; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy05g006500 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy05g006500
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
DescriptionProtein no-on-transient A-like
Genome locationChr05:6116690..6117765
RNA-Seq ExpressionLcy05g006500
SyntenyLcy05g006500
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046715.1 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-1652.14Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVL---IKKRLRPV-VTGTGGSGRTSAANRGRAAS
        MAAI+ LVS+A +ALL FS+SL T        S+SLTG+  RNIL T AHRI + + +SS+ RK N L    ++R+RP+ ++G+ G    SA NR R AS
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVL---IKKRLRPV-VTGTGGSGRTSAANRGRAAS

Query:  FGVGSVLCISIFLGLFM
        F VGS+LCI IFLGLF+
Subjt:  FGVGSVLCISIFLGLFM

KAA0068047.1 protein no-on-transient A-like [Cucumis melo var. makuwa]7.4e-1857.66Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSG-RTSAANRGRAA
        MAAIKSL+ ++ +ALL FS+SL+TSAAD    SNS+TGMLRRN+LQTA H IAD+ G      KMNV IK+    R+RPV  GTG +G R SAA+R + A
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSG-RTSAANRGRAA

Query:  SFGVGSVLCIS
        SFG+G +L  S
Subjt:  SFGVGSVLCIS

KAG6575859.1 hypothetical protein SDJN03_26498, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-2768.14Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKKRLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAASFGVG
        MAA+KSLVS+A +ALLLFS+SL  SA DR   SNSLTGMLRRN+LQTAAH+IADN+ +SS +RKMNV IK+R+RPV TGT    R+SAANR R AS GVG
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKKRLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAASFGVG

Query:  SVLCISIFLGLFM
        SVL   + LGLF+
Subjt:  SVLCISIFLGLFM

KAG6593163.1 hypothetical protein SDJN03_12639, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-1553.85Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAA--HRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK--RLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAAS
        MAAIK+L+S+A IALLLF +SL TSAA     S SL G+LRRNI+QT A  H++A        ++K NV IK+  R+RPV+    G  +TSAANR R A 
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAA--HRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK--RLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAAS

Query:  FGVGSVLCISIFLGLFM
         GVGS+LCI + LGLF+
Subjt:  FGVGSVLCISIFLGLFM

KGN44886.1 hypothetical protein Csa_015765 [Cucumis sativus]2.5e-1856.41Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAAS
        MAAIKSL+S++ +ALL FS+SL+TSAA+    SNS+T MLRRNILQTA H IAD+ G      KMNV IKK    R RP+  GTG   R+SAANR R  S
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAAS

Query:  FGVGSVLCISIFLGLFM
        FG+G +L    F GL +
Subjt:  FGVGSVLCISIFLGLFM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K929 Uncharacterized protein1.2e-1048.36Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGD-SSFD-RKMNVLIKKRLRP------VVTGTGGSGRTSAANR-
        MAAI+ L+S+AF+AL  FS+SL T        S+SLTG+  R IL TAAHRI D + + SS+  RK N L  K +R       +V+ + G+   SAANR 
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGD-SSFD-RKMNVLIKKRLRP------VVTGTGGSGRTSAANR-

Query:  GRAASFGVGSVLCISIFLGLFM
           AS  VGS+LCI IFLGLF+
Subjt:  GRAASFGVGSVLCISIFLGLFM

A0A0A0KAQ7 Uncharacterized protein1.2e-1856.41Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAAS
        MAAIKSL+S++ +ALL FS+SL+TSAA+    SNS+T MLRRNILQTA H IAD+ G      KMNV IKK    R RP+  GTG   R+SAANR R  S
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAAS

Query:  FGVGSVLCISIFLGLFM
        FG+G +L    F GL +
Subjt:  FGVGSVLCISIFLGLFM

A0A1S3BT53 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like9.4e-1144.07Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVL---IKKRLRPV-VTGTGGSGRTSAANRGRAAS
        MAAI+ LVS+A +ALL FS+SL T        S+SLTG+  RNIL T AHRI + + +SS+ RK N L    ++R+RP+ ++G+ G    SA NR R AS
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVL---IKKRLRPV-VTGTGGSGRTSAANRGRAAS

Query:  F---------GVGSVLCI
        F          +G V+C+
Subjt:  F---------GVGSVLCI

A0A5A7VLE5 Protein no-on-transient A-like3.6e-1857.66Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSG-RTSAANRGRAA
        MAAIKSL+ ++ +ALL FS+SL+TSAAD    SNS+TGMLRRN+LQTA H IAD+ G      KMNV IK+    R+RPV  GTG +G R SAA+R + A
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKK----RLRPVVTGTGGSG-RTSAANRGRAA

Query:  SFGVGSVLCIS
        SFG+G +L  S
Subjt:  SFGVGSVLCIS

A0A5D3D3Y6 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like5.2e-1752.14Show/hide
Query:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVL---IKKRLRPV-VTGTGGSGRTSAANRGRAAS
        MAAI+ LVS+A +ALL FS+SL T        S+SLTG+  RNIL T AHRI + + +SS+ RK N L    ++R+RP+ ++G+ G    SA NR R AS
Subjt:  MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVL---IKKRLRPV-VTGTGGSGRTSAANRGRAAS

Query:  FGVGSVLCISIFLGLFM
        F VGS+LCI IFLGLF+
Subjt:  FGVGSVLCISIFLGLFM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCGATCAAATCCCTAGTTTCCATGGCTTTCATCGCTCTTCTCTTGTTCTCCGATTCCCTGGCCACTTCCGCCGCCGATCGCGGCGAGCCTTCGAATTCTCTCAC
CGGAATGCTCCGCCGGAACATCCTTCAGACGGCGGCTCATCGGATTGCTGACAACAACGGCGATTCCTCTTTCGATCGGAAAATGAATGTTCTTATCAAAAAGCGGCTTC
GACCTGTAGTAACTGGCACCGGCGGCAGTGGCCGTACATCGGCGGCGAATCGGGGCCGAGCTGCGTCGTTTGGCGTTGGATCTGTGCTGTGTATCTCCATTTTTTTGGGA
TTGTTCATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACTTGTTTGAAAACACGTCAATAAATAAATAAATAATTAAAAGGAGTTTCAAAAAAATAAAAATAAAAAATTCAAAGGTCTGCTAGCCGTCGGCATCCCCGATCCC
TGGTCTTCAATTGCGGCCGAACCTGAATCTCATCTTCCTAAAGTATCTCTGATTATCAATAAATACAATCCATTACAAATTACATCTCCATCTCCATTCTTCCATCAATT
CTCTCTTCTCTATCATCAACTCTCAAATTAATGGCTGCGATCAAATCCCTAGTTTCCATGGCTTTCATCGCTCTTCTCTTGTTCTCCGATTCCCTGGCCACTTCCGCCGC
CGATCGCGGCGAGCCTTCGAATTCTCTCACCGGAATGCTCCGCCGGAACATCCTTCAGACGGCGGCTCATCGGATTGCTGACAACAACGGCGATTCCTCTTTCGATCGGA
AAATGAATGTTCTTATCAAAAAGCGGCTTCGACCTGTAGTAACTGGCACCGGCGGCAGTGGCCGTACATCGGCGGCGAATCGGGGCCGAGCTGCGTCGTTTGGCGTTGGA
TCTGTGCTGTGTATCTCCATTTTTTTGGGATTGTTCATGTGATTGATTCGTTTTTGTACAATTTGGGGTTCTCATTTATTTATTTTTAGTTCAATTTGTTCATTCATTTA
TTTATTTGATGAATTTTAGCCTCTCTTTTTTTCCCCTTTCATTTTTATGGCTTTGGCTGTATTGAGTCCTTAATCTTATGTTATTGGATTAAACTAGTTTTCATAATTTC
TATAGATTTAATTTTTTGTGTTTAAATATCTTAGTCCTTTATAAATATATTTAAAGTGTTATATTATAGAGTAATGGATGTTAAACTTTTCCAAATAAAAGAATTAGCAG
AAATTTGAATATAGTTTAATGAATAAGAGATTATATTAATTATCATCGAACATGTGATTTGCACTCTATCTCTATGATTGTTAGACTAAAAGGAAAGAAGAAGTATTTAG
TGGTGACTTTCTAAACGATATAGTAATCTAAAAAACAATACTTGGTTACATAGTGTGTGTAAGAATGTCTCTACACACCTCATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIKSLVSMAFIALLLFSDSLATSAADRGEPSNSLTGMLRRNILQTAAHRIADNNGDSSFDRKMNVLIKKRLRPVVTGTGGSGRTSAANRGRAASFGVGSVLCISIFLG
LFM