; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy03g010980 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy03g010980
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionRNase H domain-containing protein
Genome locationChr03:44948608..44949417
RNA-Seq ExpressionLcy03g010980
SyntenyLcy03g010980
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0004523 - RNA-DNA hybrid ribonuclease activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002156 - Ribonuclease H domain
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR036397 - Ribonuclease H superfamily
IPR044730 - Ribonuclease H-like domain, plant type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599977.1 hypothetical protein SDJN03_05210, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-1242.11Show/hide
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        K+N  ASW E +GKGG+ W+I DS+GS I   CK +  +W +K+LE KA+ EGLKTY+       +  RP +      LE+ + +N    DL EL  VV+
Subjt:  KINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVE

Query:  EIEEMIPPARVISF
        EI ++   A +ISF
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XP_022143535.1 uncharacterized protein LOC111013412 [Momordica charantia]6.0e-1829.86Show/hide
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        E  ++++II W +W  RNK       P+ ++I+ +I    I+    ++    KST             +   W  P +N WK+N +A+W   +  GG+ W
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Query:  LIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSR
        ++RD  G +I   C+ I    +I  LE  AI EGL+       +     RP + +ESDSLE I  ++++  D +E++ ++EEI +M+    ++S    SR
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Query:  SSNEFAHKLVR
         +N+ AH L R
Subjt:  SSNEFAHKLVR

XP_022148549.1 uncharacterized protein LOC111017181 [Momordica charantia]1.5e-1328.24Show/hide
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        +  ++++WS+W  RN+  H+  + P  + IR   ++ I        E+  +  G+ +   +N      W  PA + WK+NVDA+W +    GG+ W++RD
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Query:  SIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNE
        S G  I   C              KA+S+ L          + GI+  +E+ESD LEV+  INK S  L+E+ L+VE+I + +    +  F      +N 
Subjt:  SIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNE

Query:  FAHKLVRAGVIHGEFI
         AH + R   +  E +
Subjt:  FAHKLVRAGVIHGEFI

XP_022155262.1 uncharacterized protein LOC111022403 [Momordica charantia]4.3e-1629.05Show/hide
Query:  WSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGSLIGG
        W +WN RN      +   F  + + +   + E    S+  L          + N+L    W  P  + W +N DASW + + +GG+ W+IR   G ++  
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Query:  GCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAHKLV-R
        G + +    ++K+LEA AI EGL+       + + G+   L +E+DS EV   +N++  DL++   VVEEI  +     +++F K  R +N  AH L  R
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Query:  AGVIHGEFIY
        A V+    I+
Subjt:  AGVIHGEFIY

XP_022156777.1 uncharacterized protein LOC111023608 [Momordica charantia]3.5e-1829.44Show/hide
Query:  EYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQL---SHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGME
        E  ++++II W +W  RNK        + ++I+  I   I          LK    +    +  ++   +   W  P +N WK+N DA+W   +  GG+ 
Subjt:  EYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQL---SHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGME

Query:  WLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQ--AMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVK
        W++RD  G +I   C+ I    +I  LE  AI EGL+   Q     ++    RP + +ESDSLE I  ++++  D +E++ ++EEI +M+   +++S   
Subjt:  WLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQ--AMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVK

Query:  CSRSSNEFAHKLVR
         SR +N+ AH L R
Subjt:  CSRSSNEFAHKLVR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CP26 uncharacterized protein LOC1110134122.9e-1829.86Show/hide
Query:  EYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQN-CIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAME-NQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEW
        E  ++++II W +W  RNK       P+ ++I+ +I    I+    ++    KST             +   W  P +N WK+N +A+W   +  GG+ W
Subjt:  EYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQN-CIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAME-NQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEW

Query:  LIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSR
        ++RD  G +I   C+ I    +I  LE  AI EGL+       +     RP + +ESDSLE I  ++++  D +E++ ++EEI +M+    ++S    SR
Subjt:  LIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSR

Query:  SSNEFAHKLVR
         +N+ AH L R
Subjt:  SSNEFAHKLVR

A0A6J1CQG0 uncharacterized protein LOC1110132161.8e-1229.47Show/hide
Query:  DLWKGTYRCLKGEYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDE-----SSKEYLKSTEGSSSAAMEN-QLSHPYWIAPAANRWKIN
        D W      L  E    +++I W +W +RN+     +T D + + RSI   I+   +     S     +  +G      EN  +    W AP  N WK+N
Subjt:  DLWKGTYRCLKGEYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDE-----SSKEYLKSTEGSSSAAMEN-QLSHPYWIAPAANRWKIN

Query:  VDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLS
         DASW E    GG+ W++ D  G ++  G  +I  +  I  LE       L T I+ +   +   R  + +ESDS+EVI+ + KE  DL+
Subjt:  VDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLS

A0A6J1D4B6 uncharacterized protein LOC1110171817.5e-1428.24Show/hide
Query:  KKAVIIMWSLWNARNKCFHNN-QTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRD
        +  ++++WS+W  RN+  H+  + P  + IR   ++ I        E+  +  G+ +   +N      W  PA + WK+NVDA+W +    GG+ W++RD
Subjt:  KKAVIIMWSLWNARNKCFHNN-QTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRD

Query:  SIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNE
        S G  I   C              KA+S+ L          + GI+  +E+ESD LEV+  INK S  L+E+ L+VE+I + +    +  F      +N 
Subjt:  SIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNE

Query:  FAHKLVRAGVIHGEFI
         AH + R   +  E +
Subjt:  FAHKLVRAGVIHGEFI

A0A6J1DNV9 uncharacterized protein LOC1110224032.1e-1629.05Show/hide
Query:  WSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGSLIGG
        W +WN RN      +   F  + + +   + E    S+  L          + N+L    W  P  + W +N DASW + + +GG+ W+IR   G ++  
Subjt:  WSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGSLIGG

Query:  GCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAHKLV-R
        G + +    ++K+LEA AI EGL+       + + G+   L +E+DS EV   +N++  DL++   VVEEI  +     +++F K  R +N  AH L  R
Subjt:  GCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAHKLV-R

Query:  AGVIHGEFIY
        A V+    I+
Subjt:  AGVIHGEFIY

A0A6J1DSV1 uncharacterized protein LOC1110236081.7e-1829.44Show/hide
Query:  EYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQL---SHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGME
        E  ++++II W +W  RNK        + ++I+  I   I          LK    +    +  ++   +   W  P +N WK+N DA+W   +  GG+ 
Subjt:  EYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQL---SHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGME

Query:  WLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQ--AMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVK
        W++RD  G +I   C+ I    +I  LE  AI EGL+   Q     ++    RP + +ESDSLE I  ++++  D +E++ ++EEI +M+   +++S   
Subjt:  WLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQ--AMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVK

Query:  CSRSSNEFAHKLVR
         SR +N+ AH L R
Subjt:  CSRSSNEFAHKLVR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34320.1 Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein5.1e-0721.71Show/hide
Query:  LKGEYPKKAVI------IMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERS
        L+ E PK   I      ++W LW +RN+     +  D   + R      D E+ S++  L   EG +S     +     W AP     K N DA+W   +
Subjt:  LKGEYPKKAVI------IMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERS

Query:  GKGGMEWLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVI
         + G+ W++R+  G ++  G +  A   +  +LEA+   E L+  +  M   ++     +  ESD+  ++  +N +      L   +E+I++++     +
Subjt:  GKGGMEWLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVI

Query:  SFVKCSRSSNEFAHKLVRAGVIHGEFIYFFGHFSNSFFREVQGARDESIPNWFKDCLV
         F    R  N+ A ++ R  +        F ++    F          +P W +  L+
Subjt:  SFVKCSRSSNEFAHKLVRAGVIHGEFIYFFGHFSNSFFREVQGARDESIPNWFKDCLV

AT4G29090.1 Ribonuclease H-like superfamily protein4.1e-0421.18Show/hide
Query:  IMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSS--SAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGS
        ++W LW  RN+         F+    + Q  +   ++  +E+   TE  S  +    N+ S   W  P     K N DA+W+  + + G+ W++R+  G 
Subjt:  IMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSS--SAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIGS

Query:  LIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAHK
        +   G + +    S  +LEA+   E ++  + ++    +     +  ESDS  +I+ +N +      L   +++++ ++     + FV   R  N  A +
Subjt:  LIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAHK

Query:  LVR
        + R
Subjt:  LVR

AT5G65005.1 Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein1.9e-0625.12Show/hide
Query:  IMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKST---EGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIG
        +MW +W + N          F + R   Q  ++     +KE+L +T   E  +     +   +  W  P  ++ K N DAS  ER+   G+ W++R+S G
Subjt:  IMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKST---EGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGMEWLIRDSIG

Query:  SLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAH
        ++I  G  +   R + +  E       L   IQA     FG   ++  E D+  + + IN +SS+   L   ++ I+  IP    I F    R  N  A 
Subjt:  SLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAH

Query:  KLVRAGV
         L +  +
Subjt:  KLVRAGV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCTTTGGAAAGGGACGTATAGGTGCCTAAAAGGAGAGTATCCAAAGAAAGCAGTGATAATAATGTGGAGCTTATGGAACGCGAGGAACAAATGCTTTCACAACAA
TCAGACTCCGGATTTTAAGAACATCAGAAGATCCATTCAAAACTGCATTGATGAAGAAGATGAGAGTTCGAAAGAGTACTTGAAGTCGACTGAAGGCTCGTCCTCCGCAG
CGATGGAGAACCAACTGAGTCACCCCTACTGGATAGCGCCGGCAGCGAATCGCTGGAAAATCAACGTTGATGCCTCCTGGGATGAAAGATCGGGGAAGGGAGGGATGGAG
TGGTTAATCCGTGACTCAATTGGGTCTCTAATCGGAGGGGGCTGTAAACGGATTGCATGGAGATGGTCAATCAAAATATTAGAAGCAAAAGCAATTTCAGAGGGGTTGAA
GACTTACATTCAAGCGATGGTTGTGGAGGACTTCGGGATCAGGCCGGAGCTTGAAGTGGAGTCTGATTCTCTCGAAGTGATTCAAGCCATTAACAAGGAGTCTTCGGACC
TTTCGGAATTGTTGCTGGTGGTAGAAGAAATCGAAGAGATGATTCCTCCCGCTAGAGTCATCTCGTTCGTGAAATGCTCAAGGTCGAGCAACGAATTTGCACACAAGCTT
GTGCGCGCTGGAGTCATTCATGGAGAGTTCATATATTTTTTTGGACACTTTTCCAATTCGTTTTTTAGGGAAGTTCAGGGTGCCAGGGATGAGAGTATCCCTAATTGGTT
TAAAGACTGTTTAGTTGGTGTACCTACTCGTTTTTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATCTTTGGAAAGGGACGTATAGGTGCCTAAAAGGAGAGTATCCAAAGAAAGCAGTGATAATAATGTGGAGCTTATGGAACGCGAGGAACAAATGCTTTCACAACAA
TCAGACTCCGGATTTTAAGAACATCAGAAGATCCATTCAAAACTGCATTGATGAAGAAGATGAGAGTTCGAAAGAGTACTTGAAGTCGACTGAAGGCTCGTCCTCCGCAG
CGATGGAGAACCAACTGAGTCACCCCTACTGGATAGCGCCGGCAGCGAATCGCTGGAAAATCAACGTTGATGCCTCCTGGGATGAAAGATCGGGGAAGGGAGGGATGGAG
TGGTTAATCCGTGACTCAATTGGGTCTCTAATCGGAGGGGGCTGTAAACGGATTGCATGGAGATGGTCAATCAAAATATTAGAAGCAAAAGCAATTTCAGAGGGGTTGAA
GACTTACATTCAAGCGATGGTTGTGGAGGACTTCGGGATCAGGCCGGAGCTTGAAGTGGAGTCTGATTCTCTCGAAGTGATTCAAGCCATTAACAAGGAGTCTTCGGACC
TTTCGGAATTGTTGCTGGTGGTAGAAGAAATCGAAGAGATGATTCCTCCCGCTAGAGTCATCTCGTTCGTGAAATGCTCAAGGTCGAGCAACGAATTTGCACACAAGCTT
GTGCGCGCTGGAGTCATTCATGGAGAGTTCATATATTTTTTTGGACACTTTTCCAATTCGTTTTTTAGGGAAGTTCAGGGTGCCAGGGATGAGAGTATCCCTAATTGGTT
TAAAGACTGTTTAGTTGGTGTACCTACTCGTTTTTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLWKGTYRCLKGEYPKKAVIIMWSLWNARNKCFHNNQTPDFKNIRRSIQNCIDEEDESSKEYLKSTEGSSSAAMENQLSHPYWIAPAANRWKINVDASWDERSGKGGME
WLIRDSIGSLIGGGCKRIAWRWSIKILEAKAISEGLKTYIQAMVVEDFGIRPELEVESDSLEVIQAINKESSDLSELLLVVEEIEEMIPPARVISFVKCSRSSNEFAHKL
VRAGVIHGEFIYFFGHFSNSFFREVQGARDESIPNWFKDCLVGVPTRFY