CuGenDBv2

Gene ID	Lag0040048
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	EF-hand domain-containing protein
Genome location	chr13:1799509..1802416
RNA-Seq Expression	Lag0040048
Synteny	Lag0040048
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6601391.1 hypothetical protein SDJN03_06624, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7032169.1 hypothetical protein SDJN02_06212, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.5e-101

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XP_022956920.1 uncharacterized protein LOC111458461 isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_022991615.1 uncharacterized protein LOC111488176 isoform X1 [Cucurbita maxima]

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XP_023513837.1 uncharacterized protein LOC111778321 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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e value

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A0A6J1DAC4 uncharacterized protein LOC111019130

3.3e-97

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        S +S +KKSH+GRSM +   EHKLVIPV NDAS HASS  HRNLRD+S+S TDGSQ YITYRSCIPS NEEKLSV+GFEGIVLCLLLVSG VVYFRRKRT
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A0A6J1GXT8 uncharacterized protein LOC111458461 isoform X2

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A0A6J1GZ36 uncharacterized protein LOC111458461 isoform X1

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A0A6J1JTF7 uncharacterized protein LOC111488176 isoform X1

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A0A6J1JVD0 uncharacterized protein LOC111488176 isoform X2

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G69980.1 unknown protein

7.8e-43

47.17

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        L+ F + ++  S  +S+ A+ H  D   G+EEI    GRR LL FKETP+GSN+TF CS SGPCV+C  SEK  E+YRCSETGYRIP KC E+++  ++ 
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          KK+ +  +  D+          ++ +    + RNL D S  AT   SQ+Y TYRSC+PS +EEKLSV+GFE I+L L L+SG+ +Y R+++TV   G 
Subjt:  NDKKSHDGRSMLDEHKLVIPVLNDASGHASSIEHRNLRDSSISATD-GSQTYITYRSCIPSVNEEKLSVIGFEGIVLCLLLVSGSVVYFRRKRTVSTAGF

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTGTTGGAATTTTTCTTTGCTTCCTTTTCTTCTCCTTCTCTTCAGCTTCTCTGCTTCACTCGACGCCCAATTGCACAATACAGACACAGTTGGGGGAAACGAAGAAAT
TGAGATAGGGTTTGGCCGCAGAGCTCTGTTGAGTTTTAAAGAGACTCCTCGGGGAAGTAACGTAACCTTTGAATGCTCTCGTTCTGGTCCCTGTGTTGCCTGCCTCTACT
CCGAAAAGAACGATGAACAATATCGCTGCAGTGAGACTGGCTATCGTATTCCCCTGAAATGTGTGGAAATCAAAGACACTTCAAAAATTTCCAATGATAAAAAATCTCAT
GATGGTCGCTCAATGCTTGATGAGCACAAGCTTGTGATTCCTGTGCTGAATGATGCAAGTGGTCATGCTTCATCAATTGAACACAGAAATTTACGAGATAGTTCTATCTC
AGCAACAGATGGTTCTCAGACTTACATCACTTACAGAAGCTGTATTCCATCAGTTAATGAAGAAAAGTTGTCTGTGATAGGTTTTGAGGGCATTGTGCTTTGCTTGCTGC
TCGTAAGTGGTTCAGTTGTATACTTCAGAAGGAAGCGAACTGTTTCAACGGCTGGTTTTGCTTCTGGCAGGGTGCAGTCAAACTCCAGGTTCTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MCWNFSLLPFLLLLFSFSASLDAQLHNTDTVGGNEEIEIGFGRRALLSFKETPRGSNVTFECSRSGPCVACLYSEKNDEQYRCSETGYRIPLKCVEIKDTSKISNDKKSH
DGRSMLDEHKLVIPVLNDASGHASSIEHRNLRDSSISATDGSQTYITYRSCIPSVNEEKLSVIGFEGIVLCLLLVSGSVVYFRRKRTVSTAGFASGRVQSNSRF

Lag0040048 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome