; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lag0041599 (gene) of Sponge gourd (AG-4) v1 genome

Gene IDLag0041599
OrganismLuffa acutangula AG-4 (Sponge gourd (AG-4) v1)
DescriptionUbiquitin carboxyl-terminal hydrolase
Genome locationchr13:21515118..21518305
RNA-Seq ExpressionLag0041599
SyntenyLag0041599
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
EPR63240.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Toxoplasma gondii GT1]3.7e-0450.55Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS
        L PSS   S +S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PS SS     +  F+ S
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS

KAF4638977.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Toxoplasma gondii]3.7e-0450.55Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS
        L PSS   S +S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PS SS     +  F+ S
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS

XP_018635152.1 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Toxoplasma gondii ME49]4.3e-0551.65Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS
        L PSS   S +S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS     +  F+ S
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS

XP_031027822.1 uncharacterized protein SmJEL517_g00105 [Synchytrium microbalum]8.2e-0448.42Show/hide
Query:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVL---LPTPI
        P +S  PS      +AS APSP +  L S APSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L S APSP +  L    P+P+
Subjt:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVL---LPTPI

XP_043123828.1 uncharacterized protein Aspvir_004669 [Aspergillus viridinutans]3.7e-0433.96Show/hide
Query:  SSKVPSR---ASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLP------TPIFEGSPLR
        SS +PS     S  PSPSS A+ S+ P PSS  ++S  PSPSS A+ S++P PSS  ++S  PSPSS A+ S+ P+PSS  ++P      +P+   +P+ 
Subjt:  SSKVPSR---ASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLP------TPIFEGSPLR

Query:  FSFSKFEGSPLL--------IFKCLAAVDVLVPLHLQMLVVDGVCCASSSNVGSGEVTT
         S      +P++             + V    P+ L   V+ G   +SS+   S  V +
Subjt:  FSFSKFEGSPLL--------IFKCLAAVDVLVPLHLQMLVVDGVCCASSSNVGSGEVTT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A425HVQ0 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.8e-0450.55Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS
        L PSS   S +S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PS SS     +  F+ S
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS

A0A507CAM6 Uncharacterized protein4.0e-0448.42Show/hide
Query:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVL---LPTPI
        P +S  PS      +AS APSP +  L S APSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L SAAPSP +  L S APSP +  L    P+P+
Subjt:  PPSSKVPS------RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVL---LPTPI

A0A7J6JVT9 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.8e-0450.55Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS
        L PSS   S +S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PS SS     +  F+ S
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS

S7UZX5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase1.8e-0450.55Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS
        L PSS   S +S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PS SS     +  F+ S
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS

S8G1F0 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase2.1e-0551.65Show/hide
Query:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS
        L PSS   S +S +PS SS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS A  S++PSPSS     +  F+ S
Subjt:  LPPSSKVPSRASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTCTTACGATGTACGCTACTTGTGTTGTTCCTTCCTCAAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCTCACGT
CACTTTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAATTCCTTCATCCAGGTTCGAGGGTTCTCACGTCGATTCGATGCAGTTCCTTCCT
CCCAAATTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTTCGCTACAGTTTCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCCCTCA
CGCGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCT
TCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTC
TCCCCACCCCTATTTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCATTTTCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACGTCCTCGTTCCG
CTTCATCTTCAAATGTTGGTAGTTGACGGCGTCTGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTGGTGAAGTCACTACAATTGAATCTGATGACGACCGTTGTAAGCGAGT
CGGGTCTGGTGACCACCCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGTTACTCAGATCACCCAATA
AAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGAAATCACTGCAAGCGAAT
TTGAAGACTCTAAAAAGAGATCAACAAGCCAACCGACCGATCAAGAAGATCAACAAGCCGGCAGGCCAATCATCCAAGAGGATCAACAAGCTAACAAGTCGATCCAACAA
ATCAACAAGCCAACAGGTCGATCCAATAAATCAACAAGTCAACAGACCGATAATCCAGGAAGATCAACAAGCCAACAAGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGGCC
GATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCCAATAGGCCGATCCAAGAGATCATCAACCTAACAGACCGATCATCCAGGAAGATCAACAAGCCAACAAGCCAATCCAAGAGATCA
TCACGCCAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTTCTTACGATGTACGCTACTTGTGTTGTTCCTTCCTCAAAGTTCGAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCTCTCACGT
CACTTTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCACGTCGCTTCGCTGCAATTCCTTCATCCAGGTTCGAGGGTTCTCACGTCGATTCGATGCAGTTCCTTCCT
CCCAAATTCGAAGGTTCTCTCACGCGCTTCGCTACAGTTTCTTCCTCCAAGTTCAAAGGTTCTCTCACGCGCTGCTGCAGTTCCTTCCTCCAAGTTCGAAGGTTCCCTCA
CGCGCTTCGCTCGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCT
TCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCGCTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGCGCTTCTCTCCACTGCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTGCTTC
TCCCCACCCCTATTTTTGAAGGTTCGCCACTGAGGTTCTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTCACCGTTGCTCATTTTCAAATGTTTGGCGGCGGTTGACGTCCTCGTTCCG
CTTCATCTTCAAATGTTGGTAGTTGACGGCGTCTGCTGCGCTTCATCTTCAAATGTTGGCAGTGGTGAAGTCACTACAATTGAATCTGATGACGACCGTTGTAAGCGAGT
CGGGTCTGGTGACCACCCCTGCAGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGTTACTCAGATCACCCAATA
AAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGCATCACTGTAGGCAAATCTGGTTACTCAGATCACCCAATAAAATGGGGACTGGTCTAGCAGGAGTGAAATCACTGCAAGCGAAT
TTGAAGACTCTAAAAAGAGATCAACAAGCCAACCGACCGATCAAGAAGATCAACAAGCCGGCAGGCCAATCATCCAAGAGGATCAACAAGCTAACAAGTCGATCCAACAA
ATCAACAAGCCAACAGGTCGATCCAATAAATCAACAAGTCAACAGACCGATAATCCAGGAAGATCAACAAGCCAACAAGCCGATCCAAGAGATCATCACGCCAACAGGCC
GATCATCCAAGAAGATCAACAAGCCCAATAGGCCGATCCAAGAGATCATCAACCTAACAGACCGATCATCCAGGAAGATCAACAAGCCAACAAGCCAATCCAAGAGATCA
TCACGCCAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVLTMYATCVVPSSKFEGSHVASLQFLPPSSKVLSHVTLLQFLPPSSKVLTSLRCNSFIQVRGFSRRFDAVPSSQIRRFSHALRYSFFLQVQRFSHALLQFLPPSSKVPS
RASLAPSPSSKALLSTAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSAAPSPSSKALLSTAPSPSSKVLLPTPIFEGSPLRFSFSKFEGSPLLIFKCLAAVDVLVP
LHLQMLVVDGVCCASSSNVGSGEVTTIESDDDRCKRVGSGDHPCRLLRSPNKMGTGLAGVHHCRQIWLLRSPNKMGTGLAGVHHCRQIWLLRSPNKMGTGLAGVKSLQAN
LKTLKRDQQANRPIKKINKPAGQSSKRINKLTSRSNKSTSQQVDPINQQVNRPIIQEDQQANKPIQEIITPTGRSSKKINKPNRPIQEIINLTDRSSRKINKPTSQSKRS
SRQ