; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0036154 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0036154
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description(California timema) hypothetical protein
Genome locationchr3:40553392..40554236
RNA-Seq ExpressionLag0036154
SyntenyLag0036154
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB1346262.1 unnamed protein product [Coregonus sp. 'balchen']2.6e-0426.67Show/hide
Query:  FLELGHVPWTCVAATPFSTSARTCSLSWDMFLGLVPPPRLPTRVHGHVPCVGTCSLDLCHRHAFQHECTDMFLELGHVPWTCVAATPFSTSART--CSLS
        F  L   P+T +  TPF+  A  C          +  P  P+      P         C  H         F  L   P+T ++ TPF++ + T   SLS
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           F  L      S  V         F  L   P+T ++ TPF++     F  L   P+T  + TPF++     F  L   P+T  + TPF++ + T   
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Query:  SLSWDMFLGL
        SLS   F  L
Subjt:  SLSWDMFLGL

CAD7574069.1 unnamed protein product [Timema californicum]4.0e-0526.26Show/hide
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        C D  L+LG + +TC                  TC+ +   + G +    +     G + C   C    D+ +  A    C D  L+L  + +TC  A  
Subjt:  CKDVFLELGHVPWTCV-------AATPFSTSARTCSLSWDMFLGLVPPPRLPTRVHGHVPCVGTCSL--DLCHRHAFQHECTDMFLELGHVPWTCVAATP

Query:  FSTSARTCSLSWDMFLGL-VSPSRLSARVHGHHECTDMFLELGHVPWTCVAATPFSTSCKDVFLELGHVPWTCATATPFSTSCKDVFLELGHVPWTCA
         S       LS  ++  + + P  +     G   C D+ L+L  + +TC      S SC DV L+ G + +TCA     + SC D  L+LG + +TCA
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6F9CD06 Uncharacterized protein1.3e-0426.67Show/hide
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        F  L   P+T +  TPF+  A  C          +  P  P+      P         C  H         F  L   P+T ++ TPF++ + T   SLS
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Query:  WDMFLGLVSPSRLSARVHGHHECTDMFLELGHVPWTCVAATPFSTSCKDVFLELGHVPWTCATATPFSTSCKDVFLELGHVPWTCAAATPFSTSAQT--C
           F  L      S  V         F  L   P+T ++ TPF++     F  L   P+T  + TPF++     F  L   P+T  + TPF++ + T   
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Query:  SLSWDMFLGL
        SLS   F  L
Subjt:  SLSWDMFLGL

A0A7R9J7F6 (California timema) hypothetical protein1.9e-0526.26Show/hide
Query:  CKDVFLELGHVPWTCV-------AATPFSTSARTCSLSWDMFLGLVPPPRLPTRVHGHVPCVGTCSL--DLCHRHAFQHECTDMFLELGHVPWTCVAATP
        C D  L+LG + +TC                  TC+ +   + G +    +     G + C   C    D+ +  A    C D  L+L  + +TC  A  
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         S       LS  ++  + + P  +     G   C D+ L+L  + +TC      S SC DV L+ G + +TCA     + SC D  L+LG + +TCA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACAGTGCAAGGACGTGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCAC
GAGTGCACGGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGCCGCCGCCGCGCCTTCCAACACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGCGTTGGGACATGTTCCT
TGGACTTGTGTCACCGCCATGCCTTTCAGCACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCA
AGGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTGCACGGACATCACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGAGTTGGG
ACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTTGCAAGGACGTGTTCCTTGAGTTAGGACATGTTCCTTGGACTTGTGCCACCGCCACGCCTTTCA
GCACGAGTTGTAAGGACGTGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGCCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCACAGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATG
TTCCTTGGACTTGTGCCGTCGCCGCGCCTTTCAGCACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACAGTGCAAGGACGTGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCAC
GAGTGCACGGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGCCGCCGCCGCGCCTTCCAACACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGCGTTGGGACATGTTCCT
TGGACTTGTGTCACCGCCATGCCTTTCAGCACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCA
AGGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGTCACGCCTTTCAGCACGAGTGCACGGACATCACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGAGTTGGG
ACATGTTCCTTGGACTTGTGTCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTTGCAAGGACGTGTTCCTTGAGTTAGGACATGTTCCTTGGACTTGTGCCACCGCCACGCCTTTCA
GCACGAGTTGTAAGGACGTGTTCCTTGAGTTGGGACATGTTCCTTGGACTTGTGCCGCCGCCACGCCTTTCAGCACGAGTGCACAGACATGTTCCTTGAGTTGGGACATG
TTCCTTGGACTTGTGCCGTCGCCGCGCCTTTCAGCACGAGTGCACGGACATGTTCCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFLGLVSPPRLSAQCKDVFLELGHVPWTCVAATPFSTSARTCSLSWDMFLGLVPPPRLPTRVHGHVPCVGTCSLDLCHRHAFQHECTDMFLELGHVPWTCVAATPFSTSA
RTCSLSWDMFLGLVSPSRLSARVHGHHECTDMFLELGHVPWTCVAATPFSTSCKDVFLELGHVPWTCATATPFSTSCKDVFLELGHVPWTCAAATPFSTSAQTCSLSWDM
FLGLVPSPRLSARVHGHVP