; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0040889 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0040889
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionMicrosomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)
Genome locationchr13:9327711..9329336
RNA-Seq ExpressionLag0040889
SyntenyLag0040889
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0045047 - protein targeting to ER (biological process)
GO:0005787 - signal peptidase complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR009582 - Signal peptidase complex subunit Spc2/SPCS2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037360.1 putative signal peptidase complex subunit 2 [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-5591.06Show/hide
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XP_022996614.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Cucurbita maxima]6.9e-4994.34Show/hide
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XP_038875038.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Benincasa hispida]2.7e-5395.58Show/hide
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XP_038891545.1 probable signal peptidase complex subunit 2 [Benincasa hispida]8.2e-5096.23Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KSD0 Uncharacterized protein3.8e-5394.69Show/hide
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A0A1S3CIQ9 probable signal peptidase complex subunit 22.3e-5096.23Show/hide
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A0A5A7T1V9 Putative signal peptidase complex subunit 22.4e-5591.06Show/hide
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A0A6J1FVT7 probable signal peptidase complex subunit 24.4e-4994.34Show/hide
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A0A6J1K981 probable signal peptidase complex subunit 23.3e-4994.34Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P58684 Probable signal peptidase complex subunit 21.3e-4282.24Show/hide
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        YVV N +LQ I+YTKEKNAILFTYPP GSFTSTGLVVSSKLPRFSD YTL+I SADPKSISA + VQ TKSVT+WFTKDGVLVEGLFWKDVEALI +YA 
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Q5BJI9 Probable signal peptidase complex subunit 24.0e-0738.1Show/hide
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        Y +  GIL      KEKN  L      P+G        +SS L RF D YTL +S  D K+  + E  +FTKSV+ +F ++G LV   + K V  L D  
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Q5M8Y1 Probable signal peptidase complex subunit 28.9e-0736.19Show/hide
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        A E K
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39960.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)9.3e-4482.24Show/hide
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         EPKK K
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AT4G04200.1 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25)8.7e-4271.19Show/hide
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        G  ++ + GKYVV   ++Q I+Y KEKNAILFTYP  GSFTSTGLVVSSKLPRFSD YTL+I SADP+SISA + VQFTKSVT+W TKDGVLVEGLFWKD
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        VEAL+ +Y  A EPKK +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAACGCAATTTTGTTCACCTATCCTCCTTCTGGATCCTTCACCAGCACAGGATTGGTAGTCTCTTCAAAATTACCCCGATTCTCTGATCTCTATACACTGAGCATTTCTA
GTGCAGATCCCAAATCAATCTCCGCTAACGAACCAGTGCAATTTACCAAGAGTGTCACTCGGTGGTTCACCAAGGATGGAGTTTTAGTTGAGGGGCTCTTCTGGAAAGAT
GTCGAAGCACTGATCGATGATTATGCAAGAGAACCGAAGAAGAGCAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACATGTTTGAATGCAAATATTTTTCTGGTGCTCTCGTGATCTTTAACTCTGGCAAGTATGTAGTCTTTAATGGGATCTTGCAGTTTATTGTCTACACCAAGGAGAA
GAACGCAATTTTGTTCACCTATCCTCCTTCTGGATCCTTCACCAGCACAGGATTGGTAGTCTCTTCAAAATTACCCCGATTCTCTGATCTCTATACACTGAGCATTTCTA
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GTCGAAGCACTGATCGATGATTATGCAAGAGAACCGAAGAAGAGCAAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYMFECKYFSGALVIFNSGKYVVFNGILQFIVYTKEKNAILFTYPPSGSFTSTGLVVSSKLPRFSDLYTLSISSADPKSISANEPVQFTKSVTRWFTKDGVLVEGLFWKD
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