; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0038508 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0038508
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Descriptionextensin-3-like
Genome locationchr2:19056478..19057089
RNA-Seq ExpressionLag0038508
SyntenyLag0038508
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592193.1 hypothetical protein SDJN03_14539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-1861.76Show/hide
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KAG7025048.1 hypothetical protein SDJN02_13871, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-1659.8Show/hide
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XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]1.0e-1758.4Show/hide
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XP_022976649.1 extensin-3-like [Cucurbita maxima]8.9e-2262.83Show/hide
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XP_023535874.1 extensin-3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-1860.29Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A251U7B1 Putative extensin 38.7e-1558.22Show/hide
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        K    KSPPPPP      KSPPPPPPK    KSPPPPPK       PPPP PK     KSPPPPPP+KS  PPPPPK     KSPPPPPPK     KSPP
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A0A4V3WQ10 Uncharacterized protein1.9e-1456.67Show/hide
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        PPPPKK    S PPPPP K   KSPPPPPP   + KSPPPPP KK  K  SPPPPP   KSPPPPPP  K   PPPPPK               KSPPPP
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        PP    KSPPPPPPKK      PPP  Y+YKSPPPPP  Y
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A0A5J5B5J7 Uncharacterized protein4.8e-1355.41Show/hide
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        KSPPPPPP  K  PPP     Y+Y SPPPPP
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A0A5N5I4V5 Extensin-3-like1.9e-1459.45Show/hide
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        PS     Y S  PPPPP+ +SPPPP   Y+Y  PPPP K    YKSPPPP KK    KSPPPPPPKK +  KSPPPPPPKK N  KSPPPPPPKK  + +
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         SPPPPP K    KSPPPPP KK    KSPPPPP      KSPPPPPP+K       PPPPPK     KSPPPPPPK     KSPPPPPPKK        
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          PP   Y YKSPPPPP
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A0A6J1IP49 extensin-3-like4.3e-2262.83Show/hide
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        PPPPV YS PPP  YY PPP K DDEYKSPPPP  K   KSPPPPPP+K         KSPPPPPP+K         KSPPPPPP+K        +KSPP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein1.4e-0454.74Show/hide
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        Y S PPPP V  SPPPP Y Y  PPPP      YKSPPPPP       PPP     PPP     KSPPPPP       SPPPPPP   +   PPP     
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        PPP     KSPPPPP      SPPPPP   KSPPPPP   S  PPPP   KSPPPPP   S PPPPP  Y  PPP  Y Y SPPPPPY Y
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AT5G07740.1 actin binding1.8e-0445.71Show/hide
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         +    PPPPPP  + G  PPPPP      +PPPPP P      PPPPPP +   PPPPP        PPPPPP +  +PPPPPP  +     PPP    
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          +PPPPP P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCAAAGAAGAATGAAGAGAAGTCGCCGCCTCCGCCTCCACCAAAGAAGAACGAAGGCAAGTCACCTCCACCACCACCAAAGAAGAAGGAAGACAAGTCGCCGCCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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