVHFLQVQRFSRTSVKFLPPSLKVLTCFGEVHSSQVQRFLRASLQFLPPSSKFLPPNSKVSKVLTRCASLQFLPPSSKVLMRFAAQFLPPSLKVLMLFAAT
FLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRVSLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLS
TTLSPSSKALLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSTLLLFKCLAAVDSLVPLHLQMLAVDGVRCASSSNVGS