; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0038507 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0038507
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionextensin-3-like
Genome locationchr2:19000099..19000647
RNA-Seq ExpressionLag0038507
SyntenyLag0038507
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592192.1 hypothetical protein SDJN03_14538, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-0548.35Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPPPPE
        S++V LVIA+ V  LSL ST AEGY+ +++PPPP   S  P V      SSPP         +  D + SP      PPP    SPPP      +PPPPE
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPPPPE

Query:  NKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
         K      P P PP+   PPPP  SPPPPPP KK P  PPPPPKK P  PP   PP     K PPPP  +Y  PPPPPSPYY
Subjt:  NKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

KAG6592193.1 hypothetical protein SDJN03_14539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.5e-0747.37Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSP---DHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPP
        S++V LVI + V  LSL ST AEGY+ +++PPPP   S  P V      SSPP         + Y S P P   D     PPP    +PPPP+     PP
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSP---DHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPP

Query:  PPENK-----PRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
        PP  K     P P+  P P PP+   PPPP  SPPPPPPPKK P  PPPP KK P  PP   PP     K PPPP  +Y  PPPPPSPYY
Subjt:  PPENK-----PRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

KAG7025048.1 hypothetical protein SDJN02_13871, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.0e-0648.65Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSP---DHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPP
        S++V LVIA+ V  LSL ST AEGY+ +++PPPP   S  P V      SSPP         + Y S P P   D     PPP    +PPPP+    SPP
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSP---DHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPP

Query:  PPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
        P    P P+  P P PP+   PPPP  SPPPPPPPKK P  PPPP KK P  PP   PP     K PPPP  +Y  PPPPPSPYY
Subjt:  PPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

XP_022936365.1 extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata]6.8e-0548.66Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSP-----PPPDFVIDS
        S++V LVIA+ V  LSL ST AEGY+ +++PPPP   S  P V      SSPP         +  D + SP      PPP    SP     PPP  V  S
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSP-----PPPDFVIDS

Query:  PPPPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
        PPPP   PR +P P P P K   PPPP    PPPP PKK P  PPPPPKK P  PP   PP     K PPPP   Y SPPPPPSPYY
Subjt:  PPPPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

XP_022976650.1 extensin-3-like [Cucurbita maxima]3.0e-0547.8Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDD---SPPPPDFVIDSPP
        S++V LVIA+ V  LS  ST AEGY+ +++PPPP           + Y S PP             ++ SP      PPP  DD   SPPPP+     PP
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDD---SPPPPDFVIDSPP

Query:  PPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
        PP   PR +P P P P K   PPPP    PPPP PKK P  PPPPP+KK S PPPPP+   K PPPP   Y SPPPPPSPYY
Subjt:  PPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1F841 extensin-like isoform X24.3e-0550Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPPPPE
        S++V LVIA+ V  LSL ST AEGY+ +++PPPP   S  P V      SSPP         +  D + SP      PPP    SPPP      +PPPPE
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPPPPE

Query:  NKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPA---SPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
         K  P     P PP   +PPPPPA   SPPPPPP KK P  PPP PKK P  PPPPP+   K PPPP   Y SPPPPPSPYY
Subjt:  NKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPA---SPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

A0A6J1FDF6 extensin-3-like isoform X13.3e-0548.66Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSP-----PPPDFVIDS
        S++V LVIA+ V  LSL ST AEGY+ +++PPPP   S  P V      SSPP         +  D + SP      PPP    SP     PPP  V  S
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSP-----PPPDFVIDS

Query:  PPPPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
        PPPP   PR +P P P P K   PPPP    PPPP PKK P  PPPPPKK P  PP   PP     K PPPP   Y SPPPPPSPYY
Subjt:  PPPPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPP---PPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

A0A6J1FDF9 extensin-1-like isoform X36.2e-0445.56Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPPPPE
        S++V LVIA+ V  LSL ST AEGY+ +++PPPP           + Y   PP              + SP      PP  Y   PP  D    SPPPP 
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPPPPE

Query:  NKPRPRPRPRPRPPKMNQ-PPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
         K  P P+  P PP++ + PPPPP    PPPPP  K S PPPPP+KK S PPP P+   K PPPP   Y SPPPPPSPYY
Subjt:  NKPRPRPRPRPRPPKMNQ-PPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

A0A6J1IK20 extensin-3-like1.5e-0547.8Show/hide
Query:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDD---SPPPPDFVIDSPP
        S++V LVIA+ V  LS  ST AEGY+ +++PPPP           + Y S PP             ++ SP      PPP  DD   SPPPP+     PP
Subjt:  SLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDD---SPPPPDFVIDSPP

Query:  PPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY
        PP   PR +P P P P K   PPPP    PPPP PKK P  PPPPP+KK S PPPPP+   K PPPP   Y SPPPPPSPYY
Subjt:  PPENKPRPRPRPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTATTCTTTAATGGTCTCCCTTGTTATTGCAATTTTAGTGGCAACTCTAAGCTTGCCATCTACAATTGCTGAAGGGTATGAACCTTTCTTTACCCCTCCACCCCC
TTCAGATTCTTCCAATGAGCCAACCGTGTCATCGATCGACTATGACTCGTCACCACCCGACTCTGTTATTATCGACTCGCTACTACAAAGTTACGACTCTCATCCATCAC
CCGACCATGTTATTGATTTACCACCACCAGACTACGACGACTCTCCTCCACCACCCGATTTTGTTATTGACTCTCCACCTCCACCAGAGAACAAACCTCGTCCTCGTCCT
CGTCCTCGTCCACGACCACCCAAGATGAATCAGCCTCCTCCTCCTCCAGCATCGCCTCCTCCGCCGCCACCACCAAAGAAGAAGCCATCTCGTCCCCCACCGCCACCAAA
GAAGAAGCCGTCTCGTCCTCCGCCGCCACCGAGAAGGGGATACAAGCCGCCTCCACCCCCACCGCGAAAGTACACGTCGCCTCCTCCTCCACCATCTCCTTACTATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTATTCTTTAATGGTCTCCCTTGTTATTGCAATTTTAGTGGCAACTCTAAGCTTGCCATCTACAATTGCTGAAGGGTATGAACCTTTCTTTACCCCTCCACCCCC
TTCAGATTCTTCCAATGAGCCAACCGTGTCATCGATCGACTATGACTCGTCACCACCCGACTCTGTTATTATCGACTCGCTACTACAAAGTTACGACTCTCATCCATCAC
CCGACCATGTTATTGATTTACCACCACCAGACTACGACGACTCTCCTCCACCACCCGATTTTGTTATTGACTCTCCACCTCCACCAGAGAACAAACCTCGTCCTCGTCCT
CGTCCTCGTCCACGACCACCCAAGATGAATCAGCCTCCTCCTCCTCCAGCATCGCCTCCTCCGCCGCCACCACCAAAGAAGAAGCCATCTCGTCCCCCACCGCCACCAAA
GAAGAAGCCGTCTCGTCCTCCGCCGCCACCGAGAAGGGGATACAAGCCGCCTCCACCCCCACCGCGAAAGTACACGTCGCCTCCTCCTCCACCATCTCCTTACTATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGYSLMVSLVIAILVATLSLPSTIAEGYEPFFTPPPPSDSSNEPTVSSIDYDSSPPDSVIIDSLLQSYDSHPSPDHVIDLPPPDYDDSPPPPDFVIDSPPPPENKPRPRP
RPRPRPPKMNQPPPPPASPPPPPPPKKKPSRPPPPPKKKPSRPPPPPRRGYKPPPPPPRKYTSPPPPPSPYY