; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0037261 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0037261
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionU-box domain-containing protein 1-like
Genome locationchr2:4684057..4685019
RNA-Seq ExpressionLag0037261
SyntenyLag0037261
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608146.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-15393.44Show/hide
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KAG7031783.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.0e-15493.75Show/hide
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XP_022940416.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]3.8e-15292.81Show/hide
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XP_022982428.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita maxima]2.6e-15393.44Show/hide
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XP_023524300.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-15293.12Show/hide
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        I N+D +TYSN DSVYS WY
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP7 Uncharacterized protein2.6e-14689.66Show/hide
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A0A1S3CR56 U-box domain-containing protein 8-like5.0e-14289.61Show/hide
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        MRS SVATAHK IT+CIA ARSDAHEVQEKALQNLV +TQVSPL+RNLL QVDGSI ILI LSKSS ST+QSLSLSILFNLSLN+DMKKLLASME IYHL
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        VLGLLARFEEGLRALIK DRIV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESE CL DAL+LPEF GVVADLSVRGS KAR+RA+LLMNKIMNSDFDTYSN
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A0A6J1CG09 U-box domain-containing protein 1-like2.2e-14287.5Show/hide
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        LLASMETIYHLN LISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTI+LLVRALSVPSV  AHH+LCSLAELGQFHGNCTVAVRSGA+ VL+ VVEST
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          EDLAGTAL VLGLLARFEEGLRAL+K D IVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDES+ CLRDAL +PEFLGVVADLSVRGS KAR+RA LLMNK
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        +MNSD D YSN  SVYSQWY
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A0A6J1FIE4 U-box domain-containing protein 1-like1.8e-15292.81Show/hide
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        IMN+D + YSN DSVYS WY
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A0A6J1J4T3 U-box domain-containing protein 1-like1.3e-15393.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5XEZ8 U-box domain-containing protein 23.2e-1328.98Show/hide
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        SSS+ T  K +   I D +S + + Q +A   +  + + S   R ++A+ + +IP L+SL  S+   IQ+ +++ L NLS+N++ K L+A    I  L  
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Query:  LISLGSPETVKL-SSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVV
        ++  G  E  K  S++ + SL+++++ K + G AG I+ LV  L   S+        +L  L   H N T  + +GAV  LV +++   G  +   A+VV
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Query:  LGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALR---LPEFLGVVADLSVRGSTKARD
        L  LA   EG +  I  +  +  +V V++      KE AT  LL+L   S     + +R   +P  + +    + RG  KA++
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Q681N2 U-box domain-containing protein 151.2e-1225.96Show/hide
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        K+    + +A S +  E Q ++++ +  + + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S IQ  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ 
Subjt:  KNITQCIADARSDAH-EVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSP

Query:  ETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE
        E  + S++ + SL+MLD+NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G V  L+ +++      +   AL +L LLA   
Subjt:  ETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE

Query:  EGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKIMNSD
        EG +A+ ++   + ++V  ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+   +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  S+
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Q8GUG9 U-box domain-containing protein 111.6e-1226.2Show/hide
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        S + E +  A+  + ++++ S   R L+A+  G+IP+L++L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + +++ + S
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Query:  LAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRI
        L++ D+NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G V+ LV ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +
Subjt:  LAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRI

Query:  VNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRATLLM
          +++ +L+     ++E A  ILL L      C RD  +L     LG V    DLS  G+ + + +A  L+
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Q9C9A6 U-box domain-containing protein 101.4e-1128.16Show/hide
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        S  SF   S   S+  A   K  +Q I D R+   E++        ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+
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Query:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVEST
        L+     +  +  ++  GS E  + +++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G V  LV ++  +
Subjt:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVEST

Query:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRAT
        S E +A  AL +L +LA  +    A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +L     LG V    +LS  G+ +A+ +A 
Subjt:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRAT

Query:  LLMNKIMNS
         L+  +  S
Subjt:  LLMNKIMNS

Q9SNC6 U-box domain-containing protein 132.1e-1226.55Show/hide
Query:  DARSDAHEVQ---EKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLS
        D RS A E++   ++   N VAI +             G+IP+L+ L  +  S IQ  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + +
Subjt:  DARSDAHEVQ---EKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLS

Query:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL
        ++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L+  +         +L  L  + GN   A+R+G +  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+
Subjt:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL

Query:  IKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKI
        I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L       L +A +L   +G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
Subjt:  IKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23030.1 ARM repeat superfamily protein1.1e-1326.2Show/hide
Query:  SDAHEVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICS
        S + E +  A+  + ++++ S   R L+A+  G+IP+L++L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + +++ + S
Subjt:  SDAHEVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICS

Query:  LAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRI
        L++ D+NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G V+ LV ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +
Subjt:  LAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRI

Query:  VNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRATLLM
          +++ +L+     ++E A  ILL L      C RD  +L     LG V    DLS  G+ + + +A  L+
Subjt:  VNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRATLLM

AT1G71020.1 ARM repeat superfamily protein9.7e-1328.16Show/hide
Query:  SVASFHSSSSMRSSSVATAHKNITQCIADARSDAHEVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSST-IQSLSLSILFNLSLNNDMKK
        S  SF   S   S+  A   K  +Q I D R+   E++        ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+
Subjt:  SVASFHSSSSMRSSSVATAHKNITQCIADARSDAHEVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSST-IQSLSLSILFNLSLNNDMKK

Query:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVEST
        L+     +  +  ++  GS E  + +++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G V  LV ++  +
Subjt:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVEST

Query:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRAT
        S E +A  AL +L +LA  +    A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +L     LG V    +LS  G+ +A+ +A 
Subjt:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRAT

Query:  LLMNKIMNS
         L+  +  S
Subjt:  LLMNKIMNS

AT1G71020.2 ARM repeat superfamily protein9.7e-1328.16Show/hide
Query:  SVASFHSSSSMRSSSVATAHKNITQCIADARSDAHEVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSST-IQSLSLSILFNLSLNNDMKK
        S  SF   S   S+  A   K  +Q I D R+   E++        ++++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+
Subjt:  SVASFHSSSSMRSSSVATAHKNITQCIADARSDAHEVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSST-IQSLSLSILFNLSLNNDMKK

Query:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVEST
        L+     +  +  ++  GS E  + +++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G V  LV ++  +
Subjt:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVEST

Query:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRAT
        S E +A  AL +L +LA  +    A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +L     LG V    +LS  G+ +A+ +A 
Subjt:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARDRAT

Query:  LLMNKIMNS
         L+  +  S
Subjt:  LLMNKIMNS

AT3G46510.1 plant U-box 131.5e-1326.55Show/hide
Query:  DARSDAHEVQ---EKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLS
        D RS A E++   ++   N VAI +             G+IP+L+ L  +  S IQ  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + +
Subjt:  DARSDAHEVQ---EKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLS

Query:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL
        ++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L+  +         +L  L  + GN   A+R+G +  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+
Subjt:  SSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRAL

Query:  IKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKI
        I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L       L +A +L   +G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
Subjt:  IKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKI

AT5G42340.1 Plant U-Box 158.8e-1425.96Show/hide
Query:  KNITQCIADARSDAH-EVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSP
        K+    + +A S +  E Q ++++ +  + + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S IQ  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ 
Subjt:  KNITQCIADARSDAH-EVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSP

Query:  ETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE
        E  + S++ + SL+MLD+NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G V  L+ +++      +   AL +L LLA   
Subjt:  ETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE

Query:  EGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKIMNSD
        EG +A+ ++   + ++V  ++     +KE AT +LL L   +   +  AL+   +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  S+
Subjt:  EGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKIMNSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGTTGCTTCTTTCCATTCATCATCATCCATGAGGTCCTCGAGTGTTGCAACTGCACATAAGAATATAACACAGTGTATAGCCGATGCTCGGTCGGACGCTCACGA
AGTTCAGGAAAAGGCTCTTCAAAACTTGGTTGCCATTACCCAGGTTAGTCCCCTGTACAGGAACTTGCTCGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATTTCTCTCT
CCAAATCATCTTCCTCTACCATCCAATCTCTTTCATTGTCTATTCTCTTCAATCTGTCTCTGAACAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCAATGGAAACCATCTACCAT
CTCAATACACTCATATCCTTGGGCTCGCCCGAAACCGTCAAGTTGTCTTCCTCATTGATTTGCAGCCTTGCAATGCTAGACAAGAATAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCAGG
GACCATACAGTTATTGGTTAGAGCACTTTCAGTTCCCAGTGTTCCTGCTGCCCATCACCTTCTCTGTTCTTTAGCTGAATTGGGTCAGTTTCATGGAAACTGCACTGTGG
CCGTTCGATCGGGAGCTGTCTCGGTTCTTGTTGGTGTAGTGGAGAGTACTAGCGGAGAGGATCTTGCTGGCACTGCTCTTGTTGTTCTCGGTCTCTTGGCTAGATTTGAG
GAGGGGTTGAGGGCTTTGATAAAAATCGATCGGATCGTGAATTCAATGGTTAATGTGTTGAAAGGAAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACCGAGATTCTTTTACG
ATTGTTCGACGAGAGTGAAGGCTGTCTGAGAGATGCTTTGAGGTTGCCAGAGTTTTTGGGTGTTGTTGCTGATCTTTCAGTAAGAGGATCTACAAAAGCTAGAGATAGAG
CTACTCTTCTTATGAATAAGATCATGAATAGCGACTTTGATACATATTCAAATACTGATTCAGTGTATTCACAATGGTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAGTTGCTTCTTTCCATTCATCATCATCCATGAGGTCCTCGAGTGTTGCAACTGCACATAAGAATATAACACAGTGTATAGCCGATGCTCGGTCGGACGCTCACGA
AGTTCAGGAAAAGGCTCTTCAAAACTTGGTTGCCATTACCCAGGTTAGTCCCCTGTACAGGAACTTGCTCGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATTTCTCTCT
CCAAATCATCTTCCTCTACCATCCAATCTCTTTCATTGTCTATTCTCTTCAATCTGTCTCTGAACAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCAATGGAAACCATCTACCAT
CTCAATACACTCATATCCTTGGGCTCGCCCGAAACCGTCAAGTTGTCTTCCTCATTGATTTGCAGCCTTGCAATGCTAGACAAGAATAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCAGG
GACCATACAGTTATTGGTTAGAGCACTTTCAGTTCCCAGTGTTCCTGCTGCCCATCACCTTCTCTGTTCTTTAGCTGAATTGGGTCAGTTTCATGGAAACTGCACTGTGG
CCGTTCGATCGGGAGCTGTCTCGGTTCTTGTTGGTGTAGTGGAGAGTACTAGCGGAGAGGATCTTGCTGGCACTGCTCTTGTTGTTCTCGGTCTCTTGGCTAGATTTGAG
GAGGGGTTGAGGGCTTTGATAAAAATCGATCGGATCGTGAATTCAATGGTTAATGTGTTGAAAGGAAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACCGAGATTCTTTTACG
ATTGTTCGACGAGAGTGAAGGCTGTCTGAGAGATGCTTTGAGGTTGCCAGAGTTTTTGGGTGTTGTTGCTGATCTTTCAGTAAGAGGATCTACAAAAGCTAGAGATAGAG
CTACTCTTCTTATGAATAAGATCATGAATAGCGACTTTGATACATATTCAAATACTGATTCAGTGTATTCACAATGGTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVASFHSSSSMRSSSVATAHKNITQCIADARSDAHEVQEKALQNLVAITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILISLSKSSSSTIQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYH
LNTLISLGSPETVKLSSSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALSVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAVSVLVGVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE
EGLRALIKIDRIVNSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLRLFDESEGCLRDALRLPEFLGVVADLSVRGSTKARDRATLLMNKIMNSDFDTYSNTDSVYSQWY