; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0037869 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0037869
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionBoron transporter
Genome locationchr2:10018798..10024313
RNA-Seq ExpressionLag0037869
SyntenyLag0037869
Gene Ontology termsGO:0006820 - anion transport (biological process)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0005452 - inorganic anion exchanger activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003020 - Bicarbonate transporter, eukaryotic


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8671247.1 putative boron transporter 5 [Hibiscus syriacus]3.0e-1567.12Show/hide
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KAF5937260.1 hypothetical protein HYC85_024766 [Camellia sinensis]4.0e-1567.12Show/hide
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RWR94381.1 putative boron transporter 2 [Cinnamomum micranthum f. kanehirae]1.0e-1558.62Show/hide
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XP_015891772.1 boron transporter 1-like [Ziziphus jujuba]3.0e-1567.12Show/hide
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XP_028088999.1 boron transporter 1-like isoform X1 [Camellia sinensis]2.3e-1565.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A3S3R4N1 Putative boron transporter 25.0e-1658.62Show/hide
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A0A6A2YD24 Putative boron transporter 51.5e-1567.12Show/hide
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A0A6P4AC24 boron transporter 1-like1.5e-1567.12Show/hide
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A0A6P5ZYD4 boron transporter 1-like3.3e-1565.75Show/hide
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A0A7J7G922 Uncharacterized protein1.9e-1567.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8VYR7 Boron transporter 15.7e-1764.38Show/hide
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Q93Z13 Probable boron transporter 32.8e-1155.71Show/hide
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Q9M1P7 Probable boron transporter 21.7e-1664.38Show/hide
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Q9SSG5 Putative boron transporter 51.8e-0747.76Show/hide
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Q9XI23 Boron transporter 41.8e-0748.48Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G47160.1 HCO3- transporter family4.1e-1864.38Show/hide
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AT2G47160.2 HCO3- transporter family2.1e-1452.33Show/hide
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AT3G06450.1 HCO3- transporter family2.0e-1255.71Show/hide
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AT3G06450.2 HCO3- transporter family2.0e-1255.71Show/hide
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AT3G62270.1 HCO3- transporter family1.2e-1764.38Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGAAACTTTTGTTCCTTTTCGAGGAATCATGAATGACCTGAAGGGGAGGTTGGTTTGTTACAAACAAGACTGGACTGGGTTTTGGCTCCCACCATTTACATATTC
TTTGCCTATTTCATTTGGTGAACAGTTGGAGAGAAATACTGATGCAGTGCTGACTGCAGTTTCAAACCTTAGCCTCCACAGCTCTTTGTGGGATCATTCACTCTATTGTT
GGAGGTTGGCTACGAAGCTTGATAGCAGACTATGGAGTGCCGCTCATGGTTCTTGTTTGGACAGGCCTTATGCGATGTGGAAAGAGTTGCAGACTTCGATGGATAAACTA
TCTGAGGCCTGCTTCCTCGCACTCTCACGTGCTGCATTCTTCTTCCCGCCGGCTCCTCCTCCCTTTCAGCAGCTCAGTGTCGCCACCACCGCCGTCGCCTCTCTCCCGTT
CAGTGCTGCTGCCGCGGCCGACTTTCTTCCGTTCGAGCCACCGCAGGCTCCCTCCTCTTGTTGTTACTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGAAACTTTTGTTCCTTTTCGAGGAATCATGAATGACCTGAAGGGGAGGTTGGTTTGTTACAAACAAGACTGGACTGGGTTTTGGCTCCCACCATTTACATATTC
TTTGCCTATTTCATTTGGTGAACAGTTGGAGAGAAATACTGATGCAGTGCTGACTGCAGTTTCAAACCTTAGCCTCCACAGCTCTTTGTGGGATCATTCACTCTATTGTT
GGAGGTTGGCTACGAAGCTTGATAGCAGACTATGGAGTGCCGCTCATGGTTCTTGTTTGGACAGGCCTTATGCGATGTGGAAAGAGTTGCAGACTTCGATGGATAAACTA
TCTGAGGCCTGCTTCCTCGCACTCTCACGTGCTGCATTCTTCTTCCCGCCGGCTCCTCCTCCCTTTCAGCAGCTCAGTGTCGCCACCACCGCCGTCGCCTCTCTCCCGTT
CAGTGCTGCTGCCGCGGCCGACTTTCTTCCGTTCGAGCCACCGCAGGCTCCCTCCTCTTGTTGTTACTGGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SEACFLALSRAAFFFPPAPPPFQQLSVATTAVASLPFSAAAAADFLPFEPPQAPSSCCYW