; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0036652 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0036652
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionPoly polymerase 1, putative
Genome locationchr2:168579..169154
RNA-Seq ExpressionLag0036652
SyntenyLag0036652
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025322 - Protein of unknown function DUF4228, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008453039.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103493864 [Cucumis melo]4.0e-5668.9Show/hide
Query:  MGGCLSN---NHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHR
        MGGCLSN     K     PPPPPPTAKVIS QGHLREYPVPI+VSRVL TENSSSSTSDSFLCNSD LY+D FIP LPL   LH N IYF+LPSS+LHHR
Subjt:  MGGCLSN---NHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHR

Query:  LTASDMAALAVKATLALQN--------DPLRRKKG---RISPLLIL-NPSDSD---SYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRL
        LTA DMAALAVKATLALQN          L R KG   RISPL  L +P+D      +  +    SNSK +  +SSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRL
Subjt:  LTASDMAALAVKATLALQN--------DPLRRKKG---RISPLLIL-NPSDSD---SYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRL

Query:  STIYEGTVL
        STIYEGT L
Subjt:  STIYEGTVL

XP_022154429.1 uncharacterized protein LOC111021675 [Momordica charantia]3.0e-5668.93Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTA
        MG CLS +  +   PPPP  PTAKVIS +G+LREYP PI+VSRVL TEN SSSTSDSFLCNSD LYYD FIPP+PL D L A+ IYFLLPSS L  RL+A
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTA

Query:  SDMAALAVKATLALQN----DPLRRKKGRISPLLILNP-SDSDSYSASAPSISNSKKD----------APASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTI
        SDMAA+A+KA+LALQN    DPL RKKGRISPLLI NP SDS S S S  + S+SKK+           P SSSV+KLQ+LTSRRAKMAVRSFKL+LSTI
Subjt:  SDMAALAVKATLALQN----DPLRRKKGRISPLLILNP-SDSDSYSASAPSISNSKKD----------APASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTI

Query:  YEGTVL
        YEGTVL
Subjt:  YEGTVL

XP_022940531.1 uncharacterized protein LOC111446101 [Cucurbita moschata]9.4e-5872.16Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT
        MG CLS+    P P    PPPPTAKVIS QGHLREYPVPI+VSRVL TENSSSS SDSFLCNSD LYYD FIPPLPL + L  N IYFLLPSS+LHHRL+
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT

Query:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL
        AS MAALAVKA+LALQN     RRKKGR+SPL  LN SDSD   +  PS  N+  D  AS SV+KLQRLTS+RAKMAVRSFKL+LSTIYEG VL
Subjt:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL

XP_022981858.1 uncharacterized protein LOC111480876 [Cucurbita maxima]4.2e-5872.68Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT
        MG CLS+    P P    PPPPTAKVIS QGHLREYPVPI+VSRVL TENSSSS SDSFLCNSD LYYD FIPPLPL + L  N IYFLLPSS+LHHRL+
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT

Query:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL
        AS MAALAVKA+LALQN     RRKKGR+SPL  LN SDSD   +  PS  N+  D  AS SV+KLQRLTSRRAKMAVRSFKL+LSTIYEG VL
Subjt:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL

XP_038896630.1 uncharacterized protein LOC120084892 [Benincasa hispida]8.0e-5770.94Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT
        MG CLSN    P     PPPPPTAKVI+ QG LREYPVPI+VSRVL TE+SSSSTSDSFLCNSD LYYD FIPPLPL   L  N IYFLL SS LH RLT
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT

Query:  ASDMAALAVKATLALQN-----DPLRRKKGRISPLLILNPSDSDSYSAS---APSISNSKKDA---PASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEG
        ASDMAALAVKATLALQN      PLRR KGRISP+L+ +   SD  SA    APSI++ K  A    ASSSV++LQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEG
Subjt:  ASDMAALAVKATLALQN-----DPLRRKKGRISPLLILNPSDSDSYSAS---APSISNSKKDA---PASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEG

Query:  TVL
         VL
Subjt:  TVL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5Z9 Uncharacterized protein7.3e-5668.78Show/hide
Query:  MGGCLSN---NHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHR
        MGGC SN     K     PPPPPPTAKVIS QGHLREYPVPI+VSRVL TENSSSSTSDSFLCNSD L+YD FIP LPL   LH N IYF+LPSS+LHHR
Subjt:  MGGCLSN---NHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHR

Query:  LTASDMAALAVKATLALQNDP-----LRRKKG---RISPLLIL---NPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIY
        LTA DMAALAVKATLALQN       L   KG   RISPL  L   N   ++     A S +++ K+   SSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIY
Subjt:  LTASDMAALAVKATLALQNDP-----LRRKKG---RISPLLIL---NPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIY

Query:  EGTVL
        EGTVL
Subjt:  EGTVL

A0A1S3BUP5 uncharacterized protein LOC1034938641.9e-5668.9Show/hide
Query:  MGGCLSN---NHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHR
        MGGCLSN     K     PPPPPPTAKVIS QGHLREYPVPI+VSRVL TENSSSSTSDSFLCNSD LY+D FIP LPL   LH N IYF+LPSS+LHHR
Subjt:  MGGCLSN---NHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHR

Query:  LTASDMAALAVKATLALQN--------DPLRRKKG---RISPLLIL-NPSDSD---SYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRL
        LTA DMAALAVKATLALQN          L R KG   RISPL  L +P+D      +  +    SNSK +  +SSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRL
Subjt:  LTASDMAALAVKATLALQN--------DPLRRKKG---RISPLLIL-NPSDSD---SYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRL

Query:  STIYEGTVL
        STIYEGT L
Subjt:  STIYEGTVL

A0A6J1DM27 uncharacterized protein LOC1110216751.5e-5668.93Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTA
        MG CLS +  +   PPPP  PTAKVIS +G+LREYP PI+VSRVL TEN SSSTSDSFLCNSD LYYD FIPP+PL D L A+ IYFLLPSS L  RL+A
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTA

Query:  SDMAALAVKATLALQN----DPLRRKKGRISPLLILNP-SDSDSYSASAPSISNSKKD----------APASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTI
        SDMAA+A+KA+LALQN    DPL RKKGRISPLLI NP SDS S S S  + S+SKK+           P SSSV+KLQ+LTSRRAKMAVRSFKL+LSTI
Subjt:  SDMAALAVKATLALQN----DPLRRKKGRISPLLILNP-SDSDSYSASAPSISNSKKD----------APASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTI

Query:  YEGTVL
        YEGTVL
Subjt:  YEGTVL

A0A6J1FIQ7 uncharacterized protein LOC1114461014.6e-5872.16Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT
        MG CLS+    P P    PPPPTAKVIS QGHLREYPVPI+VSRVL TENSSSS SDSFLCNSD LYYD FIPPLPL + L  N IYFLLPSS+LHHRL+
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT

Query:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL
        AS MAALAVKA+LALQN     RRKKGR+SPL  LN SDSD   +  PS  N+  D  AS SV+KLQRLTS+RAKMAVRSFKL+LSTIYEG VL
Subjt:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL

A0A6J1J381 uncharacterized protein LOC1114808762.1e-5872.68Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT
        MG CLS+    P P    PPPPTAKVIS QGHLREYPVPI+VSRVL TENSSSS SDSFLCNSD LYYD FIPPLPL + L  N IYFLLPSS+LHHRL+
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPP-PPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLT

Query:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL
        AS MAALAVKA+LALQN     RRKKGR+SPL  LN SDSD   +  PS  N+  D  AS SV+KLQRLTSRRAKMAVRSFKL+LSTIYEG VL
Subjt:  ASDMAALAVKATLALQNDPL--RRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21010.1 unknown protein7.8e-3448.21Show/hide
Query:  PTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTE-------NSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLA
        PT K+++  G LREY VP+  S+VL  E       +SSS  S  F+C+SD LYYD FIP +   + L A+ IYF+LP S    RLTASDMAALAVKA++A
Subjt:  PTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTE-------NSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLA

Query:  LQN----DPLRRKKGRISPLLILNPS-DSDSYSASAPSISNSK----KDAPA--------SSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL
        +QN    +  RRKK RISP+++L  S DS + + S  ++   +    K AP         S SV+ L+R TS+RAK+AVRSF+L+LSTIYEG+V+
Subjt:  LQN----DPLRRKKGRISPLLILNPS-DSDSYSASAPSISNSK----KDAPA--------SSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL

AT1G76600.1 unknown protein1.2e-3447.45Show/hide
Query:  TAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDS----FLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLALQ--
        TAK+++  G LREY VP+  S+VL +E++SSS+S S    FLCNSD LYYD FIP +   + L AN IYF+LP S   +RL+ASDMAALAVKA++A++  
Subjt:  TAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDS----FLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLALQ--

Query:  --NDPLRRKKGRISPLLILNPSDSDSYSA-----------------SAPSISNSKKDA---PASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGT
              RR+ GRISP++ LN ++ +  +A                   P+ +   KD      S SV+KL+R TS RAK+AVRSF+LRLSTIYEG+
Subjt:  --NDPLRRKKGRISPLLILNPSDSDSYSA-----------------SAPSISNSKKDA---PASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGT

AT2G23690.1 unknown protein4.6e-1034.48Show/hide
Query:  TAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLALQ------
        TAK+I   G + E+  P+ V  VL            F+CNSD + +D  +  +   +      +YF LP S LHH L A +MAALAVKA+ AL       
Subjt:  TAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLALQ------

Query:  -NDPLRRKKGRISPLL
          D  R ++  +SP++
Subjt:  -NDPLRRKKGRISPLL

AT3G50800.1 unknown protein6.0e-1035.96Show/hide
Query:  MGGCLSNNHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTA
        MG C S   +           TAK+I   G L+E+  P+ V ++L           SF+CNSD + +D  +  +P  + L    +YF+LP + L+H L A
Subjt:  MGGCLSNNHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTA

Query:  SDMAALAVKATLAL
         +MAALAVKA+ AL
Subjt:  SDMAALAVKATLAL

AT5G66580.1 unknown protein2.3e-0937.63Show/hide
Query:  TAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLAL
        +AK+I   G L+E+  P+ V ++L           SF+CNSD + +D  +  +  ++ L +  +YF+LP + L+H L A +MAALAVKA+ AL
Subjt:  TAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKATLAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCGGGTGTTTGTCTAACAATCACAAGGCCCCTCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCTCCCACCGCCAAAGTGATCTCCTTCCAAGGCCACCTCCGCGAATACCCTGT
TCCCATCACCGTCTCCCGCGTTCTCCACACCGAAAACTCCTCTTCTTCCACTTCCGACTCCTTCCTCTGCAACTCCGACCTCTTATACTACGACCAATTCATTCCGCCTC
TGCCTCTCCACGACTTCCTTCACGCTAATCACATCTATTTCCTTCTTCCTTCCTCCCACCTCCACCACCGTTTGACCGCCTCCGATATGGCCGCCTTGGCCGTCAAAGCC
ACCCTCGCCCTCCAGAATGATCCCCTCCGCCGTAAAAAGGGTCGTATTTCTCCCCTCCTCATCCTCAACCCCTCCGATTCCGATTCCTATTCCGCCTCCGCCCCCTCCAT
CTCAAACTCCAAGAAGGACGCCCCTGCCTCCTCCTCCGTTAAAAAATTGCAGAGATTGACATCCAGAAGGGCTAAGATGGCGGTTCGTTCCTTTAAGCTCAGATTGAGCA
CCATCTATGAAGGCACCGTTCTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCGGGTGTTTGTCTAACAATCACAAGGCCCCTCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCTCCCACCGCCAAAGTGATCTCCTTCCAAGGCCACCTCCGCGAATACCCTGT
TCCCATCACCGTCTCCCGCGTTCTCCACACCGAAAACTCCTCTTCTTCCACTTCCGACTCCTTCCTCTGCAACTCCGACCTCTTATACTACGACCAATTCATTCCGCCTC
TGCCTCTCCACGACTTCCTTCACGCTAATCACATCTATTTCCTTCTTCCTTCCTCCCACCTCCACCACCGTTTGACCGCCTCCGATATGGCCGCCTTGGCCGTCAAAGCC
ACCCTCGCCCTCCAGAATGATCCCCTCCGCCGTAAAAAGGGTCGTATTTCTCCCCTCCTCATCCTCAACCCCTCCGATTCCGATTCCTATTCCGCCTCCGCCCCCTCCAT
CTCAAACTCCAAGAAGGACGCCCCTGCCTCCTCCTCCGTTAAAAAATTGCAGAGATTGACATCCAGAAGGGCTAAGATGGCGGTTCGTTCCTTTAAGCTCAGATTGAGCA
CCATCTATGAAGGCACCGTTCTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGGCLSNNHKAPPPPPPPPPPTAKVISFQGHLREYPVPITVSRVLHTENSSSSTSDSFLCNSDLLYYDQFIPPLPLHDFLHANHIYFLLPSSHLHHRLTASDMAALAVKA
TLALQNDPLRRKKGRISPLLILNPSDSDSYSASAPSISNSKKDAPASSSVKKLQRLTSRRAKMAVRSFKLRLSTIYEGTVL