; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy04g016730 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy04g016730
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionRas-related protein
Genome locationChr04:48979940..48982864
RNA-Seq ExpressionLcy04g016730
SyntenyLcy04g016730
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004143465.1 ras-related protein RABH1e [Cucumis sativus]8.3e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSSQ+EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022132839.1 ras-related protein RABH1e [Momordica charantia]7.0e-10798.07Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
         KWIEEVRTERGSDV+IVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSSQ EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022950086.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita moschata]2.8e-10899.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSSQTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_022962792.1 ras-related protein RABH1e-like [Cucurbita moschata]1.1e-10799.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

XP_023003400.1 ras-related protein RABH1e [Cucurbita maxima]2.4e-10798.55Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGR9 Uncharacterized protein4.0e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSSQ+EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A1S3B1I2 ras-related protein RABH1e4.0e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSSQ+EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1GDU2 ras-related protein RABH1e1.4e-10899.52Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSSQTEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1HDJ2 ras-related protein RABH1e-like5.2e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

A0A6J1IN20 ras-related protein RABH1e-like5.2e-10899.03Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKP+VNSS TEQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGGGCAC
Subjt:  QGGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b3.1e-9787.5Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPS-VNSSQTE
        TKWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK S  N+S  +
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPS-VNSSQTE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A1.8e-8173.4Show/hide
Query:  SPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWI
        +PL K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAVVVYD++N  SF  TTKWI
Subjt:  SPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWI

Query:  EEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQQGGG
        ++VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVSIEEG+ K++E  VMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+       +E   GG
Subjt:  EEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQQGGG

Query:  CAC
        C+C
Subjt:  CAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e4.9e-10391.3Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK S NS+Q EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d7.8e-10189.37Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP+ NSSQ +Q
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c2.1e-9081.31Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPSVNSSQT
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK + NSSQ 
Subjt:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPSVNSSQT

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D5.5e-10289.37Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDV+NR SFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        +KWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGD+K RE+GVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGME+ S+T+ EDMVDVNLKP+ NSSQ +Q
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        QGG C+C
Subjt:  QGGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein2.2e-9887.5Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA VS LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV++RQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPS-VNSSQTE
        TKWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE +AK+RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK S  N+S  +
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPS-VNSSQTE

Query:  QQGGGCAC
        QQ GGC+C
Subjt:  QQGGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C1.5e-9181.31Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQ TIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA+VVYDVSNRQ+FLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPSVNSSQT
        +KWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EG+ K +E+GVMFIETSAK  FNIK LFRKIAAALPG+++ S +T+ +DMVDVNLK + NSSQ 
Subjt:  TKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLS-STRQEDMVDVNLKPSVNSSQT

Query:  EQQ-----GGGCAC
        EQQ     GGGC+C
Subjt:  EQQ-----GGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E3.5e-10491.3Show/hide
Query:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT
        MA+VSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRT+RLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDV+NRQSFLNT
Subjt:  MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNT

Query:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ
        +KWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEGD K+R++GV+FIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSST+QEDMVDVNLK S NS+Q EQ
Subjt:  TKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQ

Query:  QGGGCAC
        Q GGCAC
Subjt:  QGGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A1.1e-8177.39Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFDT+YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAV+VYDV+++QSF+NT+KWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQ-TEQQGGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEEG+ K+REFG +F+ETSAKAGFNIKPLF KI +AL G E +S T+QED+VDVNLKP + SSQ   QQ   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQ-TEQQGGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCCGTTGGCAAAACCAGCATTATTACCCGCTTCATGTACGACAAGTTTGAT
ACCACCTATCAGGCTACAATTGGAATTGACTTTTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATCGAACAATTCGGTTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGA
TTTAGGAGTCTCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCCTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATGTATCTAATAGACAATCATTCTTGAACACTACCAAGTGGATTGAG
GAGGTACGAACAGAAAGGGGTAGTGATGTGATAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATCTTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAGGAAGGTGATGCCAAA
TCTCGTGAGTTTGGAGTCATGTTTATAGAAACTAGTGCCAAAGCTGGATTCAACATCAAGCCTCTCTTTCGTAAGATTGCTGCAGCACTGCCTGGGATGGAAACT
CTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACATGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTTCAGTGAATTCATCCCAGACGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGGCAAAGAATGGGCAAGAAAGCGAGGCCAAAAGTAAAGGATGAGGCCTAAGTTTGGCGCGTCCACGCAGTGCAAGGAGTTGGGGGGATAAAAACGTGCGGCACC
CGGAGAGAAACGAACTTTTAAAAACCTCTAAGCGATACTCGATCCTGATTTTTCTTTCCTCCAGAATTTTCTTTTCCCGGCTTTAGATCTATCCTATCTTCTTCC
GCCACCTTCCTTTGATTTTTCTTCGCTATTGCCATATTGCCTCCATGGCGACGGTTTCTCCTCTCGCCAAGTACAAGCTCGTCTTCCTCGGCGATCAATCCGTTG
GCAAAACCAGCATTATTACCCGCTTCATGTACGACAAGTTTGATACCACCTATCAGGCTACAATTGGAATTGACTTTTTGTCCAAAACAATGTACCTTGAAGATC
GAACAATTCGGTTGCAGCTTTGGGATACTGCTGGACAAGAAAGATTTAGGAGTCTCATTCCAAGTTACATAAGAGATTCCTCTGTCGCAGTAGTAGTCTATGATG
TATCTAATAGACAATCATTCTTGAACACTACCAAGTGGATTGAGGAGGTACGAACAGAAAGGGGTAGTGATGTGATAATTGTTCTTGTTGGGAACAAAACTGATC
TTGTTGAGAAAAGGCAAGTTTCAATCGAGGAAGGTGATGCCAAATCTCGTGAGTTTGGAGTCATGTTTATAGAAACTAGTGCCAAAGCTGGATTCAACATCAAGC
CTCTCTTTCGTAAGATTGCTGCAGCACTGCCTGGGATGGAAACTCTGTCTTCTACAAGGCAGGAGGACATGGTTGACGTAAATTTGAAGCCTTCAGTGAATTCAT
CCCAGACGGAACAGCAAGGAGGAGGTTGTGCATGCTAGAGGATATGTAAGTTCAATACATTAAAAAATGCTGCAGAATTGAAATAGTAAACGAAATCATTCACGG
CGAGTTAGTCCAACAAATTGACGAGATGTTTTGTAATATTGTATGCCATTAGATTCTTTTTGGGTTCCCAAAGAACAAATCATCATTTTGTCCTCTCATATGTTG
AGATTTTCATTTTGGGTTTGTGATGGCTTTCTACAAGTTGACCAACTATATCTAATTGCAGAGCACTTGAAACTGTTCCATTGTTTATAATTATATCAAAATATT
TAGTGTTCTTTCATAGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDTTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTIRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVVVYDVSNRQSFLNTTKWIE
EVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGDAKSREFGVMFIETSAKAGFNIKPLFRKIAAALPGMETLSSTRQEDMVDVNLKPSVNSSQTEQQGGGCAC