; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lcy05g008350 (gene) of Sponge gourd (P93075) v1 genome

Gene IDLcy05g008350
OrganismLuffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Descriptionextensin-like
Genome locationChr05:8426651..8427727
RNA-Seq ExpressionLcy05g008350
SyntenyLcy05g008350
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576117.1 hypothetical protein SDJN03_26756, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.0e-14780.17Show/hide
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KAG7014636.1 hypothetical protein SDJN02_24815 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.0e-14780.17Show/hide
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XP_022953380.1 formin-2-like [Cucurbita moschata]1.4e-14780.72Show/hide
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XP_022991372.1 extensin-like [Cucurbita maxima]8.8e-15081.49Show/hide
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XP_023515622.1 formin-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-14780.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein1.9e-14277.93Show/hide
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         PDP TSSKFFLPFFPPYS PFP PPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPP          P+FP PTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSP  PSAPPPPPPFS
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        LSDPRTWIPY+SPFSPPPPPPS PPPFSLSDPRTWIPH+PPF PPPPPA                                              FDPRD
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        PRTWIPNIPPFSPSPPP FDPRDPRTWIP IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQ  QNQKP
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A0A1S3CB81 extensin2.7e-14479.5Show/hide
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        NIPPFSPSPPP F+PRDPR+WIP IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQ  QNQKP
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A0A5D3DMB9 Extensin2.1e-14479.5Show/hide
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        NIPPFSPSPPP F+PRDPR+WIP IPPFFPPPPP+FDLRDPRTWIPH PPSPPQ  QNQKP
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A0A6J1GPH0 formin-2-like6.8e-14880.72Show/hide
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        Y+SPFSPPPP     PPS PPPFSLSDPRTWIP+V P                     PP  P PPP F   DPRTWIP++PPFSP PPP FDPRDPRTW
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        IP+IPPF+  PPP FDPRDPRTWIPHIPPFF PPPP FDLRDPRTWIPHFPPSPPQ  QNQKP
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A0A6J1JLM5 extensin-like4.3e-15081.49Show/hide
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         PDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFP PPLPPFPSFPLPPLPPLPP+   PY P P+CP PPSLPFPFPPLPP FPS  SPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIP
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Query:  YISPFSPPPP----PPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWI
        Y+SPFSPPPP     P PPPPFSLSDPRTWIPHVPPF PPPPPAFDPRDPRTWIPHIPP + PPPPA                       FDPRDPRTWI
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Query:  PNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
        P+IPPF+  PPP FDPRDPRTWIPHIPPFF PPPP FDLRDPRTWIPHFPPSPPQ  QNQKP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P13983 Extensin1.1e-0441.11Show/hide
Query:  AKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPL-PPFPSF-PLPPLPPLPPL--PPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP--SPPPPSAPPPPPPFSL
        A++P P   S  + P  P YS P P P   PP P++ P PP  P P    PP  Y P PT   PP    P P  P   P PP  SPPPP +  PPPP  L
Subjt:  AKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPL-PPFPSF-PLPPLPPLPPL--PPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPP--SPPPPSAPPPPPPFSL

Query:  SDPRTWIPYISPFSPPPP--PPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPF--D
          P    P    FSPPPP    SPPPP + S P   +P  P + PPPP    P       P +PP   PPPPA+ P  P T+ P  P +SP PPP +   
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Query:  PRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
        P  P T+ P  P +SP PP P     P    P  P F PPPP    L  P    PH  P PP  T  Q P
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Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 31.1e-0638.43Show/hide
Query:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP---PSP
        LS  P+   +  CG   +  P  +T         PP S P P PP P F + P    PP P  PP  Y P P  P PP +  P PP PP  P P   P P
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Query:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP
        PPP  PPPPP +S   P    P    +SPPPPPP PPPP   S P    P      PPPPP+  P       P  PP   PPPP F P  P  +  + PP
Subjt:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP

Query:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
           S PPP  P  P +  P I P+   PPPP     P    P  P +  PPPPP  +   P   I + PP PP       P
Subjt:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein8.0e-0838.43Show/hide
Query:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP---PSP
        LS  P+   +  CG   +  P  +T         PP S P P PP P F + P    PP P  PP  Y P P  P PP +  P PP PP  P P   P P
Subjt:  LSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP---PSP

Query:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP
        PPP  PPPPP +S   P    P    +SPPPPPP PPPP   S P    P      PPPPP+  P       P  PP   PPPP F P  P  +  + PP
Subjt:  PPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPP

Query:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP
           S PPP  P  P +  P I P+   PPPP     P    P  P +  PPPPP  +   P   I + PP PP       P
Subjt:  FSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFF-PPPPPTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein4.1e-0441.16Show/hide
Query:  PFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP------PSPPPPSAPPP---PPPFSLSDPRTWIPYIS
        P  P  S P P PP P  P  P+ P    PP+ P P F   T P+PPS   P PPLPP+ PSP      PS PPPS P P   PPP S   P    P  +
Subjt:  PFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSP------PSPPPPSAPPP---PPPFSLSDPRTWIPYIS

Query:  PFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVP-----PFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP-PLSPPPPPAF--DPRDPRTWIPNIPPF-SPSPPPPF---DPRD
         +SPP PPP PPP FS   P   IP  P     PFPPPPPP      P+T+ P  P P  PP  P +   P  P  ++P+ P F SP PP P+    P+ 
Subjt:  PFSPPPPPPSPPPPFSLSDPRTWIPHVP-----PFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIP-PLSPPPPPAF--DPRDPRTWIPNIPPF-SPSPPPPF---DPRD

Query:  PRTWIPNIPPFSP-----SPPPPFDP--RDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIP-HF--PPSPPQATQNQKP
        P     ++PP +P     SPPPP  P    P    P    + PPPPPT     P    P H+  PPSPP    N  P
Subjt:  PRTWIPNIPPFSP-----SPPPPFDP--RDPRTWIPHIPPFFPPPPPTFDLRDPRTWIP-HF--PPSPPQATQNQKP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein3.0e-3143.98Show/hide
Query:  AEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGH--
        AE++  SVNRTT++ GVY+LEIP VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS     C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SL+ALSY+P  KN SLCG+  
Subjt:  AEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGH--

Query:  -----KKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFS
             K  K       SKFF P+  PY FP           +P P LPPLP LPPFP FP       PSLPF  P L                   P F 
Subjt:  -----KKAKNPDPLTSSKFFLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFS

Query:  LSDPRTWIPYISPFSP
          +P TWIPY+  F P
Subjt:  LSDPRTWIPYISPFSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGAGCAGATGACCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACGAT
GCAGTCGTTTTGCCAAGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTGTGCAATGTCCCGGGTTTAAGAACTACATCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAATC
TCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCATTGAAGAAGAATGCAAGCTTATGTGGGCATAAGAAAGCAAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGTTT
TTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCTTCCCTTTCCCCTTACCTCCTTTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCTTT
TCCATATTTTCCACTCCCTACTTGTCCAAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCCTTGCCTCCTTTATTCCCTTCACCTCCTAGTCCACCTCCCCCATCTGCAC
CACCTCCGCCGCCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATATTTCTCCATTTTCTCCACCACCGCCTCCGCCATCTCCGCCACCTCCATTTAGTCTC
AGTGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTCCCCCTCCTCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCCCCATTATC
TCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAA
CATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCCAGAGACCCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCT
CCTACATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACCTGGATACCCCATTTCCCTCCATCCCCACCACAGGCCACTCAAAATCAAAAGCCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGAGCAGATGACCTTCTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCATCTGTGGATGGAATCAATTGTGTTGATGGTATGACGAT
GCAGTCGTTTTGCCAAGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTGTGCAATGTCCCGGGTTTAAGAACTACATCGGAAGAGATATCGGTCAAGTCTAAGCAAGATAATC
TCTGTATATTCAGCTTAAATGCTTTGAGTTACAGGCCATTGAAGAAGAATGCAAGCTTATGTGGGCATAAGAAAGCAAAAAATCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGTTT
TTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATTCCTTCCCTTTCCCCTTACCTCCTTTGCCACCATTCCCTTCCTTTCCTTTGCCTCCACTTCCTCCACTTCCTCCATTGCCCCCTTT
TCCATATTTTCCACTCCCTACTTGTCCAAACCCGCCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCCTTGCCTCCTTTATTCCCTTCACCTCCTAGTCCACCTCCCCCATCTGCAC
CACCTCCGCCGCCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTATATTTCTCCATTTTCTCCACCACCGCCTCCGCCATCTCCGCCACCTCCATTTAGTCTC
AGTGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCTCCATTTCCCCCTCCTCCACCTCCTGCTTTCGATCCCCGAGACCCGAGAACCTGGATTCCCCATATCCCCCCATTATC
TCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAA
CATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGATCCCAGAGACCCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCT
CCTACATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACCTGGATACCCCATTTCCCTCCATCCCCACCACAGGCCACTCAAAATCAAAAGCCCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLRTTSEEISVKSKQDNLCIFSLNALSYRPLKKNASLCGHKKAKNPDPLTSSKF
FLPFFPPYSFPFPLPPLPPFPSFPLPPLPPLPPLPPFPYFPLPTCPNPPSLPFPFPPLPPLFPSPPSPPPPSAPPPPPPFSLSDPRTWIPYISPFSPPPPPPSPPPPFSL
SDPRTWIPHVPPFPPPPPPAFDPRDPRTWIPHIPPLSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPP
PTFDLRDPRTWIPHFPPSPPQATQNQKP