; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0036121 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0036121
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionDEAD/DEAH box helicase domain-containing protein
Genome locationchr3:39529473..39533470
RNA-Seq ExpressionLag0036121
SyntenyLag0036121
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8552729.1 hypothetical protein EYB25_004108 [Talaromyces marneffei]2.1e-0534.15Show/hide
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        S+  PSS  +T       S S  PS S    S A+  S F  SS  +    AVPSS    SS  +P SS V          PSS V+    A        
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               +P S  VPS + +   PSS A+ S++  PSS  + S +               +PSS  VPS + +   PSS A+ S++  PSS V+ S +  
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        PSS A+ S+++ PSS A  S++  PSS A+ S++  PSS A+ S++  PSS A+ S++  PSS A+ S+++ PSS V+ S+ +   S
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XP_007894292.2 proliferation marker protein Ki-67 [Callorhinchus milii]7.4e-0636.51Show/hide
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        P R SLA   PSP  K+L +  PSP  K+L + +      R   +L    PS  +  S A+  PSP  K+L +  PSP  K L +   SP  K+L +   
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        SP  K+  + TPSP  K+L +  PSP  K+L +  PSP  K+L + TPSP   +L     SP  K L +      SP R S +    SP
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XP_035452609.1 zinc finger MYM-type protein 3-like isoform X1 [Spodoptera frugiperda]9.6e-0631.86Show/hide
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        PS   S   PP+            PPS+K+ +      +   R   A+ Q  PPS + P+  +  P PS+ A +  A  PS+K   ++++    + F+  
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             PS+    ++    P PS+K L + +P PS+K L +++  PS+K L  TA+ PS+K F +  P PS+K L + +P PS+K L + +P PS+K L +
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         +P PS+K L + +  PS+K L + P
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XP_035452614.1 zinc finger MYM-type protein 3-like isoform X6 [Spodoptera frugiperda]9.6e-0631.86Show/hide
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        PS   S   PP+            PPS+K+ +      +   R   A+ Q  PPS + P+  +  P PS+ A +  A  PS+K   ++++    + F+  
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             PS+    ++    P PS+K L + +P PS+K L +++  PS+K L  TA+ PS+K F +  P PS+K L + +P PS+K L + +P PS+K L +
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         +P PS+K L + +  PS+K L + P
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XP_039541419.1 ice-structuring glycoprotein-like isoform X2 [Pimephales promelas]1.9e-0635.23Show/hide
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        S AS A +PS+++  STA +PS+++  S A+       S A  +   S+   PS  S A + S++A  STA +PS++   S A++PS+++  STA +PS+
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Query:  KAFLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTALSPSSKVLL---STPLFEGSP
        ++  ST  +PS+++  S A +PS+++  S A +PS+++  ST  +PS+++  STA +PS++      STP  E +P
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0F7V8R5 RNA helicase, putative3.9e-0547.24Show/hide
Query:  SPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPSSLKVP-----SRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSVATSPSSKALLSTALSPSSKA
        S + K  +S+A SP  KA   ++ FL     S   L   P   K P     + +S A SPSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS A SPSS  
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Query:  FLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTALSPSSKVLLS
         LS   SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS
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A0A4W3JE76 FHA domain-containing protein3.6e-0637.72Show/hide
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        P R SLA   PSP  K+L +  PSP  K+L + +      R   +L    PS  +  S A+  PSP  K+L +  PSP  K L +   SP  K+L +   
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Query:  SPSSKAFLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTPSPSSKALLSTALSPSSKVL
        SP  K+  + TPSP  K+L +  PSP  K+L +  PSP  K+L + TPSP  K+L + + SP    L
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A0A507CAM6 Uncharacterized protein2.0e-0441.09Show/hide
Query:  PSSLKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSVATSPSSKALLSTALSPSSKAFLSTTPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTTP-S
        PS +    +AS APSP +  L S APSP +  L S A SP +  L S A SP +    S  PSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L S  P S
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        P+   +LS+A  S +   ++++P+    P
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A0A7C8L4L8 Uncharacterized protein1.0e-0534.15Show/hide
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        S+  PSS  +T       S S  PS S    S A+  S F  SS  +    AVPSS    SS  +P SS V          PSS V+    A        
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Query:  SHALLQLLPPSLKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPSSLKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLSVATS
               +P S  VPS + +   PSS A+ S++  PSS  + S +               +PSS  VPS + +   PSS A+ S++  PSS V+ S +  
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        PSS A+ S+++ PSS A  S++  PSS A+ S++  PSS A+ S++  PSS A+ S++  PSS A+ S+++ PSS V+ S+ +   S
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V5BAB7 DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein (Fragment)3.9e-0547.24Show/hide
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        S + K  +S+A SP  KA   ++ FL     S   L   P   K P     + +S A SPSS   LS A SPSS   LS A+SPSS   LS A SPSS  
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         LS   SPSS   LS A SPSS   LS A SPSS   LS   SPSS   LS A SPSS   LS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGTTGCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTAGTTGCAGTTCCTTCCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCCAAGT
TCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTC
GCTTCGCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAACTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAATTCCTTCCTCCCTAAGTTTGAAGGTTCTCACGTTGCTTCGC
TGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGTGTTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCACGTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTC
AAAGGTTCTCACGCGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTCTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAAGTTCGA
AGGTTCTCACGCGCTTCGATGCAGTTCCTTCCTCCCTAAGTTCAAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGCTGCACAGTTCCTTCCTCCAAGTTCG
AAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCTACCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGCTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCGCTCGC
TCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGC
TGCAGTTCCTTCCTTCAAGTTTGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCACTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTT
CTCTCCGTTGCTACTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCTTTCTCCAAGTTCGAAGGCGTTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCT
CTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCT
CTACTGCTCTTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTCTCTCCACCCCTCTTTTTGAAGGTTCACCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGGTACACATTTTC
AAATGTTTGGCGGCGGTTGACGTCCTCATTCCGCTTCATCTTCAAATGTTGGTAGTTGACGGCATCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTGGTGAAGTCACTGC
AATTGAATCTGATGACGACCGTTGTAGGCGAGTCGGGTCTGGTGACCACCCCTGCAGGAGTGCATCACTGAAGGCGAATCTGGTGACTACCCCTGCAGATCATCAAGCCA
ACAAGCTGATCCAAGAGATCAACAAGCCAACCGACGGATCAAGAAGATCAACAAGTCAGCAGGCCGATCATCCAAGAGATCAACAAGCCAACCGACCGATCAAGAAGATC
AACAAGTCAGCAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACCCATCGAATAGATCATCAAGCCAATAGGCCGATCCAAGAGATCATCAAGTCAGCAGGCCGATCATC
CAAGAGGATCAACAAGCTAACAAGCCGATCCAACAGATCATCAAGCCAACAGGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCA
ATAGGCCAATCCAAGAGATCACCAACCCAAGACCAAATAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAGTTGCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTAGTTGCAGTTCCTTCCCTCCAAATTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCCAAGT
TCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCTCACATCGCTTC
GCTTCGCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAACTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAATTCCTTCCTCCCTAAGTTTGAAGGTTCTCACGTTGCTTCGC
TGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTTTCATGTGTTTTGCTGCAGTTCCTTCTCTCCACGTTCAAAGGTTCTCACGCATTTCGCTACAGTTCATTTCCTCCAAGTTC
AAAGGTTCTCACGCGCTTCGGTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTCTGAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTGCAGTTTCTTCTCCCTAAGTTCGA
AGGTTCTCACGCGCTTCGATGCAGTTCCTTCCTCCCTAAGTTCAAAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCATGCGCTTCGCTGCACAGTTCCTTCCTCCAAGTTCG
AAGGTTCTCATGCGCTTCGTTGCTACCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGCTCCTTCCTCCAAGTTTGAAGGTTCCCTCACGCGCTTCGCTCGC
TCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGTTGCTACCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTGC
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CTCTCCGTTGCTACTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCTTTCTCCAAGTTCGAAGGCGTTTCTCTCCACTACTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCT
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AAATGTTTGGCGGCGGTTGACGTCCTCATTCCGCTTCATCTTCAAATGTTGGTAGTTGACGGCATCCGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTGGTGAAGTCACTGC
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ACAAGCTGATCCAAGAGATCAACAAGCCAACCGACGGATCAAGAAGATCAACAAGTCAGCAGGCCGATCATCCAAGAGATCAACAAGCCAACCGACCGATCAAGAAGATC
AACAAGTCAGCAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCAACCCATCGAATAGATCATCAAGCCAATAGGCCGATCCAAGAGATCATCAAGTCAGCAGGCCGATCATC
CAAGAGGATCAACAAGCTAACAAGCCGATCCAACAGATCATCAAGCCAACAGGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGGCCGATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCA
ATAGGCCAATCCAAGAGATCACCAACCCAAGACCAAATAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEVASSKFEGSHALSCSSFPPNSKVLTRFAAVPSPQVRRFSRASLQFLPPKFEGSHVASLQFLPPSLKVLTSLRFAHALRCSFFSLTSKVLTRFAAIPSSLSLKVLTLLR
CSSFLQVRRFSCVLLQFLLSTFKGSHAFRYSSFPPSSKVLTRFGEVPSSKSEVPSSKFKGSHALRCSFFSLSSKVLTRFDAVPSSLSSKFLPPSSKVLMRFAAQFLPPSS
KVLMRFVATFLQVRRFSHALLQLLPPSLKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSVATFLQVRRFSHALLQFLPSSLKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKVL
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KCLAAVDVLIPLHLQMLVVDGIRCASSSNVGSGEVTAIESDDDRCRRVGSGDHPCRSASLKANLVTTPADHQANKLIQEINKPTDGSRRSTSQQADHPRDQQANRPIKKI
NKSAGRSSKKINKPTHRIDHQANRPIQEIIKSAGRSSKRINKLTSRSNRSSSQQADPRDHHANRPIIQEDQQANRPIQEITNPRPNS