; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0040382 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0040382
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
Description5'-nucleotidase
Genome locationchr13:4346342..4348784
RNA-Seq ExpressionLag0040382
SyntenyLag0040382
Gene Ontology termsGO:0009117 - nucleotide metabolic process (biological process)
GO:0016311 - dephosphorylation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0000287 - magnesium ion binding (molecular function)
GO:0008253 - 5'-nucleotidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006434 - Pyrimidine 5'-nucleotidase, eukaryotic
IPR023214 - HAD superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601237.1 Cytosolic 5'-nucleotidase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.1e-17691.28Show/hide
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XP_022982686.1 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A [Cucurbita maxima]1.0e-17490.7Show/hide
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XP_023529831.1 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-17490.7Show/hide
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A0A1S3BGK8 5'-nucleotidase4.3e-17190.86Show/hide
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A0A5A7SXP5 5'-nucleotidase4.3e-17190.86Show/hide
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A0A6J1D8T4 5'-nucleotidase4.4e-17690.7Show/hide
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A0A6J1GY58 5'-nucleotidase2.2e-17591.28Show/hide
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A0A6J1J014 5'-nucleotidase4.9e-17590.7Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TAG6 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase B1.2e-4537.67Show/hide
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Q3UFY7 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase1.7e-4434.1Show/hide
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         +WW K HSLL +  +    I Q V  +T   REG    F+ L + ++P+ IFSAG+ DI+EE++RQ +     NI IVSN M F ++G L  FKG+ IH
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        + NKN    + ++                  ++ +TN++LLGD IGDL M+DG+      + +GFLND +E   + Y +++DIV   D ++  V  L+  
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        +   G
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Q5ZKF6 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase5.9e-4535.66Show/hide
Query:  LEASEAVVADSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQG---NPEYDAKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWG
        L+ S   +   + +   + A++  G  KLQV++DFD TL+R+  +GRR  TSH +L      + +   K  +L  +Y+P+E  P  ++EEK  LM EWW 
Subjt:  LEASEAVVADSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQG---NPEYDAKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWG

Query:  KTHSLLIEGGLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKN
        + H LL +  +    I Q V  + +  R+G  ELF+ L +  VP+ IFSAG+ D++EE++RQ  +  + N+ +VSN M FDD+G L  FK   IH+ NKN
Subjt:  KTHSLLIEGGLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKN

Query:  EHALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM
           L   A                  +  RT+++LLGD +GDL M+DG+ + +  + +GFLND +E     Y +A+DIV  +D ++
Subjt:  EHALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASM

Q6AYP7 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase7.8e-4534.43Show/hide
Query:  EEKGFLEASEAVVADSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGN-PEYDAKRD--ELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLM
        EE   L  +  ++     +++ + A+R  G  +LQV++DFD TL+R+  +G+R  +SH +L        D +++  EL+ +Y+P+E  P  +I+EK   M
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Query:  EEWWGKTHSLLIEGGLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIH
         +WW K HSLL +  +    I Q V  +T   REG    F+ L   ++P+ IFSAG+ DI+EE++RQ +     NI IVSN M F ++G L  FKG+ IH
Subjt:  EEWWGKTHSLLIEGGLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIH

Query:  SLNKNEHALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLIHQ
        + NKN    + ++                  +R +TN++LLGD IGDL M+DG+      + +GFLND +E   + Y +++DIV   D ++  V  L+  
Subjt:  SLNKNEHALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGL-NYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLIHQ

Query:  LFPAG
        +   G
Subjt:  LFPAG

Q7ZWS2 7-methylguanosine phosphate-specific 5'-nucleotidase A5.4e-4637.67Show/hide
Query:  DSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNPEYDAKRDE---LYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKTHSLLIEG
        D + L+  +  ++  G +KLQ+++DFD TL+R+  +G R  T + ++   N   D  R +   L+  Y+PLE  P  SIEEK  LM EWW K H L  E 
Subjt:  DSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNPEYDAKRDE---LYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKTHSLLIEG

Query:  GLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQK--LHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA
         +  D + Q V  +    R+G    F  L +R++P+ IFSAG+ D++EE++RQ    H    N ++VSN M FDDNG L  FKG  IH+ NKN   L   
Subjt:  GLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQK--LHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMA

Query:  APLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLN-YDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLIHQLFPA
            +              +  RTN+LLLGD +GDL M+DG++  +  I +GFLND +E   + +  ++DIV L D + L VV  I Q   A
Subjt:  APLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLN-YDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLIHQLFPA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38680.1 5'-nucleotidases;magnesium ion binding2.0e-11267.24Show/hide
Query:  ASEAVVADSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRG-QTSHGLLKQGNPEYDAKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKTHS
        ++  V+A    L   +  +R +GP K QV+ADFDATLTRY ++G RG QTSHGLL+QG+  YDAKR  LY +YHPLE SP I I+EKTKLMEEWWGKTH 
Subjt:  ASEAVVADSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRG-QTSHGLLKQGNPEYDAKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKTHS

Query:  LLIEGGLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHAL
        LLIEGGLT+DAIK+SVA+++IAFREGV ELFE LE++++PVLIFSAGLAD+IEEVLRQ L R+FKN++IVSNRMVF+D+G LVSFKGK IH LNKNEHAL
Subjt:  LLIEGGLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIVSNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHAL

Query:  DMAAPLHDQLG-DVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLIHQLF
        DMAAPLHD+LG D+    +++ ++++R NVLL+GDH+GDL MSDGL+Y+TRIS+GFLNDNIE SL+SYR +FD+VYLNDA M G ++L+ +LF
Subjt:  DMAAPLHDQLG-DVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDASMLGVVKLIHQLF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AATCCGGAACGTGATTGGGATGGAGGAGAAGGGGTTCTTGGAGGCTTCTGAGGCAGTTGTCGCCGATTCCGATCTGCTGAAGAAGAATCTGGATGCTATGCGCTTTTCGG
GTCCGCAGAAGCTCCAGGTTGTAGCTGACTTTGATGCTACGCTAACGAGATACTGGATTGATGGCCGCCGAGGGCAAACCAGTCATGGACTTCTAAAGCAGGGAAATCCA
GAATATGATGCTAAGAGGGATGAGCTTTATAAATATTACCATCCTTTGGAATATTCTCCTACCATTTCGATAGAAGAGAAAACAAAGCTCATGGAAGAGTGGTGGGGCAA
AACCCATTCACTTCTTATTGAAGGAGGTCTTACGTTTGATGCAATAAAGCAATCAGTTGCTTCTGCCACTATTGCTTTTAGGGAAGGAGTGGTTGAGCTGTTTGAGCTTC
TAGAGGAAAGGGATGTTCCTGTTCTTATATTTTCAGCGGGGCTTGCAGACATTATAGAGGAGGTCCTGAGGCAGAAGCTTCATAGATCCTTTAAAAACATCAGGATCGTT
TCAAATAGAATGGTGTTTGATGATAATGGTTGCCTTGTGTCGTTTAAGGGGAAGACAATTCATAGTCTAAATAAAAATGAGCATGCTCTTGATATGGCTGCTCCTCTTCA
TGACCAATTGGGTGATGTAGATGGGGCAATTGATGACAGTGCCTCAGTAAGAAAACGGACAAATGTACTTCTTCTTGGTGACCACATTGGGGATTTGGGGATGTCAGATG
GTTTAAACTATGACACTCGGATATCCGTTGGGTTTTTGAATGACAACATCGAGAACTCTCTTGACAGCTACCGCAATGCCTTTGATATTGTTTATCTGAATGATGCATCC
ATGCTGGGAGTGGTTAAACTTATACATCAGCTCTTTCCAGCTGGAGGTGTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GTTTAAACTATGACACTCGGATATCCGTTGGGTTTTTGAATGACAACATCGAGAACTCTCTTGACAGCTACCGCAATGCCTTTGATATTGTTTATCTGAATGATGCATCC
ATGCTGGGAGTGGTTAAACTTATACATCAGCTCTTTCCAGCTGGAGGTGTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGGRVQCISTIPLRFNSISKLRSSSPSFNFRRCFCGIRNVIGMEEKGFLEASEAVVADSDLLKKNLDAMRFSGPQKLQVVADFDATLTRYWIDGRRGQTSHGLLKQGNP
EYDAKRDELYKYYHPLEYSPTISIEEKTKLMEEWWGKTHSLLIEGGLTFDAIKQSVASATIAFREGVVELFELLEERDVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRSFKNIRIV
SNRMVFDDNGCLVSFKGKTIHSLNKNEHALDMAAPLHDQLGDVDGAIDDSASVRKRTNVLLLGDHIGDLGMSDGLNYDTRISVGFLNDNIENSLDSYRNAFDIVYLNDAS
MLGVVKLIHQLFPAGGV