| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6592333.1 DNA primase small subunit, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.1e-237 | 91.63 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
MV+E ENG SDMVIDGNEQKPK IV +GFDANYLKIYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVID+TLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIA+YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYIEVL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEK+LDMIHDESITSELRGRWQ+NRRPSK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
DVN+VRWEQLKNMLQSGKHK+QGMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PERCDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
Query: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
ETDWDRTSLGESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| XP_022925368.1 DNA primase small subunit [Cucurbita moschata] | 4.0e-237 | 91.63 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
MV+E ENG SDMVIDGNEQKPK IV +GFDANYL+IYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIA+YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYIEVL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQ+NRRPSK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
DVN+VRWEQLKNMLQSGKHK+ GMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PERCDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
Query: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
ETDWDRTSLGESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| XP_022973496.1 DNA primase small subunit [Cucurbita maxima] | 8.4e-235 | 92.62 | Show/hide |
Query: SDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGS
+DMVIDGNEQKPK IV +GFDANYLKIYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KEKCPFKIDIG
Subjt: SDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGS
Query: VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
VYSVDPAKRHAYAG NVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
Subjt: VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
Query: RAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQL
RAAIA+YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYIEVL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQ+NRRPSK DVN+VRWEQL
Subjt: RAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQL
Query: KNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVDGETDWDRTSL
KNMLQSGKHK+QGMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PERCDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD ETDWDRTSL
Subjt: KNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVDGETDWDRTSL
Query: GESIRFFRSSFLQPLLKSCK
GESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| XP_023535939.1 DNA primase small subunit [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.1e-237 | 91.86 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
MV+E ENG SDMVIDGNEQKPK IV + FDANYLKIYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIA+YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYIEVL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQ+NRRPSK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
DVN+VRWEQLKNMLQSGKHK+QGMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PERCDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
Query: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
ETDWDRTSLGESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| XP_038889665.1 DNA primase small subunit [Benincasa hispida] | 4.9e-235 | 91.16 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
MV +ENG SDMVIDGNEQKPK V DGFDANYLKIYYGKLFPY DFFKWMSYGNDGKHPG+D+SYFGRREFSFTLDND+YLRFQSFNSLSEMENSIKE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGA VCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYIEVL+D FES+LL SQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRG+WQ+NRR SK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
DVN VRWE+LKNMLQSGK+KAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PE CDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
Query: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
GE WDRTSLGESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KUP7 DNA primase | 2.9e-233 | 90.47 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
MV VENG SDMVIDGNEQKPK V DGFDANYLKIYYGKLFPY DFFKWMSYGNDGKHPGSD+SYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFN+LSEME SIKE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYA DNVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVI TTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFL RSY EVL+D FES+LLCSQKIFSTEERYEKILDMI DESITS+LRGRWQ+NRR SK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
DVN +RWEQLK++LQSGKHKAQGMRRHVEEIVFS+TYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PE CDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
Query: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
E DWDRTSLGESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| A0A5A7T8Y3 DNA primase | 7.0e-219 | 90.82 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
MV VENG SDMVIDGNEQKPKK V DGFDANYLKIYYGKLFPY DFFKWMSYGNDGKHPGSD+SYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFN+LSEME SIKE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
+CPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSY EVL+D FES+LLC QKIFSTEERYEKILDMI DESITS+LRGRWQ+NRR SK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
DVN +RWEQLKN+LQSGKHKAQGMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PE CDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
Query: GET
ET
Subjt: GET
|
|
| A0A6J1CKZ3 DNA primase | 1.5e-232 | 88.04 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
M+ E VENG DM IDG EQKP+K+VPDGFD NYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSD+SYFGRREFSFTL+NDIYLR+QSFN+LSEMENSIKE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
KCPFKIDIG VYSVD AKRHAYAGDNVFTPVEREL+FDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIAE+FHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSY EVL+D FES LLCSQKIFSTEERYEKILDMI DES+TSELRGRWQENR+PSKK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDM---
DVN VRWEQLK+MLQS KHKAQGMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKH NHLLKAPFCVHPKTGR+CVPINPE CDEFDPTTVPT+ QLLEE NA DM
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDM---
Query: ----------IVDGETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
VDGETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
Subjt: ----------IVDGETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| A0A6J1EEZ9 DNA primase | 2.0e-237 | 91.63 | Show/hide |
Query: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
MV+E ENG SDMVIDGNEQKPK IV +GFDANYL+IYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KE
Subjt: MVNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKE
Query: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
KCPFKIDIG VYSVDPAKRHAYAG NVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Subjt: KCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCD
Query: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
GKARRLSNEQRAAIA+YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYIEVL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQ+NRRPSK
Subjt: GKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKK
Query: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
DVN+VRWEQLKNMLQSGKHK+ GMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PERCDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD
Subjt: DVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVD
Query: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
ETDWDRTSLGESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GETDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| A0A6J1I8T4 DNA primase | 4.1e-235 | 92.62 | Show/hide |
Query: SDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGS
+DMVIDGNEQKPK IV +GFDANYLKIYYGKLFP+ DFFKWMSYGNDGKHPGSD SY GRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEME+S KEKCPFKIDIG
Subjt: SDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGS
Query: VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
VYSVDPAKRHAYAG NVFTPVERELVFDIDMTDYDDV+YCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
Subjt: VYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQ
Query: RAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQL
RAAIA+YFHLYQGNENSRKKISLT PVLHPFLARSYIEVL+D FESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQ+NRRPSK DVN+VRWEQL
Subjt: RAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQL
Query: KNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVDGETDWDRTSL
KNMLQSGKHK+QGMRRHVEEIVFS+TYPRLD EVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGR+CVPI+PERCDEFDPTTVPTV QLLEE NA DM VD ETDWDRTSL
Subjt: KNMLQSGKHKAQGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVDGETDWDRTSL
Query: GESIRFFRSSFLQPLLKSCK
GESIRFFRS+FLQPLLKSCK
Subjt: GESIRFFRSSFLQPLLKSCK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O14215 DNA primase small subunit | 1.2e-79 | 38.33 | Show/hide |
Query: VNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYG----NDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENS
++E++ NG +DG +Q D+ + YY LFP+ F+W+++G ND F REF+FTL ND Y+R+ SF++ E++
Subjt: VNEVVENGVSDMVIDGNEQKPKKIVPDGFDANYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYG----NDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENS
Query: IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW
CP + ++G VYS +P R + F P+++ELVFDIDMTDYDDV+ CCS ++C CWP +T A++V+D +DFGF HILWV+SGRRG+H W
Subjt: IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCW
Query: VCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGN-ENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRR
+CD A L + R IA Y + GN + + I+ LHP L RS + +L+ F +L Q ++++E E +L ++ D+ + S LR +W+ +
Subjt: VCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGN-ENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRR
Query: PSKKDVNVVRWEQLKNMLQSGKHKA---QGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFN
S K+ +W + +L SG + + ++IV +Y YPRLD EV++H+NHLLK+PFCVHP T RVCVPI+ ER D F+P VPTV LL+E +
Subjt: PSKKDVNVVRWEQLKNMLQSGKHKA---QGMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFN
Query: AGDMIVDGETDWDRTSLGES
+G T+ E+
Subjt: AGDMIVDGETDWDRTSLGES
|
|
| P20664 DNA primase small subunit | 3.5e-90 | 44.08 | Show/hide |
Query: LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERE
LK+YY +LFPY +++W++YG G ++YF REFSFTL +DIY+R+QSFN+ SE+E +++ P+KIDIG+VYS P +H F E+E
Subjt: LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERE
Query: LVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLT
LVFDIDMTDYDDV+ CCS AD+C CW LMT A+++ID L++DFGF H LWV+SGRRGVHCWVCD R+LS+ R+ I EY L +G ++ +KK+ L
Subjt: LVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLT
Query: SPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQLKNMLQSGKH-KAQGMRRHVE-EIV
V HPF+ +S I +++ FE L Q I +E ++KIL ++ E+I EL+ +Q K + RWE L+ + S ++ K +E E++
Subjt: SPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQLKNMLQSGKH-KAQGMRRHVE-EIV
Query: FSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVDGETDWDRTSLGES--IRFFRSSFLQPLLK
Y +PRLD V+K +NHLLK+PF VHPKTGR+ VPI+ + D+FDP TVPT+ + E DM+ E + + +R ++ + L P +K
Subjt: FSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGDMIVDGETDWDRTSLGES--IRFFRSSFLQPLLK
|
|
| P49642 DNA primase small subunit | 1.2e-90 | 43.69 | Show/hide |
Query: LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERE
LK+YY +LFPY+ +++W++YG G ++YF REFSFTL +DIY+R+QSFN+ S++E +++ P+KIDIG+VYS P +H F E+E
Subjt: LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERE
Query: LVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLT
LVFDIDMTDYDDV+ CCS AD+C CW LMT AI++ID L++DFGF H LWV+SGRRGVHCWVCD R+LS+ R+ I EY L +G ++ +KK+ L
Subjt: LVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQGNENSRKKISLT
Query: SPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRH---VEEI
S +HPF+ +S I +++ FE L +Q I +E ++KIL ++ E+I EL+ +Q++ ++ RWE LK + ++ + + EI
Subjt: SPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWEQLKNMLQSGKHKAQGMRRH---VEEI
Query: VFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEF------------NAGDMIVDGET-DWDRTSLGESIRFFR
+ Y +PRLD V+K +NHLLK+PF VHPKTGR+ VPI+ ++ D+FDP TVPT+ + E N + V T D+ +TSL ++ F
Subjt: VFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEF------------NAGDMIVDGET-DWDRTSLGESIRFFR
Query: SSFLQPLLKSCK
FL+ L KS K
Subjt: SSFLQPLLKSCK
|
|
| Q24317 DNA primase small subunit | 2.8e-84 | 44.35 | Show/hide |
Query: LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERE
L +YY +LFP+ F++W+SYG+ S+ + F RE SFTL +DIY+R+ F++ +E+E I + P KIDIG V P + G TPV+RE
Subjt: LKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGNDGKHPGSDRSYFGRREFSFTLDNDIYLRFQSFNSLSEMENSIKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAYAGDNVFTPVERE
Query: LVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHL-----YQGNENSRK
LVFDIDMTDYD+V+ CCSGA VCL CW M A +V+D LR+DFGF HI+W+FSGRRG+HCWVCD +AR L R A+AEY ++ + G + R
Subjt: LVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHL-----YQGNENSRK
Query: KISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWE---QLKNMLQSGKHKA--QGM
+ P H L R+ ++++E FE +L Q +F T + K+L+M+HD++ EL Q+N V WE + N +++ A + +
Subjt: KISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFESKLLCSQKIFSTEERYEKILDMIHDESITSELRGRWQENRRPSKKDVNVVRWE---QLKNMLQSGKHKA--QGM
Query: RRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGD
+ V EI YPRLD VT+ NHLLKAPFC+HP TG+VCVP + +FDPTTVPT+ QLL E NA D
Subjt: RRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEFNAGD
|
|
| Q7KQM1 DNA primase small subunit | 3.9e-73 | 36.53 | Show/hide |
Query: NYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGND--GKHPG-SDRSYFGRREFSFTL------DNDIYLRFQSFNSLSEMENS-IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAY
N L YY L P D + W++Y ND GK+ +D +F +REFSFT +IY+R+ SF++ E +N + + P K DIG++Y+ P +
Subjt: NYLKIYYGKLFPYTDFFKWMSYGND--GKHPG-SDRSYFGRREFSFTL------DNDIYLRFQSFNSLSEMENS-IKEKCPFKIDIGSVYSVDPAKRHAY
Query: AGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQ
GD +F PV++EL+FDIDM DYDD++ CC+ VC CW +T AI ++DT LR+DF F HILWV+SGRRG+HCWV D R + + RAA+A+Y ++
Subjt: AGDNVFTPVERELVFDIDMTDYDDVKYCCSGADVCLDCWPLMTAAIKVIDTTLRDDFGFNHILWVFSGRRGVHCWVCDGKARRLSNEQRAAIAEYFHLYQ
Query: GNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFE--SKLLCSQKIFST-EERYEKILDMIHDES--ITSELRG-------RWQENRRPSKKDVNVVRWEQL
G++ +KK+S+ +P R++ + C++ L+ Q F +K++D + S +T L+ + N + +++ ++ +
Subjt: GNENSRKKISLTSPVLHPFLARSYIEVLEDCFE--SKLLCSQKIFST-EERYEKILDMIHDES--ITSELRG-------RWQENRRPSKKDVNVVRWEQL
Query: KNMLQSGKHKAQ-------GMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEF-NAGDMIVDGE
N L + + M V+EIVF +TYPRLD V+K +NHLLK+PFC+H TGRVCVP++ + + F+P +VPT+ L E+F + + ++ E
Subjt: KNMLQSGKHKAQ-------GMRRHVEEIVFSYTYPRLDSEVTKHMNHLLKAPFCVHPKTGRVCVPINPERCDEFDPTTVPTVVQLLEEF-NAGDMIVDGE
Query: TDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSC
+RTSL I +FR F++ +L SC
Subjt: TDWDRTSLGESIRFFRSSFLQPLLKSC
|
|
