; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0036590 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0036590
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionGlucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
Genome locationchr3:48946106..48948028
RNA-Seq ExpressionLag0036590
SyntenyLag0036590
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BQE9 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 45.5e-16188.01Show/hide
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O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 15.0e-1847.83Show/hide
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Q93V72 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 41.8e-2043.58Show/hide
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 11.5e-1738.62Show/hide
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Q9FZ86 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 32.0e-1948.36Show/hide
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Subjt:  MTPSVPTATPTTTAPITVPPTT

Q9FZD0 Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein5.6e-1738.27Show/hide
Query:  CVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMTPSV
        CV +  A+E+ LQ  +D+ACG GG+DC+QIQ  G+CY PNTL+NH   A NSY+QK  S   +CDF G+A+++ S PST S     SSS+ TP +  PS 
Subjt:  CVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMTPSV

Query:  PTATPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAAG----LRPFTCCIILTMSLITRRI
         T   TT +P T      TNP+T +   + +P N  P +   T   ++++G          PSSSTS     G    +R  T  ++ T++ +  R+
Subjt:  PTATPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAAG----LRPFTCCIILTMSLITRRI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.7e-5350.5Show/hide
Query:  TTMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPP--PSGGAPVVT
        TT HD+ N P T+FPT P T+TPT  T P   PVT+TP++PA T   +P  T I  P  +P P+     P +T P   P+TNPVT YPP  PSG  PV  
Subjt:  TTMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANSPVPLTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPP--PSGGAPVVT

Query:  PVTNPVPVSPPAATNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNP
        PV     V+PP  +N+P + GQSWCVA+ GAS+++LQ ALDYACGI  +DCSQ+QQGG+CY+P +L++HASFAFNSY+QKNPSP SCDFGG+A + N+NP
Subjt:  PVTNPVPVSPPAATNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNP

Query:  STGSCIYPLSSSSSTPASMTPSVPTATPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPA-------SSIGSTTGFGTEIPPSSSTSIS
        STGSCIY   SS+STP  MT    T TP+T   +  PP T    T   P G G+   G PP +FN  NP        SS G   G+G +  P+ +   S
Subjt:  STGSCIYPLSSSSSTPASMTPSVPTATPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPA-------SSIGSTTGFGTEIPPSSSTSIS

AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein7.2e-2034.55Show/hide
Query:  STPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANSPVP-LTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPP-----PSGGAPVVTPVTNP--VPVSPPAAT
        ST  ++ +  T+P+ V           IP+  P     ++  P +T P  P +T PG    T P   YPP     P+GG P +   T P    V      
Subjt:  STPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANSPVP-LTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPP-----PSGGAPVVTPVTNP--VPVSPPAAT

Query:  NAPVIPG--------------------------------QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNP
             PG                                  WC+A++ AS  +LQ ALDYACG GG+DC QIQQG +CY PNT+ +HASFAFNSY+QK+P
Subjt:  NAPVIPG--------------------------------QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNP

Query:  SPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSS---SSSTPASMTPSVPTATPTTT--APITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPASSIGSTT
           SC+FGG+A +T+++PS GSC +  SS   S+S P+ M+P   ++ P++T   PIT P T +T   +  P G   P  G P +  +  +   SI +  
Subjt:  SPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSS---SSSTPASMTPSVPTATPTTT--APITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPASSIGSTT

Query:  G
        G
Subjt:  G

AT1G69295.1 plasmodesmata callose-binding protein 41.3e-2143.58Show/hide
Query:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMTP
        ++C+ + G +E  LQ A+DYACG  G+DC+QIQ  G+CY PNT++NH   A NSY+QK  S   +CDF G+A  + + PST S     SSSS TP + TP
Subjt:  SWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMTP

Query:  SVPT---ATPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAAGL
        +  T    TPTT  P T  PTT T PT+ +P  +G P  G P T  NTG P S+ G  T   + + P ++   + + GL
Subjt:  SVPT---ATPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAAGL

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein7.7e-3044.68Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPPPSGGAPVVTPVTNPVPVSPPAATNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDC
        T  IT P      +T P++         P T P T  P     A  V       P++ P++ +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACGIGG+DC
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPPPSGGAPVVTPVTNPVPVSPPAATNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDC

Query:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMT-----------PSVPTATP
        S+IQ+GG+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS GSC +P +S+S +  ++T           PS PT  P
Subjt:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMT-----------PSVPTATP

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein7.2e-2848Show/hide
Query:  TTPITVPANSPVPLTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPPPSGGAPVVTPVTNPVPVSPPAATNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDC
        T  IT P      +T P++         P T P T  P     A  V       P++ P++ +    PG QSWCVAR   ++MALQ+ALDYACGIGG+DC
Subjt:  TTPITVPANSPVPLTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPPPSGGAPVVTPVTNPVPVSPPAATNAPVIPG-QSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDC

Query:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS
        S+IQ+GG+CYNPN+L  HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  +++PS
Subjt:  SQIQQGGSCYNPNTLENHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCAAACAGCTTCCAGATGCTGCTTCTTTTCCATTCTGTCTCTCCTCGCCATCTGCTCTTCTGGTACTAGATTTGGTGGCTCGCATTTGGAAGTGGAAGAAAATGC
TTCCATGGAGTTGAAATGGAAGTTCAGTGCGCTTGTTCGGACAACAATGCACGACATGACCAACTCGCCGACAACAATTTTTCCGACGACCCCGGATACCTCCACGCCGA
CAATCATCACCGTCCCGGCGACCAACCCTGTCACTGTCACTCCGTCGAGCCCTGCTGCCACGCCGGTGTCCATTCCTTTAACGACACCCATCACAGTTCCGGCTAACTCT
CCGGTGCCGCTCACCAATCCGGTTTCGCCGCCGGTTACAGTCCCCGGAGCACAGCCAATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCACCTCCGTCAGGTGGCGCTCCGGTGGT
AACACCCGTCACAAACCCAGTTCCAGTGTCTCCCCCGGCAGCGACGAATGCACCGGTCATTCCAGGACAGAGCTGGTGCGTGGCCAGGTCCGGCGCATCGGAGATGGCTC
TTCAGTCGGCGTTGGACTACGCTTGTGGCATTGGAGGGTCTGACTGTTCTCAAATCCAGCAAGGTGGCAGCTGTTACAACCCAAATACACTCGAAAATCACGCTTCTTTT
GCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAATCCTTCTCCAACAAGCTGCGACTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCCTGCATTTACCCATT
GTCATCTTCCTCTTCGACACCGGCATCCATGACACCGTCAGTTCCAACGGCGACACCGACAACAACAGCTCCGATCACCGTCCCACCAACTACAGTTACAAACCCAACAA
CGTCTTCACCTTTAGGGACAGGCATGCCAGAAAATGGAGCTCCTCCTACAGTCTTTAACACAGGTAATCCAGCTTCGAGTATAGGCAGCACAACAGGCTTTGGAACCGAG
ATCCCACCGAGCTCAAGCACCTCAATATCCATGGCGGCTGGATTGAGACCCTTCACTTGTTGCATCATTCTGACGATGTCCTTGATCACTCGCAGAATCACTCTGGACTG
GTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCCAAACAGCTTCCAGATGCTGCTTCTTTTCCATTCTGTCTCTCCTCGCCATCTGCTCTTCTGGTACTAGATTTGGTGGCTCGCATTTGGAAGTGGAAGAAAATGC
TTCCATGGAGTTGAAATGGAAGTTCAGTGCGCTTGTTCGGACAACAATGCACGACATGACCAACTCGCCGACAACAATTTTTCCGACGACCCCGGATACCTCCACGCCGA
CAATCATCACCGTCCCGGCGACCAACCCTGTCACTGTCACTCCGTCGAGCCCTGCTGCCACGCCGGTGTCCATTCCTTTAACGACACCCATCACAGTTCCGGCTAACTCT
CCGGTGCCGCTCACCAATCCGGTTTCGCCGCCGGTTACAGTCCCCGGAGCACAGCCAATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCACCTCCGTCAGGTGGCGCTCCGGTGGT
AACACCCGTCACAAACCCAGTTCCAGTGTCTCCCCCGGCAGCGACGAATGCACCGGTCATTCCAGGACAGAGCTGGTGCGTGGCCAGGTCCGGCGCATCGGAGATGGCTC
TTCAGTCGGCGTTGGACTACGCTTGTGGCATTGGAGGGTCTGACTGTTCTCAAATCCAGCAAGGTGGCAGCTGTTACAACCCAAATACACTCGAAAATCACGCTTCTTTT
GCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAATCCTTCTCCAACAAGCTGCGACTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAACTCCAATCCAAGCACTGGCTCCTGCATTTACCCATT
GTCATCTTCCTCTTCGACACCGGCATCCATGACACCGTCAGTTCCAACGGCGACACCGACAACAACAGCTCCGATCACCGTCCCACCAACTACAGTTACAAACCCAACAA
CGTCTTCACCTTTAGGGACAGGCATGCCAGAAAATGGAGCTCCTCCTACAGTCTTTAACACAGGTAATCCAGCTTCGAGTATAGGCAGCACAACAGGCTTTGGAACCGAG
ATCCCACCGAGCTCAAGCACCTCAATATCCATGGCGGCTGGATTGAGACCCTTCACTTGTTGCATCATTCTGACGATGTCCTTGATCACTCGCAGAATCACTCTGGACTG
GTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQTASRCCFFSILSLLAICSSGTRFGGSHLEVEENASMELKWKFSALVRTTMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSIPLTTPITVPANS
PVPLTNPVSPPVTVPGAQPITNPVTTYPPPSGGAPVVTPVTNPVPVSPPAATNAPVIPGQSWCVARSGASEMALQSALDYACGIGGSDCSQIQQGGSCYNPNTLENHASF
AFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTNSNPSTGSCIYPLSSSSSTPASMTPSVPTATPTTTAPITVPPTTVTNPTTSSPLGTGMPENGAPPTVFNTGNPASSIGSTTGFGTE
IPPSSSTSISMAAGLRPFTCCIILTMSLITRRITLDW