| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6592918.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 5.2e-43 | 75.41 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
D YVCNSLMDMYAEL K+GNAKKLFDEMP RD VSWNV+I+GYVRCRRFEDA+N FKEMQQESNEKP EA VVSTLSA +H+YVRK+LG
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
FTTIINNALLDM KC CL+IA
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| XP_023004947.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 [Cucurbita maxima] | 2.3e-43 | 76.23 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
D YVCNSLMDMYAEL K+GNAKKLFDEMP RD VSWNV+I+GYVRCRRFEDA+N FKEMQQESNEKP EA VVSTLSA +H+YVRKELG
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
FTTIINNALLDM KC CL+IA
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| XP_023513900.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.3e-43 | 76.23 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
D YVCNSLMDMYAEL K+GNAKKLFDEMP RD VSWNV+I+GYVRCRRFEDA+N FKEMQQESNEKP EA VVSTLSA +H+YVRKELG
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
FTTIINNALLDM KC CL+IA
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| XP_023513901.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.3e-43 | 76.23 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
D YVCNSLMDMYAEL K+GNAKKLFDEMP RD VSWNV+I+GYVRCRRFEDA+N FKEMQQESNEKP EA VVSTLSA +H+YVRKELG
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
FTTIINNALLDM KC CL+IA
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| XP_038880251.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 [Benincasa hispida] | 1.8e-43 | 73.6 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
MD+D+YVCNSLMDMY++L + NAKKLFD+M TRD VSWNVMI+GYVRCRRFEDA+ TF+EMQQESNEKP+EA VVSTLSA +HDYVRK
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
Query: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
ELGFTTIINNALLDM KC CLNIA
Subjt: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LWP8 Uncharacterized protein | 8.9e-41 | 72 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
MD D+YV NSL+DMY ELS + NAKKLFDEM TRD VSWNVMI+GYVRCRRFEDA+NTF+EMQQE NEKP EA VVSTLSA +H+YVRK
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
Query: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
ELGFTT I+NALLDM KC CLNIA
Subjt: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| A0A1S3CPD2 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 | 5.8e-40 | 69.6 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
M+ D+YVCNSLMDMY+EL + NAKKLFDEM TRD VSWNVMI+GYV CRRFEDA+NTF+EMQQE NEKP EA VVSTLSA +H+YVRK
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
Query: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
ELGFT I+NALLDM KC CLNI+
Subjt: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| A0A6J1CTE5 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 | 1.5e-40 | 71.2 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
MD+D+YVCNSLMDMYAEL KI A+KLFDEM T+D VSWNV+I+GYVRCRRFEDA+NTFKEMQ+ESN KP EA +VSTLSA +H+YVR
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
Query: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
ELGFTTIINNALLDM KC LNIA
Subjt: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| A0A6J1H7E9 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 | 2.5e-43 | 75.41 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
D YVCNSLMDMYAEL K+GNAKKLFDEMP RD VSWNV+I+GYVRCRRFEDA+N FKEMQQESNEKP EA VVSTLSA +H+YVRK+LG
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
FTTIINNALLDM KC CL+IA
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| A0A6J1KW17 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 | 1.1e-43 | 76.23 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
D YVCNSLMDMYAEL K+GNAKKLFDEMP RD VSWNV+I+GYVRCRRFEDA+N FKEMQQESNEKP EA VVSTLSA +H+YVRKELG
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRKELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
FTTIINNALLDM KC CL+IA
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O64705 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g34400 | 5.2e-14 | 35.71 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVR
++ D ++ +SL+ MYA+ ++G A+KLFDE+ RD VSWN MI+GY +DA++ F++M++E E P E +VS L A H +
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVR
Query: KELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
K++G +T + + L+ M KC L+ A
Subjt: KELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| Q683I9 Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g62890 | 5.2e-14 | 36.07 | Show/hide |
Query: NSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQ----QESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDYVRK-ELG
NS+++ YA+ I +A+KLFDEMP R+ +SW+ +I GYV C ++++AL+ F+EMQ E+ +P+E + + LSA ++H Y+ K +
Subjt: NSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQ----QESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDYVRK-ELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
++ AL+DM KC L A
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| Q9C866 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g31430 | 2.8e-23 | 48.8 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
+++D YV NSLM MYA L KI K+FDEMP RD VSWN +I+ YV RFEDA+ FK M QESN K E +VSTLSA ++ +V
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
Query: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
E + I NAL+DM KC CL+ A
Subjt: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| Q9SJG6 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g42920, chloroplastic | 5.6e-16 | 41.32 | Show/hide |
Query: YDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDY-VRKE
+D NS++ +A+ I A+ LFDEMP R+ VSWN MI+G+VR RF+DAL+ F+EM QE + KP +VS L+A ++H+Y VR
Subjt: YDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDY-VRKE
Query: LGFTTIINNALLDMCTKCRCL
+I+ AL+DM KC C+
Subjt: LGFTTIINNALLDMCTKCRCL
|
|
| Q9SX45 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g50270 | 1.5e-13 | 34.96 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVRKEL
D ++ +SL+DMY + S +A+K+FDEMP+R+ V+W +IAGYV+ R F+ + F+EM +S+ P+E + S LSA H ++ +
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVRKEL
Query: GFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
T L+D+ KC CL A
Subjt: GFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G31430.1 Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein | 2.0e-24 | 48.8 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
+++D YV NSLM MYA L KI K+FDEMP RD VSWN +I+ YV RFEDA+ FK M QESN K E +VSTLSA ++ +V
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAF-----------LHDYVRK
Query: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
E + I NAL+DM KC CL+ A
Subjt: ELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| AT1G50270.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 1.1e-14 | 34.96 | Show/hide |
Query: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVRKEL
D ++ +SL+DMY + S +A+K+FDEMP+R+ V+W +IAGYV+ R F+ + F+EM +S+ P+E + S LSA H ++ +
Subjt: DDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVRKEL
Query: GFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
T L+D+ KC CL A
Subjt: GFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| AT2G34400.1 Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein | 3.7e-15 | 35.71 | Show/hide |
Query: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVR
++ D ++ +SL+ MYA+ ++G A+KLFDE+ RD VSWN MI+GY +DA++ F++M++E E P E +VS L A H +
Subjt: MDYDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSAFLH------------DYVR
Query: KELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
K++G +T + + L+ M KC L+ A
Subjt: KELGFTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
| AT2G42920.1 Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein | 4.0e-17 | 41.32 | Show/hide |
Query: YDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDY-VRKE
+D NS++ +A+ I A+ LFDEMP R+ VSWN MI+G+VR RF+DAL+ F+EM QE + KP +VS L+A ++H+Y VR
Subjt: YDDYVCNSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQQESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDY-VRKE
Query: LGFTTIINNALLDMCTKCRCL
+I+ AL+DM KC C+
Subjt: LGFTTIINNALLDMCTKCRCL
|
|
| AT3G62890.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 3.7e-15 | 36.07 | Show/hide |
Query: NSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQ----QESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDYVRK-ELG
NS+++ YA+ I +A+KLFDEMP R+ +SW+ +I GYV C ++++AL+ F+EMQ E+ +P+E + + LSA ++H Y+ K +
Subjt: NSLMDMYAELSKIGNAKKLFDEMPTRDYVSWNVMIAGYVRCRRFEDALNTFKEMQ----QESNEKPSEAAVVSTLSA-----------FLHDYVRK-ELG
Query: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
++ AL+DM KC L A
Subjt: FTTIINNALLDMCTKCRCLNIA
|
|
