| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607892.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.1e-53 | 92.19 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
M AQRPLRYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KK +EALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022139608.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Momordica charantia] | 5.5e-54 | 93.75 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
M +AQRPLRYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTR+KKVLEALDDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RRKSRLARRKKAVEIHHGWY PASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022935732.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita moschata] | 3.3e-54 | 94.53 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
+ KAQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KKV+EALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022976587.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 3.3e-54 | 94.53 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
+ KAQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KKV+EALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_023534903.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.2e-53 | 93.75 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
+ KAQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KKV+EALDDLKKKPE QSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1CG14 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 2.7e-54 | 93.75 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
M +AQRPLRYSVVCEAAP KK DSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTR+KKVLEALDDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RRKSRLARRKKAVEIHHGWY PASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1F6F1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 1.6e-54 | 94.53 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
+ KAQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KKV+EALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1FKZ1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.0e-53 | 92.19 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
M AQRPLRYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KK +EALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1IG57 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 1.6e-54 | 94.53 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
+ KAQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR+YNKARKSEIKTR+KKV+EALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1IVC5 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 1.3e-53 | 91.41 | Show/hide |
Query: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
M AQRPLRYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSEI+TR+KK +EALDDLKKKPEAQSEEVLP+EKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA
Subjt: MGKAQRPLRYSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAA
Query: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: RRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A7HJB0 30S ribosomal protein S20 | 3.3e-09 | 48.31 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
SA KR R +EKRR+ NKA K+ +K +IK VL A+ AQ + I +L +A S IDKA K G +H+N A+RRKSRLA + KA
Subjt: SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
|
|
| B0C2C8 30S ribosomal protein S20 | 2.5e-09 | 48.31 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
SA KR AE+ R+ NKA KS IKT K+ A+DD K P +++ I+ ++ +S IDKAVKVG HRNT AR+K+ LAR KA
Subjt: SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARRKKA
|
|
| P82130 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.5e-38 | 75.44 | Show/hide |
Query: YSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
+SVVCE A KKADSAAKR RQAE RR+ NKARKSE+KTR++KV EALD LKKK A +EE++PI+ LIAEA+S IDKAV GTLHRNTAARRKSRLAR
Subjt: YSVVCEAAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLARR
Query: KKAVEIHHGWYTPA
KK VEIHHGWYTP+
Subjt: KKAVEIHHGWYTPA
|
|
| Q8DJN4 30S ribosomal protein S20 | 2.5e-09 | 49.41 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLAR
SAAKRA+ AE+ R+ NKA +S ++T IK L A+ P E++ + + AFS IDKAVK G LHRNT ARRK+RL R
Subjt: SAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRKSRLAR
|
|
| Q9ASV6 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.7e-42 | 73.6 | Show/hide |
Query: QRPLRYSVVCE-AAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRK
Q+P+R +VCE AAPTKKADSAAKRARQAEKRR+YNK++KSE +TR+KKVLEAL+ LKKK +AQ++E++ +EKLI EA+S IDKAVKV LH+NT ARRK
Subjt: QRPLRYSVVCE-AAPTKKADSAAKRARQAEKRRIYNKARKSEIKTRIKKVLEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAFSVIDKAVKVGTLHRNTAARRK
Query: SRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
SRLARRKKAVEIHHGWY P + AAA
Subjt: SRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
