CuGenDBv2

Gene ID	Lag0040092
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	AT-hook motif nuclear-localized protein
Genome location	chr13:2094686..2095288
RNA-Seq Expression	Lag0040092
Synteny	Lag0040092
Gene Ontology terms	GO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0003680 - AT DNA binding (molecular function) GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domains	IPR005175 - PPC domain IPR014476 - AT-hook motif nuclear-localized protein 15-29

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

GFP93890.1 putative DNA-binding protein escarola [Phtheirospermum japonicum]

5.5e-21

57.38

Show/hide

Query:  RLRLHHHLRPTAAAWDLYFERQRQCHQRRTPPARSCRRRLDPSREVRDFVALRIVPPA-----ATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASF
        RLR   HLR  AAA DL  +R R   QR+ P AR    R    R +RD V +R+VPPA     ATSLTI+LAG QGQV+GG V G L AA  VI+IAASF
Subjt:  RLRLHHHLRPTAAAWDLYFERQRQCHQRRTPPARSCRRRLDPSREVRDFVALRIVPPA-----ATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASF

Query:  TNVAYERLPLDEEDQQQAPGAA
        TNVAYERLPL+EE+  Q   AA
Subjt:  TNVAYERLPLDEEDQQQAPGAA

KAG7015741.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 21, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

8.7e-19

91.53

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

XP_022923385.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 23-like [Cucurbita moschata]

8.7e-19

91.53

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

XP_022965150.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 23-like [Cucurbita maxima]

8.7e-19

91.53

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

XP_038905818.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 23-like [Benincasa hispida]

8.7e-19

91.53

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L6J8 AT-hook motif nuclear-localized protein

1.2e-18

89.83

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQ P
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

A0A1S3BJP6 AT-hook motif nuclear-localized protein

1.2e-18

89.83

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQ P
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

A0A5A7UHV1 AT-hook motif nuclear-localized protein

1.2e-18

89.83

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQ P
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

A0A6J1EBN1 AT-hook motif nuclear-localized protein

4.2e-19

91.53

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

A0A6J1HMX3 AT-hook motif nuclear-localized protein 23-like

4.2e-19

91.53

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GGTVAGELTAA  VILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O22130 AT-hook motif nuclear-localized protein 22

3.0e-14

58.46

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAATAH
        PPAA+ LTI+LAG QGQV+GG+V G L A+  V+++AASF N AYERLPL+E+DQ++    A A+
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAATAH

O23620 AT-hook motif nuclear-localized protein 23

3.5e-18

74.6

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAAT
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GG+V GELTAA  VI+IAASFTNVAYERLPL+E++QQQ  G  +
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAAT

O82166 AT-hook motif nuclear-localized protein 21

2.1e-15

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GG V GEL AA  V+++AASFTNVAYERLPLDE ++    G
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG

Q9M2S3 AT-hook motif nuclear-localized protein 15

9.7e-13

62.71

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        P AA  LTI+LAG QGQV+GG VAG L A+  VI+IAA+F N  YERLP++EE QQ+ P
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

Q9SR17 AT-hook motif nuclear-localized protein 19

1.7e-12

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG
        PP +T LTI+LAG QGQV+GG+V G L AA  V+LIAA+F+N  YERLPL+EE+  +  G
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G35270.1 Predicted AT-hook DNA-binding family protein

1.5e-16

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GG V GEL AA  V+++AASFTNVAYERLPLDE ++    G
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG

AT2G45430.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 22

2.1e-15

58.46

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAATAH
        PPAA+ LTI+LAG QGQV+GG+V G L A+  V+++AASF N AYERLPL+E+DQ++    A A+
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAATAH

AT3G04570.1 AT-hook motif nuclear-localized protein 19

1.2e-13

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG
        PP +T LTI+LAG QGQV+GG+V G L AA  V+LIAA+F+N  YERLPL+EE+  +  G
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPG

AT3G55560.1 AT-hook protein of GA feedback 2

6.9e-14

62.71

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP
        P AA  LTI+LAG QGQV+GG VAG L A+  VI+IAA+F N  YERLP++EE QQ+ P
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAP

AT4G17800.1 Predicted AT-hook DNA-binding family protein

2.5e-19

74.6

Show/hide

Query:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAAT
        PP ATSLTIFLAG QGQV+GG+V GELTAA  VI+IAASFTNVAYERLPL+E++QQQ  G  +
Subjt:  PPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVAYERLPLDEEDQQQAPGAAT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTGACCGGACCGTTATGTGCTGATGTGGATCGGCTGCGACTGCATCACCACCTACGCCCGACGGCGGCAGCATGGGATCTGTATTTTGAGCGACAGCGGCAATGTCA
CCAACGTCGGACTCCGCCAGCCCGTAGCTGCCGCCGCCGTCTTGACCCTTCACGGGAGGTTCGAGATTTTGTCGCTCTCCGGATCGTTCCTCCCGCCGCCACCAGTTTGA
CGATATTTTTGGCTGGCGAGCAGGGGCAGGTCATCGGCGGGACGGTGGCTGGAGAATTAACGGCGGCCAGATCGGTGATTCTGATTGCAGCTTCGTTTACTAATGTGGCG
TATGAGAGATTACCACTGGATGAGGAGGATCAGCAGCAAGCTCCGGGGGCCGCCACCGCCCATTTCAAGACCCATCAAATTCAAGACTTCGCCATTCTTGAATTTGCCAC
TTCATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLTGPLCADVDRLRLHHHLRPTAAAWDLYFERQRQCHQRRTPPARSCRRRLDPSREVRDFVALRIVPPAATSLTIFLAGEQGQVIGGTVAGELTAARSVILIAASFTNVA
YERLPLDEEDQQQAPGAATAHFKTHQIQDFAILEFATS

Lag0040092 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome