; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0036108 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0036108
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr3:39097985..39100403
RNA-Seq ExpressionLag0036108
SyntenyLag0036108
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_007894292.2 proliferation marker protein Ki-67 [Callorhinchus milii]5.0e-0634.24Show/hide
Query:  SPNTKVLSSKSKVLSR--CFAAVPSSKFEGFHALCCSSFSPSLKVLTHFATVHFLQVQRFSRASVKFLPPSLKVLTCFGEVPSSQVRRFLRVSLQFLPPS
        SP  K L++K+    R    A  PS    G  +L   S SP  K L         +     R S+    PS    +   + PS +     R SL    PS
Subjt:  SPNTKVLSSKSKVLSR--CFAAVPSSKFEGFHALCCSSFSPSLKVLTHFATVHFLQVQRFSRASVKFLPPSLKVLTCFGEVPSSQVRRFLRVSLQFLPPS

Query:  SKFLPLSSKVPS--RPSFA---PSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK
             L++K PS  R S A   PSP  K L +  PSP   +L +  PSP  K+L +  PSP  K+L + +PSP  K+L + TPSP   +L     SP  K
Subjt:  SKFLPLSSKVPS--RPSFA---PSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLAA
        +L + +PSP  K+L + +PS   K L +  P   SP R S +    SP L  K LAA
Subjt:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLAA

XP_023813560.1 early nodulin-like protein 2 isoform X3 [Oryzias latipes]2.5e-0550Show/hide
Query:  PPSSKFLPLSSKVPSRPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSP------SSKALLSTTPSPSLKALLFAARS
        PPS+K  P  S  PS PS APSPS+K  LS AP  S+   LS  PSP      S APSPS+K  LS +PSP      S+K  LSTTPSPS    L    S
Subjt:  PPSSKFLPLSSKVPSRPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSP------SSKALLSTTPSPSLKALLFAARS

Query:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSQS
        PS+   LS  PSPS+  L S  PS S
Subjt:  PSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSQS

XP_031027822.1 uncharacterized protein SmJEL517_g00105 [Synchytrium microbalum]2.3e-0644.96Show/hide
Query:  PLSSKVPS------RPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSKALL
        P++S  PS      + S APSP +  L SAAPSP ++ L SAAPSP +  L SAAPSP +  L S +PSP +  L S  PSP    L  AA SP +  L 
Subjt:  PLSSKVPS------RPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSKALL

Query:  STAP-SPS-SKALLSTAPSQSSKVLLSTP
        S AP SP+ S  L S APS +   ++++P
Subjt:  STAP-SPS-SKALLSTAPSQSSKVLLSTP

XP_038842682.1 zinc finger protein 260-like [Salvelinus namaycush]7.0e-0836.5Show/hide
Query:  PSSKFLPLSSKVPS---RPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK
        PS + LPLSS  PS    P  +P PS + L  ++P PS  AL  ++P PS +ALL ++P PS +ALL +SP PS +AL  ++P PS +AL  ++  PS +
Subjt:  PSSKFLPLSSKVPS---RPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVL-LSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLAAVDSRVPLHLHMLAVDGVRCASSSNASLVITPSRYYSHQSDWS
        AL  ++P PS +AL  ++P  S + L LS+P      L  S        LL   C     SR   H    + DG         S V T      HQ   S
Subjt:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVL-LSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLAAVDSRVPLHLHMLAVDGVRCASSSNASLVITPSRYYSHQSDWS

XP_043123828.1 uncharacterized protein Aspvir_004669 [Aspergillus viridinutans]1.1e-0532.08Show/hide
Query:  LSSKVPSRP--SFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSKALLSTAPS
        LS   PS P  S +  PSS  + SA PSPSS+A+ S+ P PSS  ++S  PSPSS A+ S+SP PSS  ++S TP            SPSS A+ S+ P+
Subjt:  LSSKVPSRP--SFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSKALLSTAPS

Query:  PSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEGSPLRFSFSKFEG--SPLLLFKCLAAVDSRVPLHLHMLAVDGVRCASS--------------SNASLVITPSRYY
        PSS  ++    + SS V  STP    +P   S     G  S        + V S  P+ L    + G   +SS              S+++ VI  +   
Subjt:  PSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEGSPLRFSFSKFEG--SPLLLFKCLAAVDSRVPLHLHMLAVDGVRCASS--------------SNASLVITPSRYY

Query:  SHQSDWSRQVMKSLQVKLMTTVVGESSLVTTPAGNYSHQSDWSRQVLKSLQVKLMTTVVTTPAGN
        S     S  V  S  V   T V+  +S +++P  + S  +  S     S  V   T+  +TPA +
Subjt:  SHQSDWSRQVMKSLQVKLMTTVVGESSLVTTPAGNYSHQSDWSRQVLKSLQVKLMTTVVTTPAGN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0F7V8R5 RNA helicase, putative2.1e-0548.59Show/hide
Query:  PPSSKFLPLSSKVPSRPSFAP--SPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK
        P SS  L  +S   S PS +P  SPSS   LS A SPSS+  LS A SPSS   LS A SPSS   LS + SPSS   LS   SPS    L  A SPSS 
Subjt:  PPSSKFLPLSSKVPSRPSFAP--SPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLL----STPPFEGSPLR
          LS A SPSS   LS A S+   + L    S  P E S LR
Subjt:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLL----STPPFEGSPLR

A0A1I8IUL4 DDE_Tnp_IS1595 domain-containing protein4.1e-0638.46Show/hide
Query:  SKFLPLSSKVPSRPSF------APSPSSKVLLSAAPSPSSNAL-------LSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLF
        S F+ ++++    PSF      AP+P+S  L+S AP+P+S+AL        S AP+P+S AL+  AP+P+S AL+  +P+P+S AL+   P+P+   L+ 
Subjt:  SKFLPLSSKVPSRPSF------APSPSSKVLLSAAPSPSSNAL-------LSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLF

Query:  AARSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEGS
         A +P+S AL+  AP+P+S AL+  AP+ +S  L+   P   S
Subjt:  AARSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEGS

A0A4W3JE76 FHA domain-containing protein3.2e-0638.89Show/hide
Query:  RVSLQFLPPSSKFLPLSSKVPS--RPSFA---PSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKAL
        R SL    PS +   L++K PS  R S A   PSP  K L +  PSP   +L +  PSP  K+L +  PSP  K+L + +PSP  K+L + TPSP  K+L
Subjt:  RVSLQFLPPSSKFLPLSSKVPS--RPSFA---PSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKAL

Query:  LFAARSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEG
             SP  K+L + +PSP   +L   +PS   K L +  P  G
Subjt:  LFAARSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEG

A0A507CAM6 Uncharacterized protein1.1e-0644.96Show/hide
Query:  PLSSKVPS------RPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSKALL
        P++S  PS      + S APSP +  L SAAPSP ++ L SAAPSP +  L SAAPSP +  L S +PSP +  L S  PSP    L  AA SP +  L 
Subjt:  PLSSKVPS------RPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSKALL

Query:  STAP-SPS-SKALLSTAPSQSSKVLLSTP
        S AP SP+ S  L S APS +   ++++P
Subjt:  STAP-SPS-SKALLSTAPSQSSKVLLSTP

V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)2.1e-0548.59Show/hide
Query:  PPSSKFLPLSSKVPSRPSFAP--SPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK
        P SS  L  +S   S PS +P  SPSS   LS A SPSS+  LS A SPSS   LS A SPSS   LS + SPSS   LS   SPS    L  A SPSS 
Subjt:  PPSSKFLPLSSKVPSRPSFAP--SPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKALLSTTPSPSLKALLFAARSPSSK

Query:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLL----STPPFEGSPLR
          LS A SPSS   LS A S+   + L    S  P E S LR
Subjt:  ALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLL----STPPFEGSPLR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGTTCCTTTTCTCCAAGTACGAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGCTGCGATACAGTTCCTTCTCTCCAA
GTTCAAAGGTTCTCACGCGTTCCGCTACAGTTCCTTCTCTCCAAATACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCAAAGGTTCTCTCACGTTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCA
AGTTCGAAGGTTTTCATGCGCTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTTAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCT
TCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTCTGAAGGTTCTCACGTGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCCAAGTTCGAAGGTTCTTACGCGTTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAG
TTCGAAGTTCCTTCCTCTAAGTTCGAAGGTTCCCTCACGCCCTTCGTTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAATGCGC
TTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCTAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTT
CTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGCGCTTCTCTTCGCTGCTCGTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCT
CTCTACTGCTCCTTCTCAAAGTTCGAAGGTGCTTCTTTCCACCCCTCCTTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTT
TCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCGCGTTCCACTCCATCTTCATATGTTGGCAGTTGACGGCGTCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGCGAGTCTGGTGATCACCCCT
TCAAGATACTACAGTCATCAAAGTGACTGGTCTAGACAGGTGATGAAGTCACTGCAAGTGAAACTGATGACGACCGTTGTAGGCGAGTCGAGTCTGGTGACCACCCCTGC
AGGAAACTACAGTCATCAAAGTGACTGGTCTAGACAGGTGTTGAAATCACTGCAAGTGAAGCTGATGACGACCGTGGTGACCACCCCTGCAGGAAACTACAGTCATCAAA
GTGACTGGTCTAGACAGGTGGTGAAATCACTGCAAGTGAAAGCTGATGACGACCGTGGTGACCACCCCTGCAGGAAACTACAGTCATCAAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTCCTAGCCCACACGAGCTTAAAAGTTCCTTTTCTCCAAGTACGAAGGTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCTCTTACATTGCTGCGATACAGTTCCTTCTCTCCAA
GTTCAAAGGTTCTCACGCGTTCCGCTACAGTTCCTTCTCTCCAAATACGAAGGTTCTCTCCTCCAAGTCAAAGGTTCTCTCACGTTGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCA
AGTTCGAAGGTTTTCATGCGCTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTTAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCT
TCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTCTGAAGGTTCTCACGTGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCCAAGTTCGAAGGTTCTTACGCGTTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAG
TTCGAAGTTCCTTCCTCTAAGTTCGAAGGTTCCCTCACGCCCTTCGTTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAATGCGC
TTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCTAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTT
CTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTTGAAGGCGCTTCTCTTCGCTGCTCGTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCT
CTCTACTGCTCCTTCTCAAAGTTCGAAGGTGCTTCTTTCCACCCCTCCTTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCCTTT
TCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACAGCCGCGTTCCACTCCATCTTCATATGTTGGCAGTTGACGGCGTCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGCGAGTCTGGTGATCACCCCT
TCAAGATACTACAGTCATCAAAGTGACTGGTCTAGACAGGTGATGAAGTCACTGCAAGTGAAACTGATGACGACCGTTGTAGGCGAGTCGAGTCTGGTGACCACCCCTGC
AGGAAACTACAGTCATCAAAGTGACTGGTCTAGACAGGTGTTGAAATCACTGCAAGTGAAGCTGATGACGACCGTGGTGACCACCCCTGCAGGAAACTACAGTCATCAAA
GTGACTGGTCTAGACAGGTGGTGAAATCACTGCAAGTGAAAGCTGATGACGACCGTGGTGACCACCCCTGCAGGAAACTACAGTCATCAAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLLAHTSLKVPFLQVRRCSFSKFEGSYIAAIQFLLSKFKGSHAFRYSSFSPNTKVLSSKSKVLSRCFAAVPSSKFEGFHALCCSSFSPSLKVLTHFATVHFLQVQRFSRA
SVKFLPPSLKVLTCFGEVPSSQVRRFLRVSLQFLPPSSKFLPLSSKVPSRPSFAPSPSSKVLLSAAPSPSSNALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTSPSPSSKAL
LSTTPSPSLKALLFAARSPSSKALLSTAPSPSSKALLSTAPSQSSKVLLSTPPFEGSPLRFSFSKFEGSPLLLFKCLAAVDSRVPLHLHMLAVDGVRCASSSNASLVITP
SRYYSHQSDWSRQVMKSLQVKLMTTVVGESSLVTTPAGNYSHQSDWSRQVLKSLQVKLMTTVVTTPAGNYSHQSDWSRQVVKSLQVKADDDRGDHPCRKLQSSK