; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0037163 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0037163
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationchr2:3929161..3929721
RNA-Seq ExpressionLag0037163
SyntenyLag0037163
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649934.1 hypothetical protein Csa_012580 [Cucumis sativus]8.6e-7279.79Show/hide
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XP_004145579.1 VQ motif-containing protein 11 [Cucumis sativus]8.6e-7282.42Show/hide
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XP_008452821.1 PREDICTED: VQ motif-containing protein 31-like [Cucumis melo]3.8e-7284.36Show/hide
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XP_022138667.1 VQ motif-containing protein 4-like [Momordica charantia]3.2e-7981.54Show/hide
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XP_022977123.1 VQ motif-containing protein 11-like [Cucurbita maxima]3.8e-7283.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L104 VQ domain-containing protein4.1e-7282.42Show/hide
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        FKNS PSH  R DSPVP PVTPL AESLFFRRP V SPLSPPVT EDKAIAD GFYLHPS    PRSSQPPELLNLFPS  P
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A0A1S3BVZ0 VQ motif-containing protein 31-like1.9e-7284.36Show/hide
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A0A5A7VC76 VQ motif-containing protein 31-like1.9e-7284.36Show/hide
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A0A6J1CBS5 VQ motif-containing protein 4-like1.6e-7981.54Show/hide
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         F+NSPPSH       RFDSPVPSPVTPL  ESL F RP VASPLSPPVT EDKAIAD GFYLHPSP++TPR+ QPPELLNLFPSNSPSEQSQNA
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A0A6J1IP36 VQ motif-containing protein 11-like1.9e-7283.15Show/hide
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        KNS PSH  RFDSP+PSPVTPL  E LF R+P VASPL+PPVT EDKAIAD GFYLHPS    PRSSQPPELLNLFPS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5M750 VQ motif-containing protein 42.2e-1437.5Show/hide
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        PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG +     G S K   TH      S P     PP         +    S F+L ERR++++ L+I               
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           P   SP    F S V SPVTPL  +   F R   ++     +  E+KA+ +RGFYLHPSP  TP   + P LL LFP  SP
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 334.5e-1539.13Show/hide
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        PTTFVQADT++F+ +VQ LTG S D+          PV + +K  SS   PP        + + FKL ERR              +TLR +   +L  TG
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           +   S RF                  D P   + SPVTPL +    F +   +SPLS    + EDKAIAD+GFYLHPSP++TPR SQ P LL LFP 
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Query:  NSPSEQS
         SP+  S
Subjt:  NSPSEQS

Q9FNP0 VQ motif-containing protein 317.9e-1234.5Show/hide
Query:  TTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERRHTLR-KLEI-------KLGLTGPFKNSPPSHRFDSPV
        TTFVQ DTN+FR++VQ+LTG + ++        + + ++             +R   KL ERR  +R KLEI       K   T P   S  ++   SPV
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Query:  PSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLSPPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSPSEQSQ
         +P +  +  SL    P      +  +  E+KAI +R FYLHPSP + P  ++ PELL LFP  SP+   +
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 197.9e-1236.56Show/hide
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        PTTFVQAD++SF+ +VQ LTG S     DS + P T   K   +   PP        + S  KL ERR              +  L I  G  G  + SP
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         +    SP         + SPVTPL   +          P     P++ E++ IAD+G+YLH SPI+TPR S+ P+LL LFP  SP
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Q9M8L3 VQ motif-containing protein 111.8e-1136.46Show/hide
Query:  ISSPPPPPPPSSSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERRHTLRKLEIKL-GLTGPFKNSPPS
        +S   PP   +   T FVQAD ++FR++VQKLTG   D      + +S      P          P++  FKL ERR + +K+E+K+  +T P  N   S
Subjt:  ISSPPPPPPPSSSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERRHTLRKLEIKL-GLTGPFKNSPPS

Query:  HRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS-------PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSPS
        H     + SPV+ L     F+ R    SP S        P   E KAIA++GFY  PSP     S   PELL LFP  SP+
Subjt:  HRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS-------PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSPS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.6e-1537.5Show/hide
Query:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFS-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKP----FPPAA----DHLTGPRRSPFKLQERRHTLRKLEIK------------LG
        PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG +     G S K   TH      S P     PP         +    S F+L ERR++++ L+I               
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Query:  LTGPFKNSPPSHRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLSPPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSP
           P   SP    F S V SPVTPL  +   F R   ++     +  E+KA+ +RGFYLHPSP  TP   + P LL LFP  SP
Subjt:  LTGPFKNSPPSHRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLSPPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSP

AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.6e-1537.5Show/hide
Query:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFS-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKP----FPPAA----DHLTGPRRSPFKLQERRHTLRKLEIK------------LG
        PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG +     G S K   TH      S P     PP         +    S F+L ERR++++ L+I               
Subjt:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFS-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKP----FPPAA----DHLTGPRRSPFKLQERRHTLRKLEIK------------LG

Query:  LTGPFKNSPPSHRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLSPPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSP
           P   SP    F S V SPVTPL  +   F R   ++     +  E+KA+ +RGFYLHPSP  TP   + P LL LFP  SP
Subjt:  LTGPFKNSPPSHRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLSPPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSP

AT1G80450.1 VQ motif-containing protein1.3e-1236.46Show/hide
Query:  ISSPPPPPPPSSSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERRHTLRKLEIKL-GLTGPFKNSPPS
        +S   PP   +   T FVQAD ++FR++VQKLTG   D      + +S      P          P++  FKL ERR + +K+E+K+  +T P  N   S
Subjt:  ISSPPPPPPPSSSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERRHTLRKLEIKL-GLTGPFKNSPPS

Query:  HRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS-------PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSPS
        H     + SPV+ L     F+ R    SP S        P   E KAIA++GFY  PSP     S   PELL LFP  SP+
Subjt:  HRFDSPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS-------PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSPS

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein5.6e-1336.56Show/hide
Query:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSG----DSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERRH------------TLRKLEIKLGLTGPFKNSP
        PTTFVQAD++SF+ +VQ LTG S     DS + P T   K   +   PP        + S  KL ERR              +  L I  G  G  + SP
Subjt:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSG----DSEKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERRH------------TLRKLEIKLGLTGPFKNSP

Query:  PSHRFDSP---------VPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS--PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSP
         +    SP         + SPVTPL   +          P     P++ E++ IAD+G+YLH SPI+TPR S+ P+LL LFP  SP
Subjt:  PSHRFDSP---------VPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS--PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSP

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein3.2e-1639.13Show/hide
Query:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDS-------EKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERR--------------HTLR-KLEIKLGLTG
        PTTFVQADT++F+ +VQ LTG S D+          PV + +K  SS   PP        + + FKL ERR              +TLR +   +L  TG
Subjt:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDS-------EKLPVTHLSKLSSSKPFPPAADHLTGPRRSPFKLQERR--------------HTLR-KLEIKLGLTG

Query:  PFKNSPPSHRF------------------DSP---VPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS-PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPS
           +   S RF                  D P   + SPVTPL +    F +   +SPLS    + EDKAIAD+GFYLHPSP++TPR SQ P LL LFP 
Subjt:  PFKNSPPSHRF------------------DSP---VPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLS-PPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPS

Query:  NSPSEQS
         SP+  S
Subjt:  NSPSEQS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAAACATCTAATCACCATCTCTTCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGTCATCTTCTCCGACCACCTTCGTCCAAGCCGACACCAACTCCTTCAGAGACCTCGTCCA
GAAGCTCACCGGCTTTTCCGGTGACTCCGAAAAACTTCCAGTCACGCACCTCTCCAAGCTTTCCTCCTCCAAGCCCTTCCCTCCCGCCGCCGACCACCTCACCGGTCCCC
GCCGGTCTCCCTTCAAGCTCCAAGAGCGCCGTCACACCCTCCGAAAGCTTGAGATCAAACTCGGCCTCACCGGACCTTTCAAGAACTCGCCGCCGAGTCACCGGTTCGAC
TCGCCCGTTCCGAGTCCGGTCACGCCTCTCACCGCCGAGTCGCTGTTTTTTCGGAGGCCTGTCGTGGCCTCGCCGCTGTCGCCTCCGGTCACGGTGGAGGACAAGGCCAT
AGCCGACCGCGGGTTTTATCTTCACCCGTCGCCGATTAATACTCCGAGGAGTTCGCAGCCGCCGGAGCTCTTGAATTTGTTCCCTTCCAATTCGCCAAGCGAGCAATCTC
AAAATGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAAAACATCTAATCACCATCTCTTCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGTCATCTTCTCCGACCACCTTCGTCCAAGCCGACACCAACTCCTTCAGAGACCTCGTCCA
GAAGCTCACCGGCTTTTCCGGTGACTCCGAAAAACTTCCAGTCACGCACCTCTCCAAGCTTTCCTCCTCCAAGCCCTTCCCTCCCGCCGCCGACCACCTCACCGGTCCCC
GCCGGTCTCCCTTCAAGCTCCAAGAGCGCCGTCACACCCTCCGAAAGCTTGAGATCAAACTCGGCCTCACCGGACCTTTCAAGAACTCGCCGCCGAGTCACCGGTTCGAC
TCGCCCGTTCCGAGTCCGGTCACGCCTCTCACCGCCGAGTCGCTGTTTTTTCGGAGGCCTGTCGTGGCCTCGCCGCTGTCGCCTCCGGTCACGGTGGAGGACAAGGCCAT
AGCCGACCGCGGGTTTTATCTTCACCCGTCGCCGATTAATACTCCGAGGAGTTCGCAGCCGCCGGAGCTCTTGAATTTGTTCCCTTCCAATTCGCCAAGCGAGCAATCTC
AAAATGCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SPVPSPVTPLTAESLFFRRPVVASPLSPPVTVEDKAIADRGFYLHPSPINTPRSSQPPELLNLFPSNSPSEQSQNA