; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0039981 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0039981
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationchr13:1308671..1311648
RNA-Seq ExpressionLag0039981
SyntenyLag0039981
Gene Ontology termsGO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
GO:0003878 - ATP citrate synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type
IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7012803.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.0e-23797.4Show/hide
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A0A6J1FZI1 ATP citrate synthase4.9e-23897.64Show/hide
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A0A6J1HSY8 ATP citrate synthase1.7e-23897.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22718 ATP-citrate synthase alpha chain protein 26.7e-22488.65Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEHFKR+ G++LPI+S Q+ + TD NELVE+EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A+V +FVKERLGK VEM GCKG
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        PITTFIVEPFVPHNEEFYLNIVS+RLGCS+SFSECGGIDIEENWDKVKTI +PTGASLT E+CAPLVATLPLEIKGE+EDFI+ +F LF+DLDFTFLEMN
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        PFTLVDGKPYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGDIEFP+PFGRVMS+TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMR+LG+E+GVPIE
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        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 31.3e-20883.53Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEH KR+   DL I+SAQV ESTDF EL  +E WLSS+KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLAEV  FVK RLG  VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC++SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+P   S+T EVCAPL+ATLPLE++ +I +FI   FA+FQDLDF+F+EMN
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        PFTLVDG+P+PLDMRGELDDTA+FKNF KWGDIEFPLPFGRV+S+TE+FIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT DPDGR RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE +LKA+RM+IYVRRGGPNYQ GLA+MRALGEELGVP+E
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        VYGPEATMTGICK+AI+CI
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 37.9e-20983.22Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLL+EH KR+   DL I SAQV ESTDF ELV +EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLA+V  FVKERLG  VEMGGCK 
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        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVSERLG ++SFSECGGI+IEENWDKVKT+F+PT  ++T + CAPL+ATLPLE++ +I DFI+ V+++FQDLDF+FLEMN
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        PFT+V+G+PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWG+I+FPLPFGRV+S +ESFIH LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCATADPDGR RAL+IGGGIANFTDVAATF+GIIRAL+EKE+KLKAARMNIYVRRGGPNYQ GLAKMR LG ELGVPIE
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        VYGPEATMTGICKQAI+CI A A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 28.4e-21184.16Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEH KR+ G DL I SAQV +STDF ELV ++PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+A+V  FVKERLG  VEMGGCK 
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        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVSERLG ++SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PT   +T + CAPL+ATLPLE +G+I DFIK VFA+FQDLDF+FLEMN
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        PFT+V+G+PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWG+IEFPLPFGRV+S+TE FIH LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCATADPDGR RAL+IGGGIANFTDV ATF+GIIRAL+EKE+KLKAARM+IYVRRGGPNYQ GLAKMR LG ELGVPIE
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        VYGPEATMTGICKQAIEC+ AAA
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Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 12.5e-22388.65Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEHFKR+ G++LPI+S Q+ E+TD NELVEKEPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V +FVKERLGK VEM GCKG
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        PITTFIVEPFVPHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT E+CAPLVATLPLEIK EIE+FIK +F LFQDLDFTFLEMN
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        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGDIEFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMRALG+++GVPIE
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        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-11.8e-22488.65Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEHFKR+ G++LPI+S Q+ E+TD NELVEKEPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V +FVKERLGK VEM GCKG
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        PITTFIVEPFVPHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT E+CAPLVATLPLEIK EIE+FIK +F LFQDLDFTFLEMN
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        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGDIEFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGVPIE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMRALG+++GVPIE
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        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-11.8e-22488.65Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEHFKR+ G++LPI+S Q+ E+TD NELVEKEPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V +FVKERLGK VEM GCKG
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        PITTFIVEPFVPHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT E+CAPLVATLPLEIK EIE+FIK +F LFQDLDFTFLEMN
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        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGDIEFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGVPIE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPNYQ+GLAKMRALG+++GVPIE
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Query:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
Subjt:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA

AT1G10670.3 ATP-citrate lyase A-17.1e-22184.65Show/hide
Query:  MARKKIREYDSKRLLKEHFKRICGRDLPIKSAQ--------------------VRESTDFNELVEKEPWLSSSKLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAE
        MARKKIREYDSKRL+KEHFKR+ G++LPI+S Q                    + E+TD NELVEKEPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+
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Query:  VTSFVKERLGKVVEMGGCKGPITTFIVEPFVPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEVCAPLVATLPLEIKGEIED
        V +FVKERLGK VEM GCKGPITTFIVEPFVPHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT E+CAPLVATLPLEIK EIE+
Subjt:  VTSFVKERLGKVVEMGGCKGPITTFIVEPFVPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEVCAPLVATLPLEIKGEIED

Query:  FIKSVFALFQDLDFTFLEMNPFTLVDGKPYPLDMRGELDDTASFKNFKKWGDIEFPLPFGRVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGG
        FIK +F LFQDLDFTFLEMNPFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGDIEFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGG
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Query:  ASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPN
        ASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCATA+PDG+SRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARM+I+VRRGGPN
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Query:  YQRGLAKMRALGEELGVPIEVYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        YQ+GLAKMRALG+++GVPIEVYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
Subjt:  YQRGLAKMRALGEELGVPIEVYGPEATMTGICKQAIECITAAA

AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-11.8e-22488.65Show/hide
Query:  MARKKIREYDSKRLLKEHFKRICGRDLPIKSAQVRESTDFNELVEKEPWLSSSKLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAEVTSFVKERLGKVVEMGGCKG
        MARKKIREYDSKRL+KEHFKR+ G++LPI+S Q+ E+TD NELVEKEPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A+V +FVKERLGK VEM GCKG
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Query:  PITTFIVEPFVPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEVCAPLVATLPLEIKGEIEDFIKSVFALFQDLDFTFLEMN
        PITTFIVEPFVPHNEE+YLN+VS+RLGCS+SFSECGGI+IEENWDKVKTIF+PTGASLT E+CAPLVATLPLEIK EIE+FIK +F LFQDLDFTFLEMN
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Query:  PFTLVDGKPYPLDMRGELDDTASFKNFKKWGDIEFPLPFGRVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLVDG PYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGDIEFPLPFGRVMS TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVDGKPYPLDMRGELDDTASFKNFKKWGDIEFPLPFGRVMSATESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGVPIE
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Query:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
Subjt:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA

AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-24.7e-22588.65Show/hide
Query:  MARKKIREYDSKRLLKEHFKRICGRDLPIKSAQVRESTDFNELVEKEPWLSSSKLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAEVTSFVKERLGKVVEMGGCKG
        MARKKIREYDSKRL+KEHFKR+ G++LPI+S Q+ + TD NELVE+EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A+V +FVKERLGK VEM GCKG
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Query:  PITTFIVEPFVPHNEEFYLNIVSERLGCSLSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGASLTSEVCAPLVATLPLEIKGEIEDFIKSVFALFQDLDFTFLEMN
        PITTFIVEPFVPHNEEFYLNIVS+RLGCS+SFSECGGIDIEENWDKVKTI +PTGASLT E+CAPLVATLPLEIKGE+EDFI+ +F LF+DLDFTFLEMN
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        PFTLVDGKPYPLDMRGELDDTA+FKNFKKWGDIEFP+PFGRVMS+TESFIHGLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPDGRSRALVIGGGIANFTDVAATFNGIIRALKEKEAKLKAARMNIYVRRGGPNYQRGLAKMRALGEELGVPIE
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Query:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA
        VYGPEATMTGICK+AI+ ITAAA
Subjt:  VYGPEATMTGICKQAIECITAAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCGCAAGAAGATCAGAGAGTACGATTCCAAGAGATTGTTGAAGGAGCACTTCAAAAGAATTTGTGGCCGTGATTTACCGATCAAATCAGCGCAGGTCAGAGAATC
AACCGATTTCAATGAGCTAGTTGAGAAGGAACCGTGGCTATCATCGTCAAAATTGGTTGTGAAGCCTGACATGTTGTTTGGAAAGCGTGGTAAAAGCGGTTTAGTTGCAC
TAAATCTGGATTTGGCTGAAGTAACTAGTTTTGTTAAGGAACGCCTAGGGAAAGTGGTGGAGATGGGCGGATGTAAAGGACCCATTACGACATTTATAGTTGAGCCTTTT
GTCCCACACAATGAAGAATTCTATCTGAATATTGTTTCAGAAAGGCTTGGCTGTAGTCTAAGCTTTTCAGAATGTGGAGGAATTGATATTGAAGAGAACTGGGATAAGGT
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CTGTTTTTGCTCTATTTCAAGATTTGGACTTCACTTTTCTGGAAATGAATCCCTTCACATTGGTTGATGGGAAGCCTTATCCATTGGACATGAGAGGCGAACTAGATGAT
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