CuGenDBv2

Gene ID	Lag0040364
Organism	Luffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description	DNA repair REX1-B protein
Genome location	chr13:4206875..4209191
RNA-Seq Expression	Lag0040364
Synteny	Lag0040364
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR039491 - Required for excision 1-B domain-containing protein

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7012978.1 hypothetical protein SDJN02_25732 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_004135056.1 uncharacterized protein LOC101210078 [Cucumis sativus]

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XP_023541138.1 uncharacterized protein C19orf60 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.9e-96

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XP_038892275.1 uncharacterized protein LOC120081463 [Benincasa hispida]

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e value

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A0A0A0KUN3 Uncharacterized protein

1.8e-92

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A0A1S3BGI9 uncharacterized protein LOC103489347

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A0A5D3CFT2 Uncharacterized protein

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A0A6J1G147 uncharacterized protein C19orf60 homolog

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A0A6J1HYI6 uncharacterized protein C19orf60 homolog

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SwissProt top hits

e value

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Alignment

Q9CYZ6 Required for excision 1-B domain-containing protein

1.0e-04

27.78

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         +RS+QE E+ +L   A +Q++   G
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G04910.1 unknown protein

1.7e-66

61.29

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        EDF +K+SL + +  D               T  +  +S TL LLR  LEIQQRRA+AYA LK GF EY+ SG E  YQ+LC EIT EFS CSKQV ++E
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        S F +P+  R +LA LL  +Q QEKQKLHLT  IQ+LKKAGRPSER+++HENC+FK P +HECVH+HEITEA+GTEEAEADAE+DNALKEAI+ VQDAVT
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Query:  TINEHMEEVRYEIAALE
        +INE++E++RYEI ALE
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAAGATTTTGACGAGAAGCTCTCTCTGGCTGAACAAATGGAGGAAGACGAAACAACCGATGCCAGCGATTCCTCTAACACTCTCACTTTGCTCCGCAAGTTTCTTGA
AATCCAGCAGCGTAGAGCGGAAGCTTATGCCAAGCTTAAAAGGGGCTTCGACGAGTATATGACTTCAGGAAGGGAGATATCTTACCAACAGCTTTGCGGTGAGATCACTG
CGGAATTCAGTAATTGCTCCAAACAAGTCATTGACATTGAGTCGAATTTCCGGAGTCCAGATTATAACAGGCTCGAGCTAGCCAATCTGCTTAGATCTGTTCAAGAACAG
GAAAAGCAGAAATTGCATCTGACAGCTCAAATTCAGTTATTGAAGAAGGCTGGCCGCCCATCAGAGCGCTTGGTGAGCCACGAGAATTGCAGATTCAAGACACCTCGAGA
GCACGAATGTGTACATGTCCATGAGATAACCGAAGCTTCTGGTACCGAGGAAGCCGAAGCAGATGCCGAATACGACAATGCTCTCAAGGAAGCAATCAAACGTGTGCAGG
ATGCTGTAACGACCATAAATGAGCACATGGAGGAAGTGAGATATGAGATTGCAGCTCTTGAAGATAAGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEDFDEKLSLAEQMEEDETTDASDSSNTLTLLRKFLEIQQRRAEAYAKLKRGFDEYMTSGREISYQQLCGEITAEFSNCSKQVIDIESNFRSPDYNRLELANLLRSVQEQ
EKQKLHLTAQIQLLKKAGRPSERLVSHENCRFKTPREHECVHVHEITEASGTEEAEADAEYDNALKEAIKRVQDAVTTINEHMEEVRYEIAALEDK

Lag0040364 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome