; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0035979 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0035979
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr3:35668217..35669683
RNA-Seq ExpressionLag0035979
SyntenyLag0035979
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8553197.1 hypothetical protein EYB25_004579 [Talaromyces marneffei]1.6e-0651.05Show/hide
Query:  ASLAPSPSSKALLS--VATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSS
        +S A S SS A+ S   A+   VR  + +      PS   P+  S  PSPSS A++ST PSPSS A++S   SPSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS
Subjt:  ASLAPSPSSKALLS--VATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSS

Query:  KVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
          ++S  PS SS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  KVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

MBP7963185.1 PKD domain-containing protein [Caldilineaceae bacterium]8.2e-0638.32Show/hide
Query:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPS
        PS      A+L PSPS    ++T PSPS    ++   SPS    ++TTPSPS    ++T PSPS  + ++  PS S    ++T PSPS     +T PSPS
Subjt:  PSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPS

Query:  SKVLLST
          +  +T
Subjt:  SKVLLST

QGA16673.1 hypothetical protein EYB26_004340 [Talaromyces marneffei]1.6e-0651.05Show/hide
Query:  ASLAPSPSSKALLS--VATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSS
        +S A S SS A+ S   A+   VR  + +      PS   P+  S  PSPSS A++ST PSPSS A++S   SPSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS
Subjt:  ASLAPSPSSKALLS--VATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSS

Query:  KVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
          ++S  PS SS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  KVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

XP_002147803.1 class III chitinase ChiA1 [Talaromyces marneffei ATCC 18224]6.3e-0647.4Show/hide
Query:  ASLAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLA-------------PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSK
        +S A S SS A+ S A+       S A+       S  P+ +S A             PSPSS A++ST PSPSS A++S   SPSS A++S TPSPSS 
Subjt:  ASLAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLA-------------PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
        A++ST PSPSS  ++S  PS SS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  ALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

XP_031027822.1 uncharacterized protein SmJEL517_g00105 [Synchytrium microbalum]1.8e-0543.44Show/hide
Query:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALL
        P +S  PS      +AS APSP +  L S APSP +  L S A SP +  L S  PSP +  L S APSP +  L SAAPS  +  L S APSP +  L 
Subjt:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALL

Query:  STAP-SPSSKVLLSTPLFEGSP
        S AP SP+   +LS+     +P
Subjt:  STAP-SPSSKVLLSTPLFEGSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0F7V8R5 RNA helicase, putative4.4e-0554.63Show/hide
Query:  PSSKVPSRASLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPS
        P+S   S  SL+P  SPSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS A S SS   LS A SPSS   LS A S
Subjt:  PSSKVPSRASLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPS

Query:  PSSKVLLS
        PSS   LS
Subjt:  PSSKVLLS

A0A507CAM6 Uncharacterized protein8.8e-0643.44Show/hide
Query:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALL
        P +S  PS      +AS APSP +  L S APSP +  L S A SP +  L S  PSP +  L S APSP +  L SAAPS  +  L S APSP +  L 
Subjt:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALL

Query:  STAP-SPSSKVLLSTPLFEGSP
        S AP SP+   +LS+     +P
Subjt:  STAP-SPSSKVLLSTPLFEGSP

A0A7C8H5H8 Chitinase8.0e-0751.05Show/hide
Query:  ASLAPSPSSKALLS--VATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSS
        +S A S SS A+ S   A+   VR  + +      PS   P+  S  PSPSS A++ST PSPSS A++S   SPSS A++S TPSPSS A++ST PSPSS
Subjt:  ASLAPSPSSKALLS--VATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSS

Query:  KVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
          ++S  PS SS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  KVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

B6QFQ7 Chitinase3.0e-0647.4Show/hide
Query:  ASLAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLA-------------PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSK
        +S A S SS A+ S A+       S A+       S  P+ +S A             PSPSS A++ST PSPSS A++S   SPSS A++S TPSPSS 
Subjt:  ASLAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLA-------------PSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP
        A++ST PSPSS  ++S  PS SS A++ST PSPSS A++ST PSPSS  ++STP
Subjt:  ALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTP

V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)4.4e-0554.63Show/hide
Query:  PSSKVPSRASLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPS
        P+S   S  SL+P  SPSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS A S SS   LS A SPSS   LS A S
Subjt:  PSSKVPSRASLAP--SPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPS

Query:  PSSKVLLS
        PSS   LS
Subjt:  PSSKVLLS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCGACCCCGGCCGCTACTGCTACAAGAACTCCATCAAAAAGAATGAATTATACGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACCTT
CCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCT
CCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACTTCTCCAAGTTCGAAGGCACTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
ACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCAAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTAC
TGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCTTTTTGAAGGTTCACCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAGGTTCATCGTTGCTCCTTTTCAAATG
TTTGGCGGCGGTTGATGTCCTCGTTCCGCTTCATCTTCAAATGTTGTCATCAAAGTGACCGGTCTAGACAAGTGGTGAAGTCACTGCAATTGAATCTGATGACGACCGTT
GTAGGCGAGTCGGGTCTGGTGACCACCCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAGTAAAATGGGGACTGGTCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCGACCCCGGCCGCTACTGCTACAAGAACTCCATCAAAAAGAATGAATTATACGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACCTT
CCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCT
CCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACTTCTCCAAGTTCGAAGGCACTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCC
ACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCAAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCTAC
TGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCTTTTTGAAGGTTCACCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAGGTTCATCGTTGCTCCTTTTCAAATG
TTTGGCGGCGGTTGATGTCCTCGTTCCGCTTCATCTTCAAATGTTGTCATCAAAGTGACCGGTCTAGACAAGTGGTGAAGTCACTGCAATTGAATCTGATGACGACCGTT
GTAGGCGAGTCGGGTCTGGTGACCACCCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAGTAAAATGGGGACTGGTCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIDPGRYCYKNSIKKNELYASLAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATSPSSKALLSTTPSPSSKALLS
TAPSPSSKVLLSAAPSQSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSTPLFEGSPLRFSFSKFEVHRCSFSNVWRRLMSSFRFIFKCCHQSDRSRQVVKSLQLNLMTTV
VGESGLVTTPAGYSDHPVKWGLV