; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy04g018430 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy04g018430
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationChr04:50304779..50308283
RNA-Seq ExpressionLcy04g018430
SyntenyLcy04g018430
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6594558.1 GDSL esterase/lipase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-2954.68Show/hide
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        VCF PY ETFFHRPT +FSDGRVI DF                              A  L LPL++PYRS   GGEGISAE+FG GLNF VGGATAL++
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        S+F ER +HN+PS A+SL  QL WFK+ YSS CASS  S
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KAG6594559.1 GDSL esterase/lipase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-3056.12Show/hide
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        VCF PY ETFFHRPT +FSDGRVI DF                              A  L LPL++PYRS   GGEGISAE+FG GLNF VGGATALDV
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        S+F ER IHN+PS A+SL  QLQWF + YSS C+SS  S
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KAG7026531.1 GDSL esterase/lipase [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.8e-3056.12Show/hide
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        VCF PY ETFFHRPT +FSDGRVI DF                              A  L LPL++PYRS   GGEGISAE+FG GLNF VGGATALDV
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        S+F ER IHN+PS A+SL  QLQWF + YSS C+SS  S
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XP_023004101.1 GDSL esterase/lipase At1g28570-like [Cucurbita maxima]1.6e-2853.24Show/hide
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        VCF PY ETFFHRPT +FSDGRV+ DF                              A  L LPL++PYR    GGEGISAE+FG GLNF VGGATALD+
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        SFF ER +HN+PS A+SL  QL W  + YSS CASS  S
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XP_023518482.1 GDSL esterase/lipase At1g28570-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.7e-3156.83Show/hide
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        VCF PY ETFFHRPT +FSDGRVI DF                              A  L LPL++PYRS   GGEGISA+DFG GLNF VGGATALDV
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        S+F ER IHN+PS A+SLR QL WF + YSS CASS  S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AZJ0 GDSL esterase/lipase At1g28570-like6.4e-2348.87Show/hide
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        VCFFPY ETFFHRPT +FSDGR++ DF                              A+ L LP ++PY+   +GI+AEDF  GLNF VGGATALD+SFF
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         +R I NLP T  SL  Q   F Q+YSS C SS
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A0A5D3CNP6 GDSL esterase/lipase6.4e-2348.87Show/hide
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        VCFFPY ETFFHRPT +FSDGR++ DF                              A+ L LP ++PY+   +GI+AEDF  GLNF VGGATALD+SFF
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         +R I NLP T  SL  Q   F Q+YSS C SS
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A0A6J1EFN7 GDSL esterase/lipase At1g28570-like3.0e-2853.24Show/hide
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        VCF PY ETFFHRPT +FSDGRVI DF                              A  L LPL++PYRS   G EGISAE+F  GLNF VGGATAL++
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        S+F ER +HN+PS A+SL  QL WFK+ YSS CASS  S
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A0A6J1EJ98 GDSL esterase/lipase At1g28590-like3.1e-1745.26Show/hide
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        CF PY + FFH PT +FS+GR+I DF                              A  L LPLL PY S G   IS +DF  GLNF V GATALD S  
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        RE+ I NLP T  SL  Q++WFK  YSS C SS+ +T
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A0A6J1KR60 GDSL esterase/lipase At1g28570-like7.8e-2953.24Show/hide
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        VCF PY ETFFHRPT +FSDGRV+ DF                              A  L LPL++PYR    GGEGISAE+FG GLNF VGGATALD+
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        SFF ER +HN+PS A+SL  QL W  + YSS CASS  S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3E7I6 GDSL esterase/lipase At1g286501.2e-1037.12Show/hide
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        F PY E+FFH P+ ++SDGR++ DF                              A  L LP + PY  G + +S   F  G+NF V GATALD +F  +
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        + I +   T ISL  QL  FKQ   + CASST
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Q8RXT9 GDSL esterase/lipase At1g285905.4e-1136.92Show/hide
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        F PY ETFFH PT ++SDGR+I DF       I  FL F L P  +                          G    +F  G+NF V GATAL+ SF  E
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        R IH+   T +SL  QL+ F ++  + C S
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Q9FPE4 GDSL esterase/lipase At1g286603.5e-1037.12Show/hide
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        FFPY E+FFH P+ + SDGR+I DF                              A  L LP + PY  G + +S   F  G+NF V GATALD ++F  
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        + I +   T +SL  QL  FKQ   + CASS+
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Q9FXJ1 GDSL esterase/lipase At1g285701.2e-1339.39Show/hide
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        V F PY ETFFH PT +FS+GR+I DF       I  FL F L P  +                          G    +F  G+NF VGGATAL+ SF 
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Query:  RERRIHNLPSTAISLRFQLQWFKQAYSSFCAS
         ER IH  P T +SL  QL  FK++  + C S
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Q9FXJ2 GDSL esterase/lipase At1g285809.9e-1337.88Show/hide
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        + F PY E FFH PT +FS+GR+I DF                              A  L LPL+ P+     G    +F  G+NF VGGATAL+ SF 
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         +R IH  P T +SL  QL  FK++  S C S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28570.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein8.3e-1539.39Show/hide
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        V F PY ETFFH PT +FS+GR+I DF       I  FL F L P  +                          G    +F  G+NF VGGATAL+ SF 
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         ER IH  P T +SL  QL  FK++  + C S
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AT1G28580.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein7.0e-1437.88Show/hide
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        + F PY E FFH PT +FS+GR+I DF                              A  L LPL+ P+     G    +F  G+NF VGGATAL+ SF 
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         +R IH  P T +SL  QL  FK++  S C S
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AT1G28590.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein3.8e-1236.92Show/hide
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        F PY ETFFH PT ++SDGR+I DF       I  FL F L P  +                          G    +F  G+NF V GATAL+ SF  E
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        R IH+   T +SL  QL+ F ++  + C S
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AT1G28650.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein8.6e-1237.12Show/hide
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        F PY E+FFH P+ ++SDGR++ DF                              A  L LP + PY  G + +S   F  G+NF V GATALD +F  +
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Query:  RRIHNLPSTAISLRFQLQWFKQAYSSFCASST
        + I +   T ISL  QL  FKQ   + CASST
Subjt:  RRIHNLPSTAISLRFQLQWFKQAYSSFCASST

AT1G28660.2 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein2.5e-1137.12Show/hide
Query:  FFPYDETFFHRPTDQFSDGRVIPDFFGLISSPIPRFLCFVLFPEIWVLSDFGVFAAILLRLPLLKPYRSGGEGISAEDFGNGLNFVVGGATALDVSFFRE
        FFPY E+FFH P+ + SDGR+I DF                              A  L LP + PY  G + +S   F  G+NF V GATALD ++F  
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Query:  RRIHNLPSTAISLRFQLQWFKQAYSSFCASST
        + I +   T +SL  QL  FKQ   + CASS+
Subjt:  RRIHNLPSTAISLRFQLQWFKQAYSSFCASST


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAAATAGCCCAGTTTGCTTCTTTCCTTACGACGAGACCTTCTTCCACCGTCCCACCGACCAATTCTCCGACGGTCGTGTCATCCCCGACTTCTTTGGTCTCATTTC
TTCACCAATTCCTCGATTCCTCTGTTTTGTTCTGTTTCCAGAGATCTGGGTTTTGTCTGACTTTGGTGTCTTTGCAGCCATATTGTTGCGGCTTCCATTGCTAAAGCCAT
ATCGGAGCGGCGGAGAAGGGATTAGCGCTGAGGATTTTGGGAATGGCTTGAATTTCGTCGTTGGGGGAGCAACTGCGCTCGATGTCTCGTTTTTCCGAGAAAGGAGAATC
CATAATTTACCGTCTACGGCCATTTCCCTGAGGTTTCAACTCCAATGGTTCAAGCAAGCGTACTCTTCCTTCTGCGCCTCTTCTACTTTAAGTACGCTCATTTCCACCGC
CAATGGACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAAATAGCCCAGTTTGCTTCTTTCCTTACGACGAGACCTTCTTCCACCGTCCCACCGACCAATTCTCCGACGGTCGTGTCATCCCCGACTTCTTTGGTCTCATTTC
TTCACCAATTCCTCGATTCCTCTGTTTTGTTCTGTTTCCAGAGATCTGGGTTTTGTCTGACTTTGGTGTCTTTGCAGCCATATTGTTGCGGCTTCCATTGCTAAAGCCAT
ATCGGAGCGGCGGAGAAGGGATTAGCGCTGAGGATTTTGGGAATGGCTTGAATTTCGTCGTTGGGGGAGCAACTGCGCTCGATGTCTCGTTTTTCCGAGAAAGGAGAATC
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CAATGGACCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQNSPVCFFPYDETFFHRPTDQFSDGRVIPDFFGLISSPIPRFLCFVLFPEIWVLSDFGVFAAILLRLPLLKPYRSGGEGISAEDFGNGLNFVVGGATALDVSFFRERRI
HNLPSTAISLRFQLQWFKQAYSSFCASSTLSTLISTANGP